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浙江东部景天属新种系统发育分析补充材料2
数据集概述 本数据集是关于浙江东部景天科新种Sedum simingshanense系统发育分析的补充材料,包含用于该分析的景天属序列及三个外类群的来源信息与GenBank登录号。 文件详解 文件名称: oo_1217369.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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基因组注释Maker工作流数据集
数据集概述 本数据集包含基因组注释Maker工作流的输入与输出文件,涵盖注释结果、统计摘要、可视化图表等多类型文件,为基因组注释研究提供完整数据支持。 文件详解 该数据集包含17个文件,具体说明如下: - 核心注释结果文件: - Maker_final_annotation.gff3:GFF3格式,基因组最终注释结果 -...
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质体外膜蛋白进化历史研究的比对与树文件数据集
数据集概述 该数据集包含为研究“质体外膜蛋白的进化历史——结构-序列比较”而生成的比对文件与系统发育树文件,涉及OEP40、OEP21A_B等多个质体外膜蛋白家族,支持结构与序列层面的进化分析。 文件详解 系统发育树文件(.treefile格式,共5个): OEP40_ginsi.fas.treefile:OEP40蛋白序列的系统发育树文件...
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狂犬病病毒序列亲和传播聚类客观分类数据集
数据集概述 本数据集基于亲和传播聚类(AP)算法,对狂犬病病毒(RABV)全基因组序列进行标准化分类,结合系统发育分析验证聚类结果,为RABV及其他序列比较分析提供统一透明的聚类方法支持。 文件详解 数据概览文件: 00_Defining objective clusters for rabies...
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Pelomedusa复合体分类研究支持信息数据集
数据集概述 本数据集为支持Pelomedusa复合体分类研究的信息集合,基于模式标本和历史DNA分析,涉及头盔龟(Pelomedusa subrufa)的分类修订,包括指定选模标本、新模标本,以及线粒体DNA序列分析结果,为该复合体的综合分类学修订提供依据。 文件详解 文件名称:...
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天然通道视紫红质目录数据集
数据集概述 本数据集是天然通道视紫红质(ChRs)的目录资源,包含原始列表与更新列表两个核心Excel文件,以及AlphaFold3预测的结构压缩包。数据覆盖序列信息、分类归属、功能活性等维度,为通道视紫红质的研究提供系统性参考。 文件详解 该数据集包含3个核心文件,具体说明如下: - 原始列表文件: - 文件名称:...
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婆罗洲水域蓝黄鳃棘鲈序列分析登录号数据表
数据集概述 本数据集为蓝黄鳃棘鲈(Epinephelus flavocaeruleus)相关研究的序列分析登录号表,包含多个鳃棘鲈属物种的采样地点、基因序列登录号及参考来源信息,为分子系统学研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段内容: Species: 物种名称(如Epinephelus...
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基于图的蛋白质序列短串联重复聚类方法数据集与代码
数据集概述 本数据集包含复现"基于图的序列聚类(GBSC)方法"分析所需的全部数据与代码,该方法用于识别蛋白质序列中的相似短串联重复序列。 文件详解 文件名称:gbsc-analysis-release.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip) 文件内容:包含复现GBSC方法分析所需的所有数据与代码文件,具体内部结构需解压后查看 适用场景...
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p53_REACT项目基因设计与大肠杆菌转化数据集
数据集概述 本数据集为p53-REACT项目第一步研究成果,聚焦基因亚克隆与大肠杆菌转化关键节点,通过3份PDF文件呈现基因设计图谱及相关分析结果,支撑项目目标1的研究推进。 文件详解 文件名称:Fasta pdb 13-10_p53ref_analog.pdf 文件格式:PDF...
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纤毛虫SSU_rDNA参考比对与系统发育树补充材料2021
数据集概述 该数据集是2021年发表的研究论文的补充材料,核心内容为纤毛虫SSU-rDNA的参考比对序列和系统发育树文件,用于宏条形码数据的系统发育位置分析,为相关生物信息学研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: oo_583100.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 该文档为研究论文的补充材料,包含纤毛虫SSU-...
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纤毛虫SSU_rDNA参考比对与系统发育树补充材料18
数据集概述 该数据集为纤毛虫SSU-rDNA参考比对与系统发育树研究的补充材料,包含图S3相关内容,以PDF格式呈现,支持宏条形码数据的系统发育定位分析研究。 文件详解 文件名称: oo_583117.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 补充材料18中的图S3,具体内容未提供详细字段信息 数据来源 Rajter Ľ, Dunthorn...
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纤毛虫SSU_rDNA参考比对与系统发育树补充材料17
数据集概述 本数据集为纤毛虫SSU-rDNA参考比对与系统发育树研究的补充材料17,包含1份PDF格式的图文件,用于支持宏条形码数据的系统发育位置分析。 文件详解 文件名称:oo_583116.pdf 文件格式:PDF 内容说明:该文件为研究的补充图文件(Figure S2),可能包含与纤毛虫SSU-rDNA参考比对或系统发育树相关的可视化内容...
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全球灵芝属ITS_rDNA序列元分析补充材料6
数据集概述 该数据集为全球灵芝属ITS rDNA序列元分析研究的补充材料6,包含图S2d的PDF文件,用于支持相关研究的可视化展示与结果补充。 文件详解 文件名称: oo_481989.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 该文档包含图S2d,作为《全球灵芝属ITS...
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纤毛虫SSU_rDNA参考比对与系统发育树补充材料16
数据集概述 本数据集为纤毛虫SSU-rDNA参考比对与系统发育树研究的补充材料16,包含1个PDF格式的文档,主要用于支持基于宏条形码数据的系统发育位置分析研究,提供相关补充信息。 文件详解 文件名称: oo_583115.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 该文件为研究的补充材料文档,具体内容未详细列出,推测包含与纤毛虫SSU-...
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arXiv_2009_09702预印本原始数据集
数据集概述 本数据集为arXiv:2009.09702预印本论文的原始数据,论文主题是病毒RNA中核苷酸序列的分布,聚焦生命边缘的分子序列特征研究。 文件详解 文件名称: Raw_data_for_arXiv_2009.09702.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明: 包含论文"On the verge of life:...
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海洋线虫DNA条形码参考数据集系统发育树补充材料12
数据集概述 该数据集是海洋线虫DNA条形码参考序列系统发育树分析的补充材料,包含基于MUSCLE比对的完整数据集构建的最大似然树,以图片形式呈现,为海洋线虫分类学研究提供可视化的系统发育关系数据支持。 文件详解 文件名称:oo_85405.jpg 文件格式:JPG(.jpg)...
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马达加斯加博物馆千足虫遗传距离数据集1989_1991
数据集概述 本数据集为1989至1991年马达加斯加博物馆收集的千足虫遗传距离数据,包含Zoosphaerium属等物种的遗传p距离矩阵,基于伽马分布模型计算,涉及三个密码子位置的序列分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML(.html) 内容说明:...
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Didymellaceae科分类群与GenBank登录号数据集
数据集概述 本数据集为《公民科学项目揭示Didymellaceae科(格孢腔目,座囊菌纲)高度多样性》研究中的表1数据,包含研究涉及的Didymellaceae科真菌分类群信息、菌株编号、宿主或基质、采集国家及对应基因(rpb2、tub2、ITS、LSU)的GenBank登录号。 文件详解 文件名称: 未明确提供独立文件名称(对应研究中的Table...
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Gosai_2025_CREs_Based_合成CREs_500序列实验数据
数据集概述 该数据集是Gosai等人2025年发布的51k条合成CREs数据的降采样版本,包含500条序列,用于GAME预印本的初始研究。数据集提供运行所需的容器镜像和评估数据压缩包,支持相关实验分析。 文件详解 evaluator_data.zip:ZIP格式压缩包,包含评估所需的数据集文件...
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印度拟层孔菌科两个新多孔菌物种系统发育分析NrITS序列GenBank登录号表
数据集概述 本数据集为研究印度拟层孔菌科两个新多孔菌物种的系统发育分析表格,包含构建系统发育树所用分类群的nrITS序列GenBank登录号及地理分布信息,其中新物种以粗体标注。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Taxon: 分类群名称(新物种以粗体显示) GenBank:...



