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倍半萜合酶模拟数据
2026年2月15日 30 11 0
数据集概述 本数据集包含论文“Active site loop engineering abolishes water capture in hydroxylating sesquiterpene...
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Computational_Models_脂质形状抗菌肽膜活性研究数据集
2026年1月22日 30 69 57
数据集概述 本数据集包含Marcin Makowski等作者在《Lipid shape as a membrane activity modulator of a model antimicrobial peptide》一文中使用的分析脚本和计算模型，用于研究脂质形状对模型抗菌肽膜活性的调控作用，以压缩包形式提供。 文件详解...
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MD_Files_Based_FSHR和LHCGR糖蛋白受体SDPC脂质轨迹数据
2026年1月15日 30 137 6
数据集概述 本数据集包含糖蛋白受体FSHR和LHCGR在SDPC脂质中轨迹的MD文件，涵盖PSF、PDB结构文件及charmm36m力场参数文件。PDB与trr文件仅保留主链原子，所有帧均已拟合至跨膜结构域。数据集共15个文件，支持生物分子动力学模拟相关研究。 文件详解 结构文件包...
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ALICE_MD_Simulations_生物分子慢构象转变增强采样与机器学习数据_2024
2026年1月12日 30 139 39
数据集概述 本数据集为论文“Enhanced Sampling of Biomolecular Slow Conformational Transitions Using Adaptive Sampling and Machine Learning”的官方实现，包含Ala2和Ala10两个示例的MD模拟轨迹（PLUMED COLVAR文件）、自动化模拟...
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GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据
2026年1月9日 30 33 8
数据集概述 本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...
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MD_Snapshots_Based_ɑ_hairpinin支架工程构建钾离子通道阻滞剂分子动力学模拟数据
2025年12月30日 30 205 85
数据集概述 本数据集包含25组Kv1.3通道与Tk-hefu肽类似物复合物的分子动力学（MD）模拟快照，记录模拟初始（0ns）和结束（110ns）状态，同时附带2份通道与肽间分子间相互作用分析的Excel表格，为钾离子通道阻滞剂研究提供结构动态数据支持。 文件详解 压缩文件（Kv1.3_Tk-hefu-deriv_complexes.zip）...
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Mlynsky等人JCTCRNA力场研究原始数据集2025
2025年12月22日 30 192 76
数据集概述 该数据集为Mlynsky等人2025年发表于《Journal of Chemical Theory and Computation》的RNA力场研究论文配套原始数据，包含论文原文、补充信息及相关数据集，为RNA力场模拟研究提供数据支撑。 文件详解 Mlynsky-et-al_JCTC2025.pdf：PDF格式，研究论文原文...
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msemblator化合物库与评分模型数据集
2025年12月12日 30 178 62
数据集概述 该数据集包含msemblator工具所使用的化合物库及基于机器学习的评分模型，下载后需按对应GitHub仓库的目录结构组织文件，为相关研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：msemblator_library.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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REACH粗粒化生物分子模拟程序数据集
2025年11月28日 30 110 57
数据集概述 本数据集包含REACH（Realistic Extension Algorithm via Covariance Hessian）程序包，该程序用于残基尺度的粗粒化生物分子模拟，基于原子分子动力学模拟的方差-协方差矩阵计算力常数，整合二级结构依赖性。 文件详解 文件名称：aeda_v1_0.tar.gz 文件格式：GZ压缩包（.gz）...
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生物分子流体动力学模拟中Rotne_Prager_Yamakawa张量的并行自适应快速多极子方法数据集
2025年11月26日 30 147 130
数据集概述 该数据集包含RPYFMM软件包相关文件，RPYFMM用于生物分子流体动力学模拟中Rotne-Prager-Yamakawa（RPY）张量相互作用的高效计算，通过分解RPY张量为拉普拉斯相互作用组合，结合自适应快速多极子方法实现，支持共享与分布式内存计算，可高效处理大规模分子系统。 文件详解 文件名称: hpx.tar.gz 文件格式:...
