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世界维管植物名录豆科检查表
2025年12月20日 30 209 1
数据集概述 该数据集是世界维管植物名录(WCVP)的豆科子集,包含经豆科系统发育工作组(LPWG)内外专家同行评审及待审的豆科植物名称,遵循国际藻类、真菌和植物命名法规,体现全球植物分类学共识。 文件详解 数据集包含一个压缩文件,具体说明如下: - 文件名称:wcvp_fabaceae_DwCA.zip - 文件格式:ZIP(.zip) -...
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GREML_MTG2_Based_统计遗传学MTG2方法完整数据
2025年12月20日 30 138 37
数据集概述 本数据集提供CORE GREML方法的MTG2代码及说明文档,CORE GREML是一种广义基因组限制最大似然方法,用于线性混合模型中估计随机效应间的协方差,放松经典模型的独立性假设。 文件详解 README(无格式):说明文档,指引参考MTG2手册第15章和示例12,提示解压相关压缩文件,提供项目网站链接...
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金鼹与獭鼩系统发育史序列进化模型数据集
2025年12月20日 30 111 44
数据集概述 该数据集呈现了金鼹与獭鼩系统发育史研究中,通过PartitionFinder2识别的序列进化模型及其对应分子分区数据。包含BIC(贝叶斯信息准则)和AICc(校正赤池信息准则)两种评估标准下的模型参数、位点数量及分区名称,为分子系统发育分析提供模型选择依据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html)...
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溶剂化DNA电子密度训练结构数据库
2025年12月20日 30 103 10
数据集概述 本数据集包含用于训练e3nn机器学习电子密度模型的溶剂化DNA结构数据,支撑《用等变神经网络预测准确的从头算DNA电子密度》研究,提供详细的结构与密度数据及说明文档。 文件详解 核心数据文件(92个.pkl格式文件): 命名示例:sp-300-fw.pkl、4-ca-bp1-200-fw.pkl、5-gt-bs1-200-fw.pkl等...
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海洋真核生物DNA测序生物多样性调查补充材料7
2025年12月20日 30 200 98
数据集概述 本数据集是海洋真核生物DNA测序生物多样性调查研究的补充材料,包含脊索动物门分类组成的Krona可视化图表,用于辅助展示生物多样性调查结果。 文件详解 文件名称: oo_1375194.png 文件格式: PNG (.png) 文件内容: 展示脊索动物门(Phylum...
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南美水禽血寄生虫线粒体DNA细胞色素b单倍型对比表
2025年12月20日 30 25 15
数据集概述 该数据集为一张对比表,记录了南美水禽物种中检测到的血寄生虫线粒体DNA细胞色素b单倍型,并与MalAvi和GenBank数据库中已识别的寄生虫谱系进行比对,包含单倍型名称、宿主物种及匹配的谱系和一致性得分等信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Haplotype:...
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脊椎动物同义密码子使用模式与翻译选择研究补充材料
2025年12月20日 30 50 48
数据集概述 本数据集为脊椎动物同义密码子使用模式研究的补充材料,聚焦突变、遗传漂变与翻译选择的相互作用,验证翻译选择在脊椎动物中的普遍性,包含研究相关的补充表格和图表。 文件详解 文件名称:SupplementaryTable1.pdf 文件格式:PDF 内容:研究相关的补充表格1,可能包含同义密码子使用模式的统计数据或分析结果...
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智人通路GPML文件数据集
2025年12月20日 30 97 60
数据集概述 该数据集包含WikiPathways.org月度发布的智人(Homo sapiens)通路相关GPML文件,以压缩包形式存储,覆盖多个时间点的数据版本。 文件详解 文件名称:包含4个.zip格式压缩包,命名格式为wikipathways-YYYYMMDD-gpml-...
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帝王柽柳猴亚种分类地位研究表6数据集
2025年12月20日 30 163 92
数据集概述 本数据集为研究帝王柽柳猴亚种分类地位的相关表格数据,核心内容是展示用于分子系统发育分析的最佳分区方案和替代模型,涉及细胞色素b和16S基因片段的不同子集划分及对应模型。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明: 表格包含三行数据,每行对应一个基因子集,字段包括: Subset: 子集编号...
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斑马鱼通路GPML文件数据集2025
2025年12月20日 30 23 2
数据集概述 该数据集包含WikiPathways.org平台2025年发布的斑马鱼(Danio rerio)通路相关GPML格式文件,以月度数据形式提供,所有文件均为压缩包格式,无目录层级划分。 文件详解 文件名称:wikipathways-20250810-gpml-...
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Huber等人2018年幽灵蛛科系统发育补充材料1
2025年12月20日 30 18 3
数据集概述 本数据集为Huber等人2018年发表的幽灵蛛科系统发育研究的补充材料1,包含基于IQ-TREE推断的全类群最大似然树(Figure S1),补充展示了所有外类群及支持值信息。 文件详解 文件名称: oo_234249.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 内容说明: 包含图S1(Maximum-likelihood tree of...
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肝硬化治疗关键炎症靶点的单细胞与遗传分析原始数据集
2025年12月20日 30 60 51
数据集概述 该数据集为肝硬化治疗相关的单细胞与遗传分析原始数据,聚焦关键炎症靶点研究,包含文档、表格及PDF格式的三类文件,为探究肝硬化炎症机制及治疗靶点提供基础数据支持。 文件详解 Additional file 2.docx:文档格式文件,可能包含研究相关的补充说明、实验方案或背景资料 Additional file...
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Gulisija_et_al_2025_Based_能量平衡性状协方差分析代码完整数据
2025年12月20日 30 192 85
数据集概述 本数据集为Gulisija等人2025年研究的配套代码资源,研究核心是通过揭示能量平衡性状间的协方差模式,发现新的肥胖相关基因。数据集包含代码实现管道及相关说明文档,支持研究复现与扩展分析。 文件详解 文件名称: README.html 文件格式: HTML 内容说明: 研究代码管道的说明文档,由Ana...
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蛾类属系统发育基因组学信息缺失模式与多基因座桑格数据比较数据集
2025年12月20日 30 198 103
数据集概述 本数据集围绕蛾类属Eupithecia的系统发育研究展开,对比了RAD测序与多基因座桑格测序的系统发育假设,分析了RAD数据的基因座缺失效应及其对系统发育信息(SNP、PIS)的影响,包含研究相关的代码、补充材料和图表文件。 文件详解 该数据集包含三类文件,具体说明如下: - 代码文件(.r格式): -...
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植物U_box蛋白进化与功能研究补充数据集2022
2025年12月20日 30 135 3
数据集概述 本数据集是Trenner等2022年关于植物U-box蛋白(PUBs)进化与功能研究的补充资料,包含支持主研究的方法、参考文献、系统发育树图表、序列比对文件及序列信息表,为植物U-box蛋白的进化分析提供完整数据支撑。 文件详解...
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海洋微生物真核生物遗传变异性与生物多样性评估数据集
2025年12月19日 30 37 9
数据集概述 本数据集包含与研究论文配套的扩增子序列数据,聚焦海洋微生物真核生物(如多囊虫放射虫)的遗传变异性,旨在为相关生物多样性评估研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: File descriptions.pdf,文件格式: PDF 内容: 提供各fasta文件的详细内容说明 文件名称: all-passing-...
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基于网格计算的GARLI_2_0系统发育分析网关数据集
2025年12月19日 30 10 6
数据集概述 本数据集围绕molecularevolution.org网关展开,该网关是支持高通量最大似然法系统发育分析的公开平台,核心功能为GARLI 2.0网络服务,可通过网格计算并行执行大量系统发育树搜索或自举搜索,包含相关补充文档与图表。 文件详解 文档与图表文件:...
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Martyn_et_al_2025_GAME_API_Based_基因变异效应评估完整数据
2025年12月19日 30 46 19
数据集概述 本数据集是Martyn等人2025年发布的、用于GAME API的变体效应评估工具。核心功能是对THP-1单核细胞和Jurkat T细胞的序列进行表达预测,计算变异序列与参考序列的log2倍变化,并通过皮尔逊相关系数评估预测性能。 文件详解 数据集包含两个主要文件,具体说明如下: - Engreitz_evaluator.sif:...
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动质体目与双鞭毛虫线粒体定位A家族DNA聚合酶的噬菌体起源数据集
2025年12月19日 30 114 75
数据集概述 本数据集围绕动质体目与双鞭毛虫中线粒体定位的A家族DNA聚合酶(PolIBCD+)起源展开,通过生物信息学分析揭示其与特定噬菌体DNA聚合酶的进化关联,为线粒体DNA复制修复机制的非垂直遗传研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: AGV_PolIBCD_DNAP_ali.nxs 文件格式: NEXUS (.nxs) 内容说明:...
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vcferr_SNP基因分型错误模拟框架复现文档与代码
2025年12月19日 30 166 164
数据集概述 本数据集包含用于复现"vcferr: SNP基因分型错误模拟框架的开发、验证与应用"研究分析的文档与代码文件,提供了从模拟框架构建到结果验证的完整复现资源。 文件详解 文档文件: README.pdf:PDF格式,提供复现研究分析的分步说明 代码与配置文件: Snakefile:无扩展名,可能为工作流管理文件...



