数据集 - 海数据

Zenodo_Source_二肽和三肽通透酶A运输循环构象景观数据

2026年1月27日 30 82 24

数据集概述本数据集聚焦二肽和三肽通透酶A（DtpA）的运输循环构象景观，包含六个相关文件，涵盖说明文档与多个压缩文件，为研究DtpA在运输过程中的结构变化提供数据支持。文件详解说明文档文件名称：Readme_zenodo.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：包含数据集相关说明信息，具体内容需参考文档内详情。压缩文件...

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SOAPy_Based空间架构动态与通信分析Python包数据集v2

2026年2月6日 0 109 86

数据集概述本数据集包含SOAPy Python包的数据集和源代码，SOAPy用于解析空间架构、动态变化及通信机制。数据集以单个压缩文件形式提供，无目录结构，未区分训练测试、数据标签或原始处理数据，主要用于支持该Python包的相关分析工作。文件详解文件名称：SOAPy-1.0.1_source_code.zip 文件格式：ZIP...

数据5_HT1AR_电场调控分子机制模拟数据

2026年2月1日 30 112 28

数据集概述本数据集包含5-HT1AR受体非活性/活性状态结构及电场调控分子机制研究的分子动力学（MD）模拟输入文件与参数文件，涉及APO、SRO、EF0.01、EF0.03四个系统，共4个压缩文件，用于支持该受体结构与功能调控机制的相关研究。文件详解 APO系统模拟文件文件名称：APO.zip 文件格式：ZIP...

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自然通讯期刊研究源数据文件_单链核酸酶家族研究数据集

2026年1月31日 30 54 37

数据集概述本数据集是Nature Communications论文《Chenal et al. Discovery of the Widespread Site-Specific Single-Stranded Nuclease Family...

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KGE_HGEN_Based基因调控网络多组学关联数据集

2026年1月30日 30 106 34

数据集概述本数据集为KGE-HGEN基因调控网络数据集，包含9个文件，涵盖基因、转录因子（TF）、微小核糖核酸（miRna）的序列信息及相互作用关系数据，可用于生物信息学领域的基因调控网络分析研究。文件详解序列信息文件文件名称：target_id_seq.xlsx、mirna_id_seq.xlsx、tf_id_seq.xlsx...

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MD_Source_线粒体钙转运蛋白NCLX结构与机制模拟数据

2026年1月28日 30 142 21

数据集概述本数据集为论文《Structure and mechanism of the mitochondrial calcium transporter NCLX》配套的分子动力学模拟数据，包含1个压缩文件，无分层目录结构，未区分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据。文件详解文件名称：NCLX-Sims.zip 文件格式：ZIP...

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York_Gospels_Based_千年生物信息羊皮纸研究数据

2026年1月28日 30 162 59

数据集概述本数据集包含约克福音书（York Minster Ms. Add. 1）中的生物信息数据，该福音书是少数幸存的征服前福音书之一。通过扩展非侵入性摩擦电采样技术eZooMS并结合DNA分析，首次记录了这部具有千年历史手稿中积累的丰富生物信息，涵盖材料选择、抄本构建及使用历史等方面。数据集包含1个文件。文件详解...

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COVID_19_Based_临床试验蛋白质与化学品提及列表数据

2026年1月28日 0 54 11

数据集概述本数据集记录了COVID-19相关临床试验中提及的所有蛋白质、化学品和基因名称，数据来源于ClinicalTrials.gov数据库。通过自动化文本挖掘管道动态标注数据库条目，随数据库更新同步更新，为解锁临床试验数据中的潜在见解提供支持。文件详解文件名称：trial.json 文件格式：JSON...

基于离子与DNA相互作用的尿嘧啶DNA糖基化酶活性影响研究数据_2025

2026年1月21日 30 69 46

数据集概述本数据集为论文“Ion-DNA Interactions as a Key Determinant of Uracil DNA Glycosylase Activity: Modeled with a Statistical Framework for Biphasic Systems”配套的实验数据，记录了离子-...

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FABind_PDBbind2020_Based_蛋白质_配体结合预处理数据集

2026年1月19日 30 198 91

数据集概述本数据集是为论文“FABind: Fast and Accurate Protein-Ligand Binding”预处理的PDBbind2020数据集，包含用于蛋白质-配体结合结构预测的预处理数据，支持药物发现领域的相关研究。数据集以压缩包形式提供，便于使用。文件详解文件名称：pdbbind2020.zip 文件格式：ZIP...

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Electron_Laser_Desorbed_气相胸苷和鸟嘌呤电子相互作用研究数据_待发表

2026年1月17日 30 14 13

数据集概述本数据集为论文“Electron interaction with laser desorbed thymidine and guanine in the gas phase”的关联数据，聚焦气相中激光解吸的胸苷和鸟嘌呤与电子的相互作用研究，包含实验相关的结构化数据，仅涉及一个文件。文件详解 Data File.xlsx...

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Hamaker_Constants_Based_水相生物纳米相互作用常数计算数据

2026年1月15日 30 45 26

数据集概述本数据集基于力场参数计算水相环境中生物纳米相互作用的Hamaker常数，涵盖金属、金属氧化物、碳材料三类物质与自身、水及生物分子（氨基酸、脂质片段）的相互作用常数，包含约50种金属、20种金属氧化物及50种碳材料的相关数据。文件详解文件名称：Hamaker.xlsx 文件格式：XLSX...

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MD_Based_Asymmetric_CorA门控机制分子动力学模拟再现数据集

2026年1月15日 30 185 17

数据集概述本数据集用于再现论文中描述的分子动力学（MD）模拟研究，核心内容为Asymmetric CorA门控机制相关的模型与参数文件，仅包含一个压缩文件，可支持相关模拟实验的复现与验证。文件详解文件名称：send.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：为压缩文件，包含论文“An asymmetric CorA gating mechanism...

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Phytoplankton_Daphnia_浮游植物生物分子与水蚤营养关系研究数据

2026年1月15日 30 63 9

数据集概述本数据集围绕浮游植物生物分子对次级生产的重要性展开，分析了17种浮游植物单培养物的生化组成（脂肪酸、固醇、氨基酸等），评估了其对水蚤生长繁殖的营养质量，并结合900余个湖泊的浮游植物野外数据，探究蓝藻主导群落中水蚤的固醇限制情况。数据集含4个文件，覆盖浮游植物生化数据、水蚤生长繁殖数据及对应说明文档。文件详解说明文档类...

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Bombus_Pollen_metabarcoding_DNA提取协议补充材料2023

2026年1月13日 30 177 17

数据集概述本数据集为论文补充材料2，包含用于熊蜂（Bombus）花粉DNA提取的实验协议文档。数据支持博物馆标本与近期采集熊蜂的花粉宏条形码研究，涉及DNA提取的标准化操作流程，为相关生物分子实验提供方法参考。文件详解文件名称：oo_873417.docx 文件格式：DOCX...

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Client_scaffold_Source_Data_模型凝聚物中蛋白质聚集抑制研究数据

2026年1月13日 30 62 2

数据集概述本数据集是论文“Client-scaffold interactions suppress aggregation of a client protein in model condensates”的源数据，包含分子间NOE脉冲程序及相关数据集，用于研究模型凝聚物中Client-...

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亨丁廷开放实验室笔记本_0_1_甲醛条件下_Q23_DNA_结构实验数据_20171124

2026年1月12日 30 122 29

数据集概述本数据集来自Huntingtin结构功能开放实验室项目，记录了2017年11月24日开展的、在0-1%戊二醛条件下Huntingtin Q23与DNA相关的实验内容。数据集仅包含一个文档文件，聚焦于特定实验条件下的生物样本结构研究。文件详解文件名称：Huntingtin Q23 +- DNA Grafix in 0-1 percent...

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ALICE_MD_Simulations_生物分子慢构象转变增强采样与机器学习数据_2024

2026年1月12日 30 128 12

数据集概述本数据集为论文“Enhanced Sampling of Biomolecular Slow Conformational Transitions Using Adaptive Sampling and Machine Learning”的官方实现，包含Ala2和Ala10两个示例的MD模拟轨迹（PLUMED COLVAR文件）、自动化模拟...

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ECSBM_2022_Based_F_Actin二级结构纳米化学表征原始数据_Spectrochimica特刊

2025年12月28日 30 78 18

数据集概述本数据集为Spectrochimica Acta期刊ECSBM 2022特刊的论文原始数据，包含基于中红外光诱导力显微镜（PiF-IR）技术对F-Actin二级蛋白质结构的纳米尺度化学表征数据，涉及交联F-肌动蛋白、单纤维F-肌动蛋白、小鼠肝组织等样本的光谱及结构分析原始数据，共六个文件。文件详解压缩文件（Archive files）...