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RADseq_Source_甘蔗螟虫基因组测序与标记发现数据
2026年2月8日 30 164 112
数据集概述 本数据集为甘蔗螟虫（Diatraea saccharalis）的RAD测序（限制性位点相关DNA测序）数据，包含6个个体的122.8M双端测序读段（40 Gb），通过de novo组装获得12811个SNP标记及1.7 Mb基因组序列（5289个微型重叠群），可用于功能注释、微卫星发现及进化研究，共7个文件。 文件详解 README.txt...
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芦笋转座子元件分析_河南师范大学植物基因组学数据库_2014年
2026年1月29日 30 207 71
数据集概述 本数据集为芦笋（Asparagus officinalis）基因组中转座子（TEs）的分析数据，基于男女芦笋基因组的Illumina HiSeq2000测序及生物信息学分析生成。数据包含17 Gb序列（12×覆盖度），组装为163,406个 scaffolds（总长400...
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芦笋目转座子元件低覆盖度基因组序列组装与比较分析数据_2013年
2026年1月28日 30 28 2
数据集概述 本数据集针对天门冬目（含洋葱、芦笋、龙舌兰等）11个代表性类群的低覆盖度单端Illumina数据，通过从头组装获得转座元件contig，结合单子叶重复序列参考库注释，估算核基因组中转座元件的相对比例，用于分析该类群转座元件演化模式。 文件详解 README_for_Asparagales.txt 文件格式：TXT...
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MDF_Source_微卫星DNA家族SSR标记开发方法研究数据_Schmid等人_分子生态学资源_2016
2025年12月29日 30 38 6
数据集概述 本数据集基于论文研究，针对鳞翅目物种Melanargia galathea的微卫星标记开发问题，提出处理重复侧翼序列（MDF）的新方法。通过RepARK、RepeatMasker软件及自定义R脚本确定家族类型和引物位置，重新评估新开发的nSSR标记，并探讨对其他物种的应用价值，为SSR标记开发提供优化方案。 文件详解...
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霞多丽基因组组装与注释数据集
2025年12月7日 30 90 25
数据集概述 本数据集包含霞多丽（Chardonnay）葡萄的基因组组装数据及相关注释信息，涵盖组装序列、基因预测、功能注释、重复序列、染色体定位、亲本溯源等多维度内容，为葡萄基因组学研究提供全面的数据支持。 文件详解 基因组组装文件： chardonnay_p-ctg.fasta.gz：FASTA格式，单倍体主组装序列（primary contigs）...
