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长枝存在下小树最大似然推断数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育树重建中的最大似然（ML）方法展开，聚焦长枝吸引（LBA）现象对小树（三分类群、四分类群树）重建的影响，通过分析长枝位置偏好及多长枝组合效应，揭示ML方法在进化模型中的潜在偏差与机制。 文件详解 文件名称：LBPaperVersion_sm.pdf 文件格式：PDF...
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幽灵基因渐渗检测研究数据集
数据集概述 本数据集围绕幽灵基因渐渗检测展开，通过数学分析、模拟及实证研究，对比HyDe、PhyloNet/MPL、BPP等方法的检测性能，发现全似然法BPP可利用拓扑结构与分支长度信息准确识别幽灵基因渐渗，并包含茄科Jaltomata属14种植物的实证分析数据。 文件详解 文件名称：README.md 文件格式：Markdown...
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光药理学应用_光开关共价激酶抑制剂构象景观数据集
数据集概述 本数据集为光药理学领域研究提供支持，包含光开关共价激酶抑制剂相关的分子模拟数据，覆盖不同体系的参数、拓扑结构及初始/最终构象文件，用于分析其构象景观特征。 文件详解 文件名称: Photopharmacology_in_Action.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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基因流对物种树估计影响的模拟研究数据集
数据集概述 该数据集基于模拟研究，探究基因流与不完全谱系分选对物种树估计的影响。通过模拟不同模型、规模、时间尺度和迁移率下的多基因座序列数据，分析贝叶斯方法及汇总统计方法对物种树拓扑结构、种群大小和分化时间的估计误差，为系统发育研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplemental Materials.pdf 文件格式: PDF...
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蜘蛛圆网拓扑结构空气动力学效应数据集
数据集概述 本数据集围绕蜘蛛圆网拓扑结构展开，通过理论分析与有限元模拟，研究空气动力学对蛛网风荷载及猎物撞击的影响，揭示空气阻力在减少蛛网损伤中的作用，以及蜘蛛如何利用阻力消散提升生存策略。 文件详解 文件名称: README_for_Effect_of_pre-...
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超立方体网络局域态可视化代码数据集
数据集概述 本数据集包含一段Python代码，用于生成并绘制八维超立方体投影到二维Petrie多边形的图像及其本征谱，可复现文章正文图3所示的类似图形，为研究超立方体网络中的局域态提供可视化工具支持。 文件详解 文件名称: data-files_v2.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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纳米颗粒与脂质膜相互作用的对称性和形状各向异性研究数据集
数据集概述 该数据集聚焦纳米颗粒与脂质膜的相互作用，探究纳米颗粒形状（纳米球、纳米棒）及脂质膜形态（二维平面膜、三维立方膜）的对称性对相互作用的影响，包含多种结构分析技术获取的图像数据。 文件详解...
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基于低功耗蓝牙的移动车辆智能手机定位数据集
数据集概述 本数据集基于低功耗蓝牙（BLE）技术，收集了用于移动车辆智能手机定位与追踪的数据，应用于电子收费系统（ETC）场景。包含ETC网关多波束天线的静态校准数据及不同车速下的动态测试数据，还提供定位算法基准分析。 文件详解 数据集包含两个文件，具体说明如下： - Passes and codes.zip:...
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微管结构编码力学与通信多尺度计算研究数据集
数据集概述 本数据集包含复现论文《Architecture-Encoded Mechanics and Communication in Microtubules: A Multiscale Computational Study》研究结果所需的原始数据，涉及微管结构编码力学与通信的多尺度计算研究，提供分子动力学模拟及弹性网络模型分析相关文件。...
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古生物学贝叶斯尖端定年系统发育数据集
数据集概述 该数据集围绕古生物学领域的贝叶斯尖端定年系统发育分析展开，探讨尖端定年方法对演化关系恢复的影响，以及其与地层数据的拟合度差异。通过对比尖端定年法与简约法、未定年贝叶斯法的拓扑结构差异，分析地层拟合指标（如Gap Excess Ratio、Stratigraphic Completeness...
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澳大利亚蜥蜴基因树不确定性与物种树推断数据集
数据集概述 该数据集围绕澳大利亚蜥蜴属（Cryptoblepharus）的系统发育研究，通过筛选约2000个外显子基因座，分析基因树分辨率对基于合并模型的物种树推断的影响，探索拓扑结构和支持度变化，为基因组数据的系统发育分析方法优化提供依据。 文件详解 压缩文件（.gz格式）：...
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系统发育树空间MCMC探索量化数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）方法展开，通过子树剪枝重接（SPR）度量分析其在系统发育树拓扑结构中的收敛性与有效性，验证拓扑峰值存在性及不同MCMC方法的效率。 文件详解 文件名称: sprmix_supp.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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系统发育灭绝测量偏差与二叠纪末四足动物案例研究数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育灭绝聚类测量的偏差问题展开，通过模拟研究不同进化与分析场景下的预期偏差，并以二叠纪-三叠纪大灭绝事件中的四足动物类群为案例，应用灭绝聚类的系统发育指标进行分析，包含模拟脚本、结果数据及补充图表等。 文件详解 图表文件： Figure S1.pdf、Figure S2.pdf、Figure S3.pdf、Figure...
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FTTH拓扑结构中前向与后向拉曼散射光子计数数据集
数据集概述 该数据集包含一套基于Mathematica的仿真工具，用于模拟GPON架构FTTH拓扑中的拉曼噪声。工具可设置ONT数量、分光比、光纤长度等参数，输出单光子探测器检测到的前向与后向拉曼散射光子计数率（cps），支持调整滤波、损耗及SPAD工作模式等参数。 文件详解 文件名称：Mathematica_Notebook_code.nb...
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加斯帕尔_德_科利尼三维模型数据集
数据集概述 本数据集包含一个以加斯帕尔·德·科利尼为原型的三维战士模型，以及相关预览图片。模型为三维作业创作，涵盖模型文件与多张缩略图，可用于三维模型展示与技术反馈。 文件详解 该数据集包含6个文件，具体说明如下： - 三维模型文件： -...
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伪直向同源基因频率与拓扑结构支持信息
数据集概述 本数据集为伪直向同源基因相关研究的支持信息，聚焦系统发育学中伪直向同源基因的频率、拓扑结构概率及参数空间分布，通过模型计算其对系统发育推断的影响，包含分析代码与文档文件。 文件详解 文件名称: AppendixA.Rmd 文件格式: R Markdown (.rmd) 内容说明:...
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Notiophilus属物种界定与系统发育DNA条形码研究补充材料1
数据集概述 本数据集为Notiophilus属物种界定与系统发育DNA条形码研究的补充材料，包含基于DNA条形码构建的邻接（Neighbour Joining）拓扑结构文件，用于支持相关研究的系统发育分析结果。 文件详解 文件名称: oo_305076.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 包含邻接（Neighbour...
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有颌脊椎动物系统发育与早期演化分析数据集
数据集概述 本数据集围绕有颌脊椎动物的系统发育展开，通过修正形态学数据集并采用贝叶斯尖端定年形态钟方法，探究盾皮鱼类的单系性及有颌脊椎动物的早期演化速率，为理解颌起源这一关键进化事件提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplementary_information.pdf 文件格式: PDF 内容: 补充说明文档，包含研究方法、结果细节等辅助信息...
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冰锤3D模型数据集
数据集概述 该数据集包含一个在Blender中创建的冰锤3D模型，为手绘低多边形模型，具有单张2048x2048分辨率的漫反射纹理，拓扑结构整洁（仅四边形），UV映射优化，共221个面。 文件详解 文件名称: e0eb82e8fbbc45abb9d69eb59a23e4d1.glb，文件格式: GLB，内容: 冰锤3D模型文件 文件名称:...
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海螺生物仪器三维模型数据集
数据集概述 该数据集包含以Blender雕刻模式制作的标准尺寸海螺三维模型及配套图片。海螺是用于仪式召唤的生物仪器，具有和谐发声特性，数据集提供拓扑结构规整的三维模型文件与多角度缩略图，还原真实海螺的1:1比例形态。 文件详解 数据集包含6个文件，具体说明如下： - 三维模型文件： -...
