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INNUENDO_Based_小肠结肠炎耶尔森氏菌wgMLST与cgMLST数据_2018
数据集概述 本数据集包含小肠结肠炎耶尔森氏菌的全基因组多位点序列分型(wgMLST)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST)方案及相关数据。数据基于2018年8月检索的252个公开基因组和79个INNUENDO项目新菌株,经INNUca组装、chewBBACA处理后形成,含元数据、基因组组装结果、MLST方案文件及等位基因谱。 文件详解 元数据文件...
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Guibemantis_Based马达加斯加安达西贝地区植食性蛙类多样性研究数据集2023
数据集概述 本数据集来自关于马达加斯加安达西贝地区植食性蛙类(Guibemantis属)的研究论文,包含该区域两栖动物热点的物种多样性、共现模式及新物种描述相关数据,涉及基因序列、测量数据、音频记录等12个文件,支持两栖动物分类与生态研究。 文件详解 序列与测量数据文件...
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Effects_genotype_substitution_rates_大肠杆菌实验进化数据
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌实验进化过程中基因型对分子替代率的影响展开,包含六个创始菌株的表型数据、基因型数据摘要及进化种群的适应性数据,可用于探究不同基因型背景下替代率的差异及潜在机制。 文件详解 README_for_Data_by_progenitor.txt 文件格式:TXT...
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phylodynamics_Based_人流感B病毒维多利亚与山形谱系系统动力学对比研究数据
数据集概述 本数据集来自人流感B病毒系统动力学对比研究,包含澳大利亚和新西兰26000余株流感B病毒流行病学样本中的900余条全基因组分析数据,揭示维多利亚和山形两个共循环谱系在传播、感染年龄及受体结合偏好等方面的差异,为流感B病毒进化与流行病学研究提供支撑,共9个文件。 文件详解 数据文件 文件名称:cases.tsv 文件格式:TSV...
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Mycobacterium_smegmatis_Based_低氧适应性代谢与碳储存组学补充数据
数据集概述 本数据集为硕士论文第二章的补充材料,包含耻垢分枝杆菌mc2155在低氧条件下的配对比较代谢组学与蛋白质组学实验数据,用于研究该专性需氧菌通过氢发酵与碳储存杂交适应低氧环境的机制,支撑论文“分枝杆菌能量饥饿适应的生物化学与生理学”的研究内容。 文件详解 Proteomics_analysis.xlsx(XLSX格式)...
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迟滞钝泥龟_Hynobius_retardatus_捕食者_猎物诱导表型可塑性的转录组分析数据
数据集概述 本数据集包含北海道 Salamander(Hynobius retardatus)在捕食者和猎物诱导下表型可塑性的转录组分析数据,涵盖转录组注释、差异表达基因(DEG)分析结果、转录组序列、基因表达计数矩阵及形态测量数据,共6个文件,用于研究该物种表型可塑性的分子机制。 文件详解...
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Computed_Embeddings_Based_CoV知识图谱RotatE实体关系嵌入数据
数据集概述 本数据集包含基于RotatE模型训练的CoV知识图谱实体与关系嵌入结果,涵盖训练、验证和测试阶段的三元组数据、实体及关系映射、嵌入向量文件、训练日志和配置文件,共10个文件,用于CoV领域知识图谱的表示学习与分析。 文件详解 核心数据文件 文件名称:kg_train.tsv、kg_valid.tsv、kg_test.tsv 文件格式:TSV...
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cartloader_Based_CosMX_SMI小鼠空间转录组分析及PMTiles转换结果
数据集概述 本数据集是cartloader公开教程的一部分,基于CosMX SMI小鼠空间转录组数据集,展示如何使用cartloader工具包将空间转录组数据转换为网络优化的空间索引PMTiles格式。包含SGE数据集及其FICTURE分析得到的空间因子相关PMTiles文件,支持下游分析、交互式网络可视化和跨平台数据共享,共69个文件。 文件详解...
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Supervised_Learning_Based_按需合成化学库可扩展监督学习评估数据集_2023
数据集概述 本数据集为论文《Evaluating scalable supervised learning for synthesize-on-demand chemical...
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CodiEsp_Based_eHealth_CLEF2020西班牙临床案例ICD10编码预测银标准数据
数据集概述 本数据集为eHealth CLEF2020任务1参与者提交的西班牙临床案例ICD10(CIE10)编码预测结果银标准,包含各子任务下不同团队的预测数据,采用UTF-8编码的纯文本文件存储,按子任务和团队分类组织,是西班牙临床文本编码任务的参考数据集。 文件详解 文件名称:silver-standard.zip 文件格式:ZIP...
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cartloader_Based_Vizgen_MERSCOPE空间转录组分析结果_PMTiles格式
数据集概述 本数据集是cartloader公开教程的成果,基于Vizgen MERSCOPE小鼠空间转录组数据集,展示如何使用cartloader工具包将空间转录组数据转换为网络优化的空间索引PMTiles格式,用于下游分析、交互式网络可视化和跨平台数据共享。包含69个文件,主要为PMTiles格式的空间数据文件及配套的信息、模型和配置文件。 文件详解...
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Bayesian_Phylogenetics_Based_藏_阿鲁纳恰尔地区跨喜马拉雅语言亲缘关系数据集
数据集概述 本数据集是论文“Bayesian phylogenetics illuminate shallower relationships in Trans-Himalayan languages in Tibet-Arunachal area”的存档数据,包含藏-阿鲁纳恰尔地区跨喜马拉雅语言的同源词标注信息,涉及Tshangla、Kho-...
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Lancet_Microbe_产colibactin大肠杆菌全球流行与癌症关联研究数据_2024
数据集概述 本数据集为《全球结直肠癌和泌尿道癌发病率地理差异与人群暴露于产colibactin大肠杆菌的关联》研究的组成部分,包含13个相关文件,涉及产colibactin大肠杆菌的基因组数据、癌症发病率统计、分析脚本及可视化结果等,用于支撑该研究的数据分析与结果呈现。 文件详解 数据文件...
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Plantago_lanceolata_Based_地理分布对本土与入侵种群化学防御影响研究数据
数据集概述 本数据集为Plantago lanceolata(长叶车前草)本土与入侵种群化学防御研究的配套数据,包含通过公共花园实验获取的植物形态、化学防御、代谢组及挥发性有机化合物等数据,涉及9个本土种群与10个入侵种群的形态特征、诱导防御化合物水平、代谢组分析结果等内容,用于探究地理分布对植物化学防御的影响。 文件详解 元数据文件...
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TweetsCOV19_Geolocation_Part1_2019_2020_社交媒体地理数据
数据集概述 本数据集为TweetsCOV19地理定位数据集第一部分,涵盖2019年10月至2020年4月期间的推特地理信息。数据以制表符分隔格式存储,包含推特ID、经纬度、国家、州、县、城市等关键字段,共1个压缩文件,可用于分析特定时期推特内容的地理分布特征。 文件详解 文件名称:TweetsCOV19Part1geolocation.zip...
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Arabidopsis_NLR_Based拟南芥NLR等位基因多样性与基因组特征关联研究中间数据
数据集概述 本数据集为论文“High allelic diversity in Arabidopsis NLRs is associated with distinct genomic...
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BioNames_Based_Darwin_Core归档科学名称与文献数据_2015_04_15
数据集概述 本数据集是2015年4月15日版本的BioNames数据库Darwin Core归档文件,包含科学名称列表和对应文献信息两个表格,通过meta.xml描述数据列结构,用于生物分类学领域的名称与文献管理。 文件详解 文件名称:bionames-dwca-2015-04-15.zip 文件格式:ZIP(归档文件)...
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Marine_microbial_succession_模型粒子定殖生命策略周转研究数据2022
数据集概述 本数据集包含论文“Turnover in life-strategies recapitulates marine microbial succession colonizing model...
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基于Pdamicornis_Cgoreaui和Dmelanogaster的交响乐团功能聚类结果数据
数据集概述 本数据集是PHILHARMONIC方法在三种生物(造礁珊瑚P. damicornis、共生藻C. goreaui、果蝇D. melanogaster)中的应用结果,包含24个文件,涉及功能聚类、基因本体映射、序列信息等内容,用于揭示非模式生物的功能关系与组织架构。 文件详解 功能聚类与网络文件...
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Pervasive_admixture_Based_Midas慈鲷厚唇形态进化与基因交流研究数据集
数据集概述 本数据集围绕Midas慈鲷物种复合体的适应性辐射展开,聚焦厚唇形态(A. labiatus)与薄唇形态(A. citrinellus)的进化关系。通过RAD-seq技术获取基因组SNP数据,结合形态学、生态学指标,探究厚唇性状的起源(独立进化或基因交流)及种群结构、基因流模式,为进化生物学中趋同进化与适应性基因渗入的区分提供数据支持。...



