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Microtubule_Based_微管中心线自动拼接补充数据
2026年1月28日 30 25 0
数据集概述 本数据集为论文“Automated stitching of microtubule centerlines across serial electron tomograms”的补充数据，包含实现微管中心线跨断层扫描切片自动拼接的计算方法相关数据，支持复现论文图表及测试算法参数，涉及线虫、非洲爪蟾、布氏锥虫样本的微管结构分析。 文件详解...
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ELEPHANT_Based_夏威夷帕虾再生腿共聚焦成像演示数据集
2026年1月27日 30 40 6
数据集概述 本数据集是ELEPHANT跟踪软件的演示数据，采用BigDataViewer格式（HDF5/XML）存储。内容为甲壳动物夏威夷帕虾再生腿的活体成像短子集，通过蔡司LSM 800共聚焦显微镜采集，用于展示软件功能，数据集包含2个文件。 文件详解 文件名称：elephant-demo.h5 文件格式：H5...
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OW940_C_elegans_欧洲衰老所线虫行为实验记录数据2014
2026年1月26日 30 83 82
数据集概述 本数据集是秀丽隐杆线虫（C.elegans）行为数据库的一部分，记录了OW940菌株（携带zgIs128[P(dat-1)::alpha-Synuclein::YFP]转基因）成年第十二天的行为实验数据。实验于2014年4月16日在荷兰欧洲衰老生物学研究所开展，包含线虫运动的视频追踪数据、特征提取结果及相关元信息，总计三个文件。 文件详解...
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smFISH_Source_code_单分子荧光原位杂交分析源代码与探针列表数据
2026年1月19日 30 142 106
数据集概述 本数据集包含单分子荧光原位杂交（smFISH）图像分析的MATLAB源代码压缩包，以及本研究中使用的smiFISH探针列表Excel文件，共计两个文件。数据可用于smFISH实验的图像分析复现及探针设计参考。 文件详解 文件名称：summary probe smFISH.xlsx 文件格式：XLSX...
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Cell_bleach_Based细胞漂白样本Active_Contours插件演示数据
2026年1月13日 30 131 30
数据集概述 本数据集为演示Icy软件Active Contours插件跟踪能力的细胞漂白样本，包含XML元数据、参数文件及TIFF图像三类文件，总计3份，用于生物图像处理场景下的细胞跟踪功能验证。 文件详解 细胞漂白XML文件 文件名称：cell_bleach.xml 文件格式：XML...
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Parhyale_Based_帕海拉三维图像分割完整数据
2025年12月24日 30 151 15
数据集概述 该数据集包含帕海拉（Parhyale）的三维分割数据，涵盖五十个时间点的三维图像及六个离散时间点的手动标注，修复了此前版本标签ID重复问题，确保每个实例ID唯一。 文件详解 README.pdf：PDF格式文档，提供数据集详细说明...
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大肠杆菌类核降噪数据集_DeepBacs
2025年12月23日 30 32 14
数据集概述 该数据集为大肠杆菌类核降噪数据集，包含相关文档、配置文件及图片文件，用于支持生物图像降噪研究，提供了数据说明、配置信息及可视化资源。 文件详解 README.md: Markdown格式文档，包含数据集相关说明文档，文档详情可参考链接。 rdf.yaml: YAML格式配置文件，可能为数据集的元数据配置文件。 default.png:...
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植物样本共聚焦显微镜图像栈数据集_ImageJ_SurfCut测试数据
2025年12月23日 30 1 0
数据集概述 本数据集包含拟南芥35S::GFP-MBD光下生长下胚轴、碘化丙啶染色子叶 pavement 细胞及茎尖分生组织的共聚焦图像栈，是Fiji宏SurfCut的测试数据集，用于从3D共聚焦图像栈中提取细胞轮廓。 文件详解 该数据集以压缩包形式存储，具体说明如下： - 文件名称: Data.zip - 文件格式: ZIP压缩包 -...
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细胞迁移与ERK信号数据集
2025年12月22日 30 40 19
数据集概述 该数据集包含ERK信号表达细胞与细胞核染色的追踪视频数据，通过TrackMate工具追踪后使用MATLAB进行分析，记录了细胞迁移过程中的运动轨迹、连接关系及相关量化指标，为细胞生物学研究提供支持。 文件详解 数据文件（CSV格式）： CellMigration_WithERK-...
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IMC示例数据提取的单细胞信息数据集
2025年12月22日 30 56 41
数据集概述 本数据集包含从IMC（成像质谱流式）示例数据中提取的单细胞信息，涉及空间实验对象、图像及分割掩码等数据文件，支持IMC数据分析流程，为相关生物图像处理与分析提供数据基础。 文件详解 gated_cells.zip: .zip格式，包含存储手动门控细胞的SpatialExperiment对象，基于细胞表达值获取真实细胞表型标签。...
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三维荧光显微镜图像示例训练与测试数据集
2025年12月21日 30 18 10
数据集概述 本数据集是为ZeroCostDL4Mic平台中的Noise2Void（3D）深度学习去噪算法提供的示例训练与测试数据。数据内容为三维荧光显微镜图像，具体拍摄对象是瞬时表达Lifeact-RFP的A2780卵巢癌细胞。该数据集以其标准化的格式和详细的采集参数，为使用者提供了一个即用型案例，用于学习、测试和验证基于深度学习的显微图像去噪技术。...
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单层细胞迁移量化样本数据集
2025年12月20日 30 123 117
数据集概述 本数据集为《Bioimage Data Analysis Workflows - Advanced Components and Methods》Neubias教科书“单层细胞迁移量化”章节配套的样本数据，用于辅助相关分析方法的实践与应用。 文件详解 文件名称: SampleDataset.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip）...
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细胞迁移掩码图像跟踪教程数据集
2025年12月19日 30 146 100
数据集概述 本数据集为教程数据，用于演示如何使用掩码图像通过TrackMate工具进行细胞迁移跟踪。包含大小两种演示影片及相关辅助文件，帮助用户掌握该跟踪方法。 文件详解 文件名称: Cancer_migration_masks.xml，文件格式: XML，可能为跟踪配置或元数据文件 文件名称: A_Cancer_migration_masks-...
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尼康转盘共聚焦显微镜示例数据集
2025年12月19日 30 201 163
数据集概述 本数据集为尼康转盘共聚焦显微镜（Nikon CrestOptics X-Light V3）的示例数据，包含ND采集模式下的.nd2和.ome.tif图像文件，以及通过JOBS脚本获取的多组WellPlate图像数据，整体以压缩包形式存储并附带说明文档。 文件详解...
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枯草芽孢杆菌荧光分割数据集DeepBacs
2025年12月18日 30 21 16
数据集概述 该数据集包含表达FtsZ-GFP的枯草芽孢杆菌活细胞的训练与测试图像，用于细胞分割任务。数据以配对的荧光图像和人工标注分割掩码形式呈现，支持相关模型训练与验证。 文件详解 文件名称: DeepBacs_Data_Segmentation_B.subtilis_FtsZ_dataset.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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TrackMate_ExTrack模块模拟轨迹数据集
2025年12月16日 30 21 1
数据集概述 该数据集包含用于TrackMate-ExTrack模块教程的模拟轨迹数据，TrackMate-ExTrack是ExTrack软件的Java移植版本。数据以XML、JSON和PNG格式存储，为相关软件教程提供基础模拟数据支持。 文件详解 该数据集包含四个文件，具体说明如下： - XML文件（共两个）: - simulated-tracks-...
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秀丽隐杆线虫胚胎早期发育追踪数据集
2025年12月15日 30 88 65
数据集概述 该数据集包含秀丽隐杆线虫胚胎早期发育的追踪数据，核心为最大强度投影（MIP）形式的短视频（至第二次细胞分裂），附带有TrackMate分析结果及截图，可用于演示该工具的掩膜检测器功能。 文件详解 CelegansEarly_MIP.tif：TIFF格式文件，为秀丽隐杆线虫胚胎早期发育的最大强度投影（MIP）短视频，用于可视化胚胎发育过程...
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拟南芥胚珠分割训练数据集
2025年12月15日 30 50 42
数据集概述 该数据集为拟南芥胚珠细胞分割任务提供训练数据，基于plantseg工具设计，包含图像、说明文档及配置文件三类文件，支持相关生物图像分割模型的训练与优化。 文件详解 文件名称：plantseg_cover.jpg 文件格式：JPG（.jpg） 内容说明：可能为数据集的封面或示例图像，属于栅格图像文件...
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细菌类核分割的DATA和CARE模型数据集
2025年12月13日 30 130 95
数据集概述 本数据集包含用于细菌类核分割的DATA数据和CARE模型，数据基于快速生长的大肠杆菌固定样本的PAINT图像，涉及不同抗生素处理及时间条件，模型为2D CARE模型，适用于SMLM数据分割任务。 文件详解...
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LED颜色梯度植物光质响应快速表型筛选工具数据集
2025年12月13日 30 30 4
数据集概述 该数据集包含论文《LED颜色梯度作为植物光质响应快速表型筛选的新工具》中使用的原始数据、图像分析脚本及说明文档。核心内容围绕LED光质梯度对植物表型影响的实验数据展开，支持对植物光质响应表型特征的量化分析，为相关农业技术研究提供数据基础。 文件详解 README.pdf：PDF格式，论文摘要及背景说明文档...
