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海链藻目海陆生境转换时间推断数据集
数据集概述 该数据集围绕海链藻目(Thalassiosirales)的海陆生境转换时间展开研究,通过贝叶斯松弛分子钟方法分析不同化石校准方案下的演化时间尺度,探讨淡水谱系的起源时间及主要生境殖民事件的发生时期。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共7个):...
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草坪草及相关根际类漆斑菌属新物种系统发育研究补充材料3
数据集概述 本数据集为类漆斑菌属新物种研究的补充材料,聚焦草坪草及相关根际环境中的物种系统发育分析。数据以单一PDF文件呈现,为相关真菌分类学研究提供支持。 文件详解 文件名称: oo_295250.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件类型: 文档文件,占数据集文件总数的百分之百 内容说明:...
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KPPepGen_Based_生物信息学实验数据完整数据
数据集概述 该数据集为KPPepGen研究提供预处理的GO/菌株知识数据和肽序列数据,用于支持相关生物信息学分析。 文件详解 文件名称: source data.zip 文件格式: ZIP压缩包 (.zip) 内容说明: 包含KPPepGen研究中使用的预处理GO/菌株知识数据和肽序列数据,具体字段映射信息需解压后查看原始文件获取 适用场景...
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马达加斯加宝石蛇起源与多样性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加特有宝石蛇亚科(Pseudoxyrhophiinae)的起源与多样性展开,包含基因组捕获数据、系统发育分析文件、物种分布坐标及形态特征数据,用于探究该类群的分化速率、生物群系适应及牙齿特征关联等演化问题。 文件详解 基因组数据文件:...
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新热带豆科Zapoteca属亚属分类修订数据集
数据集概述 本数据集围绕新热带豆科Zapoteca属的亚属分类修订展开,基于核ETS、ITS及质体trnL-trnF DNA区域分析,调整了亚属划分并新增Subamazonica亚属,同时提供亚属检索表。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共3个): trnl.con.tre:质体trnL-trnF序列构建的一致树文件...
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哥斯达黎加油棕Cyclopoliarus新种分子分类采样与GenBank登录号数据集
数据集概述 本数据集为学术论文中的表格数据,记录了包括Cyclopoliarus nigelwatsoni新种在内的多个半翅目昆虫类群的分子分类采样信息及对应GenBank登录号,涉及COI、18S、28S等基因序列数据,为物种分类学研究提供分子数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容字段:...
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黑麦抗白粉病和叶锈病选育研究补充材料
数据集概述 本数据集是关于黑麦(Secale cereale L.)通过表型鉴定、目标测序和关联遗传学方法选育抗白粉病和叶锈病的研究补充材料,包含论文手稿V的配套数据文件,支持对黑麦抗病性选育的深入分析。 文件详解 该数据集包含14个文件,具体说明如下: - 数据文件 (.xlsx 格式,共8个): - Supplementary table...
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新发现瘿诱导透翅蛾物种DNA条形码序列数据集
数据集概述 本数据集为科研论文中用于分析新瘿诱导透翅蛾(Neosphecia cecidogena)与Melittiini族亲缘关系的DNA条形码序列表格数据,包含研究中所用标本的分类学信息、凭证标本编号及GenBank/BOLD数据库登录号等核心内容。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 内容说明: 表格涵盖以下字段映射...
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平胸鸟类非单系性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕平胸鸟类(如鸵鸟、鸸鹋等大型走禽)的非单系性问题展开,通过40个未被此前研究使用的核基因位点,探究其与有翅类䳍形目鸟类的系统发育关系,为验证平胸鸟类非单系性的独立证据提供支持。 文件详解 核心数据文件:...
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海洋线虫宏条形码分类学分配方法评估补充材料1
数据集概述 本数据集为海洋线虫宏条形码分类学分配方法评估的补充材料,核心包含用于分析的序列GenBank登录号及分类信息表,支持对相似性评分在比对分类学分配方法中的评估研究。 文件详解 文件名称: oo_110493.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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TreeFix基因树错误校正方法数据集
数据集概述 本数据集围绕TreeFix方法展开,该方法结合序列数据与物种树信息,用于改进基因树重建。通过最小化基于物种树的代价函数,TreeFix可找到与输入基因树“统计等效”的校正基因树,提升重建准确性。 文件详解 文件名称: supp.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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双态树演化模型与Alu逆转座应用数据集
数据集概述 本数据集围绕双态树演化模型(双生模型)展开,包含模型理论、模拟及应用于人类基因组Alu重复序列分析的相关文件,支持树演化模型研究与Alu元素演化分析。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT(.txt) 内容说明:可能包含数据集整体说明、文件结构及使用指引 文件名称:human-alu-files.zip...
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Venanus属物种DNA条形码系统发育树补充材料
数据集概述 本数据集为Venanus属物种的补充材料,包含基于Kimura 2-parameter距离构建的Neighbor-Joining系统发育树,涵盖所有有DNA条形码的已描述Venanus物种,序列数据来源于生命条形码数据系统,可用于Venanus属物种的系统发育关系研究。 文件详解 文件名称: oo_33604.pdf 文件格式: PDF...
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海洋鱼类eDNA元条形码标记与扩增子鉴别力基准测试补充材料2
数据集概述 本数据集为海洋鱼类eDNA元条形码研究的补充材料,包含使用NCBI GenBank序列进行物种鉴别力分析的额外方法学细节,支持相关基准测试研究。 文件详解 文件名称: oo_1148284.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 提供开展物种鉴别力分析的附加方法学细节,基于NCBI GenBank数据库的序列数据。 适用场景...
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海洋鱼类环境DNA宏条形码标记区分能力基准测试补充材料1
数据集概述 该数据集是海洋鱼类环境DNA宏条形码研究的补充材料,包含用于查询GenBank登录号注释描述和标题的搜索动机字符串,为标记区分能力基准测试提供辅助查询资源。 文件详解 文件名称:oo_1148283.pdf 文件格式:PDF (.pdf)...
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地中海红藻分子研究物种列表数据集
数据集概述 本数据集为地中海红藻分子研究的物种附录列表,包含用于分子分析的物种信息,涉及新生成的rbcL和COI-5P序列及GenBank下载序列,记录了物种名称、登录号、采集信息、参考文献及分子标记等内容。 文件详解 文件名称:地中海红藻分子研究物种列表 文件格式:文本列表(推测为文档或表格格式) 字段映射:...
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俄罗斯远东地区Xyrosaris属新物种描述及近缘种COI序列表
数据集概述 本数据集为表格形式,收录了GenBank和BOLD数据库中Xyrosaris属及Zelleria属物种的COI基因序列信息,包含物种名称、样本来源国家、凭证号、GenBank登录号和BOLD序列ID等核心字段,用于分子生物学研究。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML(.html) 核心字段: Name of...
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β冠状病毒刺突蛋白S1_S2弗林蛋白酶切割位点域数据集
数据集概述 本数据集围绕β冠状病毒刺突蛋白S1/S2弗林蛋白酶切割位点域展开,包含序列数据、结构域分析结果及功能位点预测输出,为研究该区域的多功能性特征提供基础数据支持。 文件详解 betacov_matching_IPR042578.fasta:FASTA格式,2022年12月4日从InterPro获取的2465条β冠状病毒刺突蛋白同源超家族重叠序列...
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Heliconius蝴蝶erato_sara类群物种分化与基因渐渗全似然基因组分析数据集
数据集概述 该数据集包含Heliconius蝴蝶erato-sara类群6个物种的多位点序列数据,用于基于多物种溯祖模型的bpp和3s分析,支撑物种分化与基因渐渗的全似然基因组研究。 文件详解 分析数据集(.tar.gz格式): bpp-block100.tar.gz:bpp分析用数据集,包含100个基因座区块的序列数据 bpp-...
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Cryptops属COI序列进化分歧估计数据表
数据集概述 该数据集为表格式数据,记录了30条Cryptops属及近缘物种COI基因序列间的进化分歧估计值,以每位点碱基差异数呈现,用于支持罗马尼亚Movile洞穴新穴居物种的分类研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段内容: 表格包含30条序列(含Scolopendra...



