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scTFBridge转录因子结合先验数据集
2025年12月15日 30 83 4
数据集概述 该数据集包含转录因子（TF）基序结合先验数据，是深度学习模型scTFBridge的关键组成部分，用于生成转录因子-调控元件（TF-RE）掩码矩阵，以增强模型从单细胞多组学数据中推断基因调控网络的能力。 文件详解 文件名称：TF_RE_binding_matrix.zip 文件格式：ZIP压缩文件（.zip）...
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DeepSEM_DAZZLE_RegDiffusion_Based_深度学习模型基准处理完整数据
2025年12月14日 30 168 37
数据集概述 本数据集为DeepSEM、DAZZLE和RegDiffusion相关的基准处理数据集，包含两个压缩文件，未提供具体内容描述，文件均为归档格式，便于存储与传输。 文件详解 文件名称: processed_hammond_timeseries.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明:...
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纳米材料诱导毒性关键转录调控因子优先级排序计算方法数据集
2025年12月11日 30 35 22
数据集概述 本数据集为纳米材料诱导毒性研究提供支持，包含通过整合计算方法识别关键转录调控因子的相关文件。该方法结合逆向工程、网络分析及通路富集分析，基于小鼠肺组织暴露于碳纳米管和博来霉素的转录组数据，旨在为纳米毒性早期预测提供核心调控因子依据。 文件详解 文件名称: Supplementary file...
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超大型布尔网络数据集_VLBNs
2025年12月8日 30 26 10
数据集概述 该数据集包含基于无标度随机网络结构生成的布尔网络实例，采用抑制剂主导规则设计逻辑函数。网络规模覆盖一千至十万个节点，入度最高达一千四百，以BoolNet格式存储，为布尔网络相关研究提供数据支持。 文件详解 代码与分析文件： Analysis.ipynb：Jupyter Notebook文件，用于生成网络的入度/出度散点图...
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语音特征分析与基因组学关联数据集
2025年12月8日 30 68 29
数据集概述 该数据集包含一个基于图的路径查找算法，用于检测语音链的链环基因，以连接染色体微缺失区域中的基因与FOXP2基因。数据集附带多个README文件提供使用说明，代码适用于Linux平台。 文件详解 README.pdf: PDF格式文档，包含数据集使用说明，如算法运行步骤、代码配置要求等。 profiling-genomics-code-...
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植物氮信号传导与利用动态调控网络的时间转录逻辑数据集
2025年12月8日 30 149 8
数据集概述 本数据集聚焦植物氮信号传导与利用的动态调控网络，通过时间序列转录组数据分析，揭示氮响应基因的时间转录逻辑，构建包含155个转录因子和608个靶基因的高置信度调控网络，为氮利用效率研究提供基础数据。 文件详解 原始计数数据文件: RootRawCounts.txt:...
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Project_TIN_CANN_处理分组下的聚类标记基因子集
2025年12月7日 30 79 23
数据集概述 该数据集为Project TIN CANN的研究成果，通过按处理分组筛选细胞后再按聚类分组，探究差异表达（DA）标记基因。包含CSV格式的基因数据文件、PDF格式的热图文档及JPG格式的基因计数图片，覆盖基因序列、表达量变化及统计指标等信息。 文件详解 数据文件（CSV格式，共51个）：...
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离散表型性状建模的结构化马尔可夫模型与进化发育生物学整合数据集
2025年12月5日 30 59 21
数据集概述 该数据集围绕离散表型性状建模展开，整合解剖学本体与进化发育生物学，通过结构化马尔可夫模型解决表型性状编码模糊、同源性评估等问题，为系统发育推断和比较分析提供新框架。 文件详解 文件名称：Supplementary_Appendix_Tarasov.pdf 文件格式：PDF...
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核受体CAR激动剂诱导小鼠肝脏增强子表观遗传变化数据集
2025年12月5日 30 142 31
数据集概述 本数据集记录了特定异生物质激动剂配体（TCPOBOP）激活核受体CAR后，小鼠肝脏增强子景观发生的广泛表观遗传变化，包括染色质可及性改变、组蛋白修饰及转录因子结合变化等，为研究环境化学物质对肝脏表观基因组的影响提供资源。 文件详解 表格文件（.xlsx格式，共8个）：...
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秀丽隐杆线虫的物理基因调控网络
2025年2月12日 100 56 12
来自 289 个野生型年轻成人数据集的 239,001 个调控相互作用 该数据集提供了年轻成年野生型 (WT) 秀丽隐杆线虫中高度复杂的物理基因调控网络。该数据集从 289 个数据集中收集了总共 239,001 个调控相互作用，是研究基因调控和探索这种基因活动如何在不同的生物环境条件下促进生物体功能的重要资源。我们的数据集包含 126 个基因和 495...
