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真海蕾类古生物地理学古生态学多样性及物种形成模式数据集
数据集概述 该数据集围绕真海蕾类(Eublastoidea)展开,涵盖其古生物地理学、古生态学、多样性及物种形成模式等内容。首次使用R包BioGeoBEARS的概率方法分析其宏演化趋势,更新了多样性历史认知,探讨了岩性与环境偏好、生物地理模式及物种形成机制等问题。 文件详解 归档文件:...
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三物种隔离迁移模型最大似然法实现数据集
数据集概述 该数据集是基于三物种隔离迁移模型的最大似然法实现研究数据,包含果蝇基因组数据集及补充信息文档。核心内容围绕三物种(两姐妹种+外群种)的基因流分析,通过合并与迁移的谱系过程建模,可处理基因组规模数据,用于检测物种间基因流及参数估计。 文件详解 文件名称: drosophila_datasets.tar.gz 文件格式:...
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中国东北地区松树物种遗传分化_分布区扩张与同倍体杂交物种形成数据集
数据集概述 该数据集围绕中国东北地区松树物种展开,涉及樟子松、赤松等广布种的遗传分化,以及红松、兴凯湖松等窄布种的同倍体杂交起源假说验证,包含叶绿体、线粒体DNA及核基因序列变异等分析数据。 文件详解 文件名称:Original data.txt 文件格式:TXT(.txt) 内容描述:包含叶绿体DNA(cpDNA)trnS-...
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不对称性状遗传对性状进化模型影响数据集
数据集概述 本数据集围绕不对称性状遗传对宏观进化分析的影响展开,通过个体模拟框架评估物种形成时表型跳跃的幅度,探讨其对模型选择和参数估计的作用,为性状进化研究提供数据支持。 文件详解 压缩数据文件: 文件名:data_dryad_Duchen2020_SystBiol.tar.gz 文件格式:压缩包(.tar.gz)...
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线粒体_核兼容性建模及其在物种识别中作用的数据集
数据集概述 本数据集围绕线粒体-核兼容性建模及其在物种识别中的作用展开,通过模拟种群演化,对比有无线粒体-核互作的模型场景,分析线粒体DNA(mtDNA)条形码用于物种识别的准确性及线粒体-核互作在物种形成过程中的影响。 文件详解 文件名称: Supp_SysBio.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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高等分类群系统发育的物种形成与灭绝速率估算数据集
数据集概述 本数据集围绕高等分类群系统发育的物种形成与灭绝速率估算展开,探讨了系统发育不完整情况下估算方法的准确性,强调了严格高等水平系统发育的定义,并提供了鸟类和哺乳动物系统发育的速率估算案例及模拟验证结果。 文件详解 图片文件(.tif格式): SFig1.tif:可能为研究中的第一张补充图表,用于展示数据结果或方法流程...
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羽扇豆属多大陆辐射与多样化相关因素数据集
数据集概述 本数据集围绕羽扇豆属(Leguminosae)的多大陆辐射演化及多样化相关因素展开,通过系统发育分析和多样化模型评估,探究其高净多样化速率的形成机制,识别关键演化转变与多样化速率的关联。 文件详解 该数据集包含多个补充文档和图表文件,具体说明如下: - 附录文档: -...
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杂交不亲和性遗传结构及其对二次接触基因渗入障碍影响数据集
数据集概述 本数据集围绕杂交不亲和性的遗传结构展开,探讨其在物种二次接触时对基因渗入障碍的影响。研究通过模拟全基因组数据,分析不同上位性杂交不亲和模型及杂交背景对物种完整性和基因组异质性的作用,为物种形成的基因组学研究提供支持。 文件详解 该数据集包含7个文件,具体说明如下: - 文档文件: -...
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环境依存性多样化检测模拟研究与实证数据集
数据集概述 本数据集围绕宏进化研究中环境依存性多样化检测展开,包含基于系统发育模型的模拟研究数据及鲸目、反刍亚目两个类群的实证分析资料,旨在评估环境变量对物种形成与灭绝速率的影响,支持相关模型的统计性能验证与宏观进化假说检验。 文件详解 该数据集包含11个PDF格式的补充图表文件,具体如下: - 文件类型:全部为PDF格式(.pdf) -...
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新世界夜翼目蝙蝠物种形成时间分析数据集
数据集概述 本数据集围绕新世界夜翼目蝙蝠(Chiroptera: Noctilionoidea)的物种形成时间展开研究,包含多基因位点数据、生物地理分析结果及模拟模型文件,用于评估分类单元采样、物种形成过程等因素对物种形成时间检测的影响,为新热带区生物多样性机制研究提供数据支持。 文件详解 数据文件(.xls格式):...
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桉属Odorata复合体杂交渐渗ABBA_BABA测试结果表
数据集概述 该数据集为桉属Odorata复合体系统发育研究中的Table 4,包含利用ipyrad工具进行的ABBA-BABA测试结果,用于分析不同桉属分类群间的杂交与基因渐渗情况,涉及P1、杂交种、P2分类群及Z-score、D-统计量等指标。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: P1:...
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猴面包树_Adansonia_花生物学与传粉网状进化研究数据集
数据集概述 本数据集围绕猴面包树属(Adansonia)植物展开,聚焦其花生物学特征与传粉模式的进化关系,结合网状进化理论解释形态相似性(同塑性)现象。通过靶向序列捕获技术与系统发育比较方法,分析物种间基因渐渗事件对花性状及传粉模式分化的影响,为植物进化研究提供数据支持。 文件详解 图表文件(PDF/PNG格式):...
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克里特岛西部Albinaria系统发育与物种界定表2数据集
数据集概述 本数据集为一篇关于克里特岛西部Albinaria属(腹足纲:烟管螺科)系统发育与物种界定研究中的表格数据,具体呈现了不同初级物种假说间的距离隔离检验结果,包含各假说组合的P值等核心指标。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML(.html) 内容说明: 包含表格数据,核心字段为初级物种假说(Primary...
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现代树重建方法的树形数据
数据集概述 该数据集聚焦现代系统发育树重建方法的树形特征,包含基于系统发育树形状进行宏观进化推断的相关数据,通过对比树形与物种形成、灭绝概率模型的预期,支持宏观进化过程研究。 文件详解 补充材料文档: 文件名称:Supplementary_Materials.pdf 文件格式:PDF 内容说明:可能包含研究方法、结果补充或背景信息的文档 压缩数据文件:...
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欧洲鼠尾草隐种整合分析边际似然估计与贝叶斯因子数据表
数据集概述 该数据集为欧洲鼠尾草隐种研究中的边际似然估计与贝叶斯因子数据表,围绕欧洲鼠尾草物种界定假说展开,比较将Salvia austriaca与FDPD个体归为同一物种或拆分为两个物种的模型结果,含重复分析数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: Repetition: 重复分析编号(1、2)...
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更新世海平面波动对东南亚生物多样性热点地区进化动力学影响数据集
数据集概述 本数据集围绕更新世海平面波动对东南亚生物多样性热点地区进化动力学的影响展开,包含6个淡水鱼类属的系统发育分析结果、多样化模型参数及古地理重建相关的表格与图表,为研究该区域物种形成与扩散机制提供数据支持。 文件详解 数据表格文件(.xlsx格式,共6个):...
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螳䗛目昆虫分子标记数据集
数据集概述 该数据集聚焦螳䗛目(Mantophasmatodea)昆虫的分子标记研究,包含为该目开发的微卫星位点序列、COI基因系统发育树、基因型数据表等核心数据,支持探究其种群分化、适应性进化及物种形成机制,为这一研究较少的昆虫类群提供关键遗传资源。 文件详解 README.txt:文本文档,可能包含数据集的整体说明、文件结构及使用指引...
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带化石的系统发育树拓扑结构似然性与多样化速率估计数据集
数据集概述 该数据集围绕带化石的系统发育树拓扑结构似然性计算方法展开,包含多样化速率估计相关研究内容,提供模拟数据测试结果与二叠纪-石炭纪真盘龙类实证案例数据,支持古生物多样化过程研究。 文件详解 文件名称:Appendix_print.pdf 文件格式:PDF 内容说明:可能包含研究方法的补充细节、实证案例的原始数据或分析结果附录...
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基于不完整化石记录的物种形成与灭绝贝叶斯估计数据集
数据集概述 本数据集围绕物种形成与灭绝速率的贝叶斯估计展开,基于不完整化石记录构建概率框架,允许速率随时间独立变化,结合保存与采样概率估算谱系真实寿命,通过贝叶斯算法评估速率变化,经模拟数据验证准确性,并以犀牛科为例展示应用,为整合系统发育与化石信息研究宏观演化提供支持。 文件详解 文件名称:Supplementary_Information.pdf...
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维多利亚湖慈鲷平行生态物种形成基因组学数据集
数据集概述 该数据集聚焦维多利亚湖慈鲷鱼类平行生态物种形成的基因组学研究,分析蓝背与红背姐妹种分化的遗传基础,探讨杂交对年轻物种对进化的影响,包含分化基因组区域及相关基因信息。 文件详解 文件名称:parallel_shdr_selInfo_fullListOfGenes.pdf 文件格式:PDF...



