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Metschnikowia_reukaufii_Based_酵母DNA甲基化与生态位宽度研究数据
数据集概述 本数据集围绕花蜜生酵母Metschnikowia reukaufii开展，结合野外花蜜特征调查、实验室培养实验与甲基化敏感扩增多态性（MSAP）分析，验证DNA甲基化变化是否支撑该酵母利用广泛资源的能力。数据包含野外宿主植物花蜜特征、实验室糖环境对酵母甲基化模式的影响及增殖实验结果，为表观遗传调控生态位宽度的研究提供支撑。 文件详解...
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Dryad_Based_Nasonia_vitripennis_DNA甲基化对性别分配影响研究数据
数据集概述 本数据集围绕寄生蜂Nasonia vitripennis的DNA甲基化与性别分配关系展开，验证表观遗传学在行为调控中的作用。通过使用低甲基化试剂5-aza-2′-脱氧胞苷操纵雌性全基因组甲基化，探究其对适应性性别分配模式的影响，为基因组冲突理论提供数据支持。 文件详解 文件名称：DryadData.xlsx 文件格式：XLSX...
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Source_data_CNN_Model_Training_GM12878细胞沉默子增强子预测数据
数据集概述 本数据集为训练CNN模型提供源数据，用于预测GM12878细胞中的沉默子、增强子并识别超级沉默子。包含训练、验证、测试三类实验数据文件，以bed格式为主，辅以说明文档和表格文件，总计十一个文件，可支持基因调控元件预测模型的构建与验证。 文件详解 训练数据文件...
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太空探索技术公司_SpaceX_与国际空间站相关的研究成果_2014年小鼠心脏与肺组织细胞骨架结构及全基因组甲基化研究数据
数据集概述 本数据集记录2014年SpaceX-4任务中，国际空间站美国轨道段 euthanized 小鼠的心脏和肺组织样本分析结果，核心内容为细胞骨架蛋白的蛋白质与mRNA表达水平、全基因组甲基化水平及相关酶的mRNA表达情况，用于研究空间飞行对小鼠组织分子生物学特征的影响。 文件详解 文件名称：Data Set.docx 文件格式：DOCX...
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甲基化注释数据集v2
数据集概述 该数据集是甲基化注释相关的资源，包含一个压缩文件，未提供文件内容预览或说明文档，可用于获取甲基化注释相关的基础数据。 文件详解 文件名称: methyl_data_v2.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明: 压缩包内包含甲基化注释相关数据，具体字段及内容未提供预览信息 适用场景 表观遗传学研究:...
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nanoCAM_Gene_Based_基因表达与增强子调控完整数据
数据集概述 本数据集包含GM12878和K562细胞系的基因相关数据，涵盖样本基础信息、GpC可及性峰位置、多向增强子统计、基因位点与表达量化整合数据及差异表达基因列表，为基因相关研究提供支持。 文件详解 supplementarytable1_datasets_stat.xlsx：Excel格式，包含GM12878和K562细胞系重复样本的基础信息...
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bulk_ATAC_seq标准化方法基准研究数据集
数据集概述 本数据集包含用于批量ATAC-seq标准化方法基准测试的全部公开数据，以压缩文件和补充文档形式呈现，为评估不同标准化方法的性能提供了基础数据支持。 文件详解 数据压缩包： data.zip：ZIP格式压缩文件，包含基准测试使用的全部公开数据集 补充文档：...
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甲基化数据插补性能补充文件3
数据集概述 本数据集是甲基化数据插补性能研究的补充文件，聚焦不同表示方式和缺失模式下的插补效果，主要对比完整数据集（450k）与受限数据集（21k）的性能差异。 文件详解 文件名称: 12859_2020_3592_MOESM3_ESM.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 内容说明:...
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数据3604项全基因组关联研究整合分析数据集
数据集概述 本数据集是论文“Integrative analysis across 3,604 GWAS reveals multiple novel cell type-specific regulatory associations”的配套数据，包含FORGE2方法代码、论文主图、补充图及补充表，为研究细胞类型特异性调控关联提供支持。 文件详解...
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细胞表面与细胞内免疫受体激活的染色质可及性图谱ATAC_seq数据集
数据集概述 该数据集包含ATAC-seq实验产生的原始测序读数、识别的峰值及差异可及性区域，围绕细胞表面与细胞内免疫受体激活条件展开，为研究免疫激活相关的染色质可及性变化提供数据支持。 文件详解 该数据集包含11个文件，具体说明如下： - 差异可及性区域文件（.tsv格式，共4个）： -...
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人类混合谱系白血病1号易位基因_MLLT1_靶标赋能包
数据集概述 该数据集围绕MLLT1基因（又称ENL、LTG19、YEATS1）展开，包含其作为急性髓系白血病驱动因子的研究数据，涉及肽置换筛选、生物物理表征等内容，为MLLT1抑制剂研发提供支持。 文件详解 文件名称：MLLT1_TEP_datasheet_v2.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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NSD3_Short促进A549肺癌细胞迁移数据集
数据集概述 该数据集是SGC开放笔记本项目中关于组蛋白甲基转移酶NSD3的研究数据，聚焦NSD3短异构体对A549肺癌细胞迁移能力的影响，通过伤口愈合实验验证其功能相关性。 文件详解 exp025.pdf: PDF格式文档，可能包含实验方案、结果分析、图表等研究内容，记录NSD3短异构体对A549肺癌细胞迁移影响的实验细节与发现...
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玉米着丝粒反转录转座子反向剪接RNA调控染色质环数据集
数据集概述 本数据集围绕玉米着丝粒反转录转座子（CRM）产生的反向剪接RNA展开，记录其通过R环结合着丝粒并调控染色质环结构的相关实验数据，为研究着丝粒染色质组织机制提供支持。 文件详解 文件名称：S1_raw_images.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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人类SETDB1蛋白_Tudor结构域靶标赋能包数据集
数据集概述 该数据集是关于人类SETDB1蛋白Tudor结构域的靶标赋能包（TEP），SETDB1是一种参与转录沉默的H3K9甲基转移酶，其Tudor结构域与癌症发生相关，数据集旨在支持靶向该结构域的化合物发现。 文件详解 文件名称：SETDB1_TEP_datasheet_v6.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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野生狍鹿种群DNA甲基化与衰老研究数据集
数据集概述 本数据集围绕野生狍鹿种群DNA甲基化与衰老关系展开，基于法国两个种群的九十四份血液样本，通过定制甲基化芯片生成数据，构建了性别特异性表观遗传时钟，探究性别差异对生物衰老的影响，为进化生物学与生物老年学交叉研究提供支持。 文件详解 文件名称：README_Variables_information_081121.pdf 文件格式：PDF...
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单侧输尿管结扎模型RNA_m6A甲基化数据集
数据集概述 本数据集聚焦单侧输尿管结扎（UUO）小鼠模型及HK2细胞模型中的RNA m6A甲基化研究，包含假手术组与模型组的m6A测序数据及分布可视化结果，为探究m6A修饰在肾纤维化EMT过程中的作用提供数据支持。 文件详解 数据文件...
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甲状腺激素通过降低DNA甲基化和凋亡保护缺氧原代皮质神经元数据集
数据集概述 本数据集围绕甲状腺激素（TH）保护缺氧原代皮质神经元的机制展开，涉及DNA甲基化、凋亡相关分子变化及基因表达调控数据，为研究TH在创伤性脑损伤中的神经保护作用提供支持。 文件详解 README_for_supplemental figure 1.pdf：PDF格式文档，可能包含补充图1的说明信息，如实验方法、结果解释或数据背景...
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PeaKO_ChIP_seq基序分析结果数据集
数据集概述 该数据集包含论文《Motif elucidation in ChIP-seq datasets with a knockout control》中描述的JASPAR基序分析结果文件（不包含从头预测基序），涉及CentriMo HTML、CentriMo TXT和peaKO TXT三种类型文件，共40个文件，为研究ChIP-...
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人类赖氨酸脱甲基酶JMJD2D_KDM4D_靶点支持包
数据集概述 该数据集是关于人类赖氨酸脱甲基酶JMJD2D(KDM4D)的靶点支持包，包含SGC Oxford在探针项目中针对JMJD2家族成员开展的表达、纯化、结晶及片段筛选等研究信息，因未获得具有探针性质的分子，相关信息被公开。 文件详解 文件名称: JMJD2D_TEP_datasheet_v5.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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Malat1在早期造血细胞增殖与分化调控研究数据集
数据集概述 本数据集围绕长链非编码RNA Malat1在早期造血细胞中的功能展开，包含其进化保守性分析、组织表达谱、分化过程中表达变化及p53调控机制相关的实验数据与图表文件，为研究Malat1维持细胞增殖潜能的作用提供支持。 文件详解 文件名称: matree.meg：MEG格式文件，可能包含用于构建Malat1进化树的序列比对数据。 文件名称:...
