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伪直向同源基因频率与拓扑结构支持信息
2025年12月9日 30 207 28
数据集概述 本数据集为伪直向同源基因相关研究的支持信息，聚焦系统发育学中伪直向同源基因的频率、拓扑结构概率及参数空间分布，通过模型计算其对系统发育推断的影响，包含分析代码与文档文件。 文件详解 文件名称: AppendixA.Rmd 文件格式: R Markdown (.rmd) 内容说明:...
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Notosuchia类群热代谢机制古组织学推断数据集
2025年12月8日 30 153 78
数据集概述 本数据集围绕Notosuchia类群的热代谢机制展开古组织学研究，通过改进前人方法（扩大现生四足动物样本量、优化系统发育分析模型），重新推断该类群的热生理状态，核心聚焦5个物种的恒温/变温属性验证。 文件详解 文件名称: README_file.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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系统发育似然库数据集
2025年12月7日 30 99 1
数据集概述 该数据集围绕系统发育似然库（PLL）展开，PLL是一个高度优化的应用程序编程接口，用于开发基于似然的系统发育推断和后分析软件，提供数据结构与函数支持相关计算任务。 文件详解 文件名称: suppl.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件类型: 文档文件，占数据集文件总数的百分之百 适用场景 系统发育软件研发:...
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系统发育组学超级矩阵推断的系统发育平台感知数据结构附录
2025年12月7日 30 201 131
数据集概述 本数据集是关于系统发育组学研究的附录文件，内容围绕“系统发育平台感知（PTA）数据结构”展开，该结构用于在分区模型下高效分析超级矩阵，可利用数据缺失情况下的（部分）平台和诱导分区树节省计算时间，提升系统发育推断效率。 文件详解 文件名称: Online-Appendix-Chernomor_et_al.pdf 文件格式: PDF...
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北美小棕蝠亚种进化谱系研究数据集
2025年12月7日 30 27 8
数据集概述 该数据集围绕北美小棕蝠（Myotis lucifugus）亚种的进化关系展开，通过基因流分析验证其是否为独立进化谱系，为蝙蝠分类学和种间基因交流研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Dryad_SuppMaterial.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含研究的补充材料，可能涉及实验方法、数据分析流程、图表及结果解释等详细信息。...
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离散形态学数据贝叶斯分析的同塑性分区策略数据集
2025年12月7日 30 172 129
数据集概述 该数据集围绕离散形态学数据的贝叶斯分析展开，验证了基于同塑性得分的分区策略相较于其他方法的优势，包含研究中使用的原始数据、补充表格、图表及说明文档，为系统发育推断方法优化提供支持。 文件详解 数据文件（6个.xlsx格式）： Supplementary_Material_Table_S1.xlsx：补充材料表1，包含基础分析数据...
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新腹足类_软体动物门_腹足纲_系统发育研究表1数据集
2025年12月6日 30 63 61
数据集概述 本数据集为新腹足类系统发育研究中的表1数据，记录了基于线粒体基因组的IQ-tree分析结果，包含不同分区和模型下的对数似然值、自由参数数量、AICc及BIC评分，用于评估系统发育分析模型的拟合效果。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML（.html） 字段映射: IQ-TREE...
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贝叶斯系统发育推断中简约性引导树提议加速收敛数据集
2025年12月6日 30 2 1
数据集概述 本数据集包含贝叶斯系统发育推断研究的补充资料，聚焦通过简约性引导树提议加速MCMC算法收敛的方法。研究对比了新方法与标准树移动方法在模拟及六个实证数据集上的性能，验证了其在加速收敛和改善混合性方面的优势。 文件详解 文件名称: ParsTreePropSuppl.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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陆生植物起源研究数据集
2025年12月6日 30 191 112
数据集概述 本数据集围绕陆生植物起源研究展开，聚焦基因序列污染与缺失数据对系统发育推断的影响，通过验证数据质量揭示陆生植物与轮藻目、鞘毛藻目类群的亲缘关系，包含研究相关的文档、序列文件及进化树数据。 文件详解 文档文件（PDF格式）： FigS3-54-Final.pdf、FigS55-109-Final.pdf：研究相关的补充图表文件...
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多序列比对自动化过滤方法对单基因系统发育推断影响数据集
2025年12月6日 30 130 52
数据集概述 该数据集围绕多序列比对（MSA）自动化过滤方法对单基因系统发育推断的影响展开，包含实证与模拟数据，用于对比过滤与未过滤比对在系统发育树重建中的表现，为相关方法评估提供支持。 文件详解 文件名称: rawData.zip，文件格式: ZIP，包含原始数据的压缩包，具体内容需解压后查看 文件名称:...
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离散表型性状建模的结构化马尔可夫模型与进化发育生物学整合数据集
2025年12月5日 30 156 140
数据集概述 该数据集围绕离散表型性状建模展开，整合解剖学本体与进化发育生物学，通过结构化马尔可夫模型解决表型性状编码模糊、同源性评估等问题，为系统发育推断和比较分析提供新框架。 文件详解 文件名称：Supplementary_Appendix_Tarasov.pdf 文件格式：PDF...
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白唇竹叶青复合体新种及近缘种形态特征比较表
2025年12月5日 30 52 25
数据集概述 本数据集为“缅甸中南部白唇竹叶青复合体新种”研究中的形态特征比较表，包含新种Trimeresurus uetzi与白唇竹叶青-北方竹叶青复合体近缘种的形态学指标对比，覆盖体色、鳞片特征、量度数据及分布信息等核心内容。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML...
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植物系统发育推断公共序列数据局限性分析数据集
2025年12月5日 30 185 71
数据集概述 本数据集围绕植物系统发育推断中公共序列数据的局限性展开，包含基于GenBank数据构建的陆生植物属级系统发育树及相关分析文件，通过系统发育数据决定性理论探讨数据稀疏性对推断的限制，为理解公共数据库在植物系统学研究中的应用价值提供支持。 文件详解 系统发育树文件：...
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菲律宾鼩鼱快速近期辐射进化的实证与模拟系统基因组学数据集
2025年12月4日 30 145 103
数据集概述 本数据集围绕菲律宾鼩鼱属（Crocidura）8个物种的快速近期辐射进化问题，通过实证与模拟系统基因组学方法开展研究。包含超保守元件、线粒体基因组测序数据及不同方法的系统发育分析结果，揭示了快速辐射进化中构建分叉树的挑战。 文件详解 附录文件： Online Appendix 2 - Locus...
