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标签: 系统发育学

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  • Callogorgia_深海八放珊瑚生态位分化研究数据集

    2026年2月7日 30 134 103

    数据集概述 本数据集围绕墨西哥湾大陆坡Callogorgia属深海八放珊瑚的生态位分化展开，整合了系统发育学与生态位模型（ENM）分析所需的分子、形态及环境数据，用于探究物种间生态位差异及演化机制，包含3个相关文件。 文件详解 文件名称：Quattrini_etal_MSH_COI_28S_alignment.fas 文件格式：FAS...
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  • SuperFine_Source_超级树估计方法_数据

    2026年1月31日 30 109 86

    数据集概述 本数据集包含SuperFine方法的相关数据，SuperFine是一种用于提高超级树方法准确性和可扩展性的元方法。数据集涉及超级树估计的模拟和实证研究，旨在解决大型物种树估计的计算挑战，包含2个文件，文件类型为.txt和.zip。 文件详解...
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  • 教育生活书桌_2010年野外博物馆系统发育学课程档案数据

    2026年1月30日 30 70 2

    数据集概述 本数据集是EduLifeDesks档案中2010年菲尔德博物馆系统发育学课程的相关数据，包含1个XML格式文件，无目录结构，文件类型单一。数据未划分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理集，主要为课程相关的XML元数据。 文件详解 文件名称：192.xml 文件格式：XML...
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  • Euryarchaeota_未培养分支系统发育生态学研究数据

    2026年1月29日 30 196 7

    数据集概述 本数据集围绕广古菌门（Euryarchaeota）中广泛分布但未培养的分支展开系统发育生态学研究，整合了Lake Dagow Sediment（LDS）和Rice Cluster-V（RC-V）两个嗜温分支的16S rRNA基因序列，分析其环境分布、进化历史及遗传多样性，揭示环境适应性与生态分化的关系。 文件详解...
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  • 鳞目动物系统发育学研究_基于分子分支长度与分子近缘性状的数据分析

    2026年1月27日 30 111 74

    数据集概述 本数据集围绕有鳞目系统发育学研究展开，针对McMahan等人2015年提出的观点进行回应，探讨分子数据对有鳞目系统发育拓扑结构的支持情况，涉及分子分支长度、分子近裔性状等核心内容，包含4个相关文件。 文件详解 File_S2_PBW_trees_and_output.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：包含PBW相关的树文件及输出数据...
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  • Ooceraea_hainingensis_进化分歧估计补充数据2024

    2026年1月22日 30 19 12

    数据集概述 本数据集是论文《Ooceraea hainingensis sp. nov.: A new Chinese Ooceraea species...》的补充材料1，包含序列间进化分歧的估计结果，用于支持新物种Ooceraea hainingensis的分类学研究，分析其与近缘物种的分子进化关系，数据集含1个文件。 文件详解...
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  • Bite_of_the_cats_类猫食肉动物下颌骨形态与力学性能研究数据

    2026年1月21日 30 137 35

    数据集概述 本数据集包含现存及灭绝猫科、猎猫科和巴博剑齿虎科等类猫食肉动物的下颌骨形态与力学性能数据。通过几何形态测量量化下颌骨大小与形状，结合有限元模型分析力学性能（冯·米塞斯应力、表面牵引力），并构建包含35种现存、59种灭绝物种的系统发育树，用于研究形态分化、异速生长及模块 covariation 与力学性能的关联。 文件详解...
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  • Supermatrix_Supertree_多基因座系统发育学方法比较原始数据

    2026年1月19日 30 73 55

    数据集概述 本数据集是针对多基因座系统发育学研究中超矩阵与超树方法的比较分析原始数据。通过对二十个多基因座数据集采用超树（SuperFine、SuperTriplets）和超矩阵（TNT启发式搜索）方法，比较其简约性准则下的树长和计算时间，验证超树方法在实际生物数据中的适用性，为系统发育学研究方法选择提供依据。 文件详解...
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  • Amazonian_ecotone_Steatogenys_elegans电鱼生态分化研究数据

    2026年1月12日 30 36 34

    数据集概述 本数据集围绕亚马逊生态过渡带的电鱼Steatogenys elegans展开，聚焦生态物种形成研究，结合系统发育学、基因组扫描和种群遗传学方法，分析地理与环境选择对生物多样性的驱动作用，揭示两种近缘同域谱系在不同水化学性质河流间的复制性生态介导物种形成过程。 文件详解 压缩文件（archive_files）...
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  • Phylogenetics_Supertree_Methods_贝叶斯与最大似然超级树方法实现测试数据

    2026年1月2日 30 163 129

    数据集概述 本数据集为系统发育学领域的超级树方法研究数据，包含贝叶斯与最大似然超级树方法的实现与测试相关内容，涉及假设案例与实证研究（如食肉动物和后生动物数据集），用于比较不同超级树方法的性能，验证方法无形状或大小偏差。 文件详解 压缩文件 文件名称：Carnivore_and_Metazoan_datasets.zip 文件格式：ZIP...
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  • Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据

    2025年12月28日 30 14 6

    数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开，提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据，包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等，可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式：TAR（压缩包）...
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  • 赫氏蛇与吉氏蛇形态测量学及鳞片计数数据集

    2025年12月23日 30 177 121

    数据集概述 本数据集为赫氏蛇（Hebius khasiensis）和吉氏蛇（Hebius gilhodesi comb. nov.）的形态测量学及鳞片计数数据，包含物种凭证号、采集地点、性别、体长等关键指标，支持蛇类分类学研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段内容:...
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  • 非洲兽总目与近蹄类支持性多基因数据集

    2025年12月22日 30 73 45

    数据集概述 本数据集为多基因序列数据集，包含十一个真兽亚纲目的线粒体基因（12S rRNA、tRNA缬氨酸等四个）与核基因（水通道蛋白、A2AB等四个）序列，划分二十一个基因分区，用于探究非洲兽总目与近蹄类的系统发育关系及基因数据异质性影响。 文件详解 文件名称: Springer.htm 文件格式: HTML (.htm) 内容说明:...
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  • 系统发育分析最优进化速率研究数据集

    2025年12月22日 30 145 120

    数据集概述 本数据集基于模拟实验探究系统发育分析中的最优进化速率，涉及不同树大小、终端数量、树形状等场景，分析最优速率与位点间、谱系间速率变异的关系，评估多种实验设计方法预测基因效用的性能，为系统发育研究的基因选择提供依据。 文件详解 文件名称: Supplementary_File_3_Influence_NbBp.pdf 文件格式: PDF...
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  • 未排序同源性与基因座及物种树数据集

    2025年12月21日 30 58 9

    数据集概述 该数据集围绕进化生物学中的同源性概念展开，聚焦分子层面的直系同源、旁系同源与异源同源分类，探讨测序技术发展下多基因座及多物种个体数据对基因与生物历史区分的影响。 文件详解 文件名称：Supplementary Material.pdf 文件格式：PDF...
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  • 泰国下白垩统Kinnareemimus_khonkaenensis系统发育位置研究附表S1

    2025年12月21日 30 130 51

    数据集概述 本数据集为泰国下白垩统兽脚亚目恐龙Kinnareemimus khonkaenensis系统发育位置研究的附表S1，记录了该物种及相关类群的胫骨长度/宽度比值数据，支持恐龙分类与演化分析。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML (.html) 内容说明：表格包含分类单元（Taxa）、胫骨长度（Tibia...
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  • 网状系统发育与基因树联合估计数据集

    2025年12月21日 30 27 21

    数据集概述 本数据集围绕多物种网络溯祖模型（MSNC）展开，包含联合估计网状系统发育、基因树、分化时间及种群大小的贝叶斯方法研究内容，通过模拟数据与实证数据验证方法有效性，强调同时考虑网状进化与不完全谱系分选的重要性。 文件详解 文件名称: WenNakhleh-SI.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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  • RAD_seq系统发育学缺失数据误解研究数据集_开花植物案例

    2025年12月20日 30 100 20

    数据集概述 本数据集围绕RAD-seq系统发育学中的缺失数据误解展开，分析10个RAD-seq数据集的缺失数据分布，通过模拟区分突变干扰与测序覆盖度导致的缺失模式，并以开花植物荚蒾属为实证案例，探讨测序深度对系统发育信息的影响，提供实用建议。 文件详解 数据文件：...
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  • SpeciesTopoTestR物种树似然检验补充图表

    2025年12月20日 30 190 150

    数据集概述 本数据集为R包SpeciesTopoTestR的补充图表，聚焦基于似然法的物种树拓扑检验。该R包针对多物种溯祖模型下的物种树推断，开发了类似基因树检验的似然框架，通过模拟与实证数据演示其应用、局限性及注意事项，图表用于辅助说明相关方法与结果。 文件详解 文件名称: _SupplementaryFigures_1Oct2020a.pdf...
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  • 系统发育学透明度协议数据集

    2025年12月20日 30 161 137

    数据集概述 本数据集围绕系统发育学领域的透明度协议展开，旨在通过预先规划和记录分析流程，提升研究的可重复性与透明度。包含多个附录文件，为推动系统发育学透明研究实践提供参考工具与讨论基础。 文件详解 文件名称：Appendix_2.md，文件格式：Markdown，可能包含协议模板说明或案例补充内容...
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