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Mudskipper_Ecomorphological_波斯湾及阿曼湾弹涂鱼生态形态适应研究数据
数据集概述 本数据集围绕波斯湾及阿曼湾三种弹涂鱼(Boleophthalmus dussumieri、Periophthalmus waltoni、Scartelaos tenuis)的生态形态适应展开研究,包含生态变量、系统发育关系、几何形态测量、体表体积比等相关数据,共12个文件,用于验证弹涂鱼体型与栖息环境的适应性关联。 文件详解...
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HIV1_protease_Based_长期进化_epistasis_分析数据_1998_2006
数据集概述 本数据集包含1998至2006年HIV-1蛋白酶序列及相关分析脚本,用于研究强选择压力下蛋白质长期进化中的 epistatic 相互作用。数据来自经治疗和未治疗患者的蛋白酶序列,支持分析残基间协同变异、选择压力对 epistasis 的影响及蛋白质适应性变化,共6个文件。 文件详解 文档文件(.txt)...
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Dysderidae_Spider_Phylogenetic_Framework_Gene_Data
数据集概述 本数据集为红恶魔蜘蛛(Dysderidae科)系统发育研究的基因数据,包含线粒体(cox1、16s、12s)和核基因(h3、28s、18s)的多基因序列,以及串联序列、分化时间估算文件和补充信息表格,覆盖104种Dysderidae蜘蛛及83种相关科物种,用于构建系统发育框架并分析多样化速率。 文件详解...
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ZooKeys_Supplementary_material_2_克罗地亚马蝇DNA条形码COI序列比对数据
数据集概述 本数据集为论文的补充材料2,包含克罗地亚马蝇(双翅目,虻科)的COI基因多序列比对数据。数据用于支持马蝇物种的DNA条形码研究,涉及形态学和分类学分析,是克罗地亚马蝇分类与鉴定的重要分子数据资源。 文件详解 文件名称:oo_649954.docx 文件格式:DOCX...
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海洋线虫DNA元编码参考数据集评估补充材料22
数据集概述 本数据集是研究论文的补充材料,内容为基于“过滤”数据集不同多序列比对的邻接(Neighbor joining)分析,评估线虫科的分辨率和单系进化枝的自举支持率,标注了多系(POL)与并系(PAR)分类单元。 文件详解 文件名称: oo_96343.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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平滑黑珊瑚ITS序列单倍型网络分析数据集
数据集概述 本数据集是对平滑黑珊瑚ITS序列的重新分析结果,基于原始研究的色谱图,通过序列组装、杂合子检测与分相、多序列比对及单倍型网络分析,验证了所有样本为同一物种的结论,包含分析过程中的原始数据与结果文件。 文件详解 压缩文件夹:Leiopathes_ITS_chromatograms.zip,ZIP格式,包含作者提供的原始色谱图文件...
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RNA_Benchmark_Based_RNA基准数据集完整数据
数据集概述 本数据集为RNA相关基准数据,包含预测、CT等关键词相关内容,由六个压缩文件组成,覆盖序列、结构、多序列比对及预测结果等数据类型,为RNA研究提供基础数据支持。 文件详解 压缩文件集(共6个,均为.zip格式): fasta.zip:可能包含RNA序列相关的FASTA格式文件...
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海洋线虫_metabarcoding_参考数据集评估补充材料15
数据集概述 该数据集为海洋线虫metabarcoding研究的补充材料,包含基于不同多序列比对的最大似然分析结果,展示线虫科的分辨率及单系类群的 bootstrap 支持度,标注多系(POL)与并系(PAR)类群。 文件详解 文件名称: oo_95695.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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深度学习RNA预测方法局限性研究数据集
数据集概述 该数据集是论文《Limits of deep-learning-based RNA prediction methods》的配套数据,包含了预测模型、多序列比对(MSAs)及原始序列。数据集以压缩包形式存储,为研究深度学习在RNA预测领域的局限性提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:RNA-benchmark.zip...
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海洋线虫DNA宏条形码参考数据集评估补充材料36
数据集概述 本数据集是《海洋线虫DNA宏条形码——基于树的分类学分配方法参考数据集评估》研究的补充材料36,包含通过邻接归并法分析不同多序列比对的“长”数据集后,海洋线虫科的分辨率与单系类群自举支持率数据。 文件详解 文件名称: oo_95718.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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蜂类总科系统发育再分析数据集
数据集概述 本数据集为蜂类总科(Apoidea)系统发育再分析研究数据,包含关键类群基因组测序数据及系统发育分析结果文件,验证了沙蜂科(Ammoplanidae)与蜜蜂的姐妹群关系,支持部分分类修订建议,为蜂类总科分类与进化研究提供数据支持。 文件详解...
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查尔斯王子山脉南极缓步动物线虫轮虫新记录补充数据集
数据集概述 本数据集是预印本论文《Unearthed from old soils: New records of Antarctic tardigrades, nematodes, and rotifers in the Prince-Charles...
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功能性多域人工跨膜转运体设计的生成景观与动力学数据集
数据集概述 该数据集包含用于设计功能性多域人工跨膜转运体的生成景观与动力学相关数据,涵盖LGL代码输入数据、分子动力学(MD)输入文件及实验结果,为相关生物分子设计研究提供数据支持。 文件详解 Experimental-Results.zip: ZIP格式压缩文件,可能包含人工跨膜转运体设计的实验结果数据 MD-inputs.zip:...
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神圣榕树_Ficus_krishnae_与孟加拉榕树_Ficus_benghalensis_形态差异及DNA条形码补充材料7
数据集概述 本数据集为研究神圣榕树(Ficus krishnae)与孟加拉榕树(Ficus benghalensis)的形态差异及DNA条形码分析的补充材料。核心内容是trnH-psbA基因序列的多序列比对图,用于支持两物种的系统学恢复研究。 文件详解 文件名称: oo_620928.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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中欧黄唇蛇蛉种群来源研究补充材料4
数据集概述 本数据集是研究中欧黄唇蛇蛉(Ornatoraphidia flavilabris)种群来源的补充材料,包含基于28S核糖体RNA基因(28S)序列的多序列比对信息,为该物种的分子系统学分析提供数据支持。 文件详解 文件名称:oo_583162.pdf 文件格式:PDF...
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Trichoderma_sexdentis多序列比对与系统发育树数据集
数据集概述 本数据集包含关于Trichoderma sexdentis的多序列比对数据和最大似然法(ML)构建的系统发育树,提供了该物种的分子系统发育分析相关信息。 文件详解 文件名称: Trichoderma sexdentis 1.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 可能包含Trichoderma...
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纤毛虫Phialina_pupula形态分子特征研究补充表S2数据集
数据集概述 本数据集为纤毛虫Phialina pupula形态分子特征研究的补充表S2,包含10组不同序列比对(如18S-lit1、ITS-lac2等)的GTR进化模型参数化结果,涵盖分类单元数、特征数、碱基频率及模型参数等信息,用于支撑该物种系统发育分析的方法学细节。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html)...
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海洋线虫宏条形码参考数据集评估补充材料43
数据集概述 本数据集为海洋线虫宏条形码研究的补充材料,聚焦于树状分类学分配方法中参考数据集的评估,包含基于不同多序列比对的最大似然分析结果,涉及线虫科的分辨率和单系分支的支持度数据。 文件详解 文件名称: oo_96346.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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农杆菌系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集为拟议新物种Agrobacterium bohemicum sp. nov.的系统发育分析提供完整数据支持,包含基因组序列、基因文件、系统发育树及相关分析文件,覆盖从原始序列到分析结果的全流程数据。 文件详解 该数据集包含82个文件,具体说明如下: - 基因组序列文件: -...
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USP_Zf_UBD蛋白多序列比对数据集
数据集概述 该数据集包含使用Molsoft的ICM-Pro软件对USP Zf-UBD蛋白与HDAC6 Zf-UBD蛋白进行多序列比对的结果,由比对数据文件和说明文档组成,为蛋白质序列分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:USP Zf-UBD multiple sequence...



