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PDBQT_1_0_0_Based_分子结构研究完整数据
2025年12月20日 30 188 170
数据集概述 该数据集为PDBQT v1.0.0版本，包含62个文件，无目录层级。核心文件为58个.pdbqt格式的分子结构文件，涵盖多种化合物，同时包含图片、文档及应用程序文件，为分子结构相关研究提供数据支持。 文件详解 核心分子结构文件（.pdbqt格式，共58个）：...
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GNN_Trained_Models_Based_图神经网络模型训练完整数据
2025年12月20日 30 195 119
数据集概述 本数据集包含在特定目标和数据集上训练的图神经网络（GNN）模型文件，涉及Sun等人数据集（目标为AR、ER、ED）和Tox21数据集（基于旧版本训练），使用Chemprp 1.x工具训练，以压缩包形式存储。 文件详解 文件名称: dmpnn_trained_models.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明:...
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PocketVina分子对接研究数据集
2025年12月19日 30 21 14
数据集概述 本数据集为PocketVina分子对接框架相关研究资料，包含研究结果压缩文件及TargetDock-AI基准数据集。PocketVina可实现高效物理有效对接，数据集支持相关算法性能验证与分析，助力药物发现领域研究。 文件详解...
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BAZ2B溴结构域Zenobia片段库筛选PanDDA分析数据集
2025年12月19日 30 93 27
数据集概述 本数据集为BAZ2B溴结构域通过X射线晶体学筛选Zenobia片段库的PanDDA分析结果，包含分析说明文档、元数据、模型、数据及参考文件，支持对该筛选实验的结果解读与复现。 文件详解 文件名称: README.txt 文件格式: .txt 内容说明:...
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经典半乳糖血症药物发现靶点赋能包_GALT_GALK1
2025年12月18日 30 172 113
数据集概述 本数据集是针对经典半乳糖血症（一种罕见的半乳糖代谢紊乱疾病，目前缺乏疾病转化疗法）的药物发现计划靶点赋能包（TEP）。包含蛋白质试剂、生物物理分析方法及结构信息，支持理解GALT酶缺陷的分子机制，以及探索通过干预上游GALK1酶（底物减少策略）缓解GALT缺陷的化学起点。 文件详解 文件名称:...
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急性低氧应激缓解化合物识别的表型推动平台数据集
2025年12月10日 30 69 30
数据集概述 该数据集围绕急性低氧应激缓解的化合物识别展开，基于"表型推动"平台的研究成果。平台通过高内涵表型筛选，识别可加速细胞向低氧适应状态转变的化合物，涉及mTOR/PI3K或BET抑制策略，相关化合物可提升缺血样应激下肝细胞存活及心肌细胞低氧应激修复能力。 文件详解 文件名称: README.md，文件格式: Markdown，内容:...
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PharmAlchemy项目元数据与本体标准化数据集
2025年12月10日 30 165 38
数据集概述 该数据集为PharmAlchemy项目提供支持，聚焦于将DisGeNET、STRING、DrugBank和SIDER等公共生物医学数据库整合并标准化为统一格式，助力基因-疾病-药物-副作用关系的发现，支持生物医学和药物发现研究的互操作性数据分析流程。 文件详解...
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多药耐药细菌新药靶点生物信息学识别补充数据集
2025年12月15日 30 34 31
数据集概述 本数据集为多药耐药细菌新药靶点生物信息学识别研究的补充数据，包含两个核心部分：基于CD-HIT工具聚类的高序列相似性蛋白质簇数据，以及各蛋白质簇的序列比对文件，为耐药细菌靶点研究提供支撑。 文件详解 Dataset D1.csv: CSV格式文件，包含CD-...
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肉桂生物活性化合物对葡萄糖调节蛋白的机制效应数据集
2025年12月15日 30 191 56
数据集概述 本数据集支持关于肉桂生物活性化合物与葡萄糖调节蛋白（GLP-1R、DPP-4、SGLT2）相互作用的研究，包含分子对接分数、结合构象、分子动力学模拟轨迹及相关分析数据，用于探索肉桂来源抗糖尿病化合物的作用机制。 文件详解 文件名称: MDS_GLP1R.zip，文件格式: ZIP压缩包，包含与GLP-1R蛋白相关的分子动力学模拟数据...
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整合蛋白质_配体相互作用数据库_IPLID
2025年12月13日 30 81 57
数据集概述 该数据集为整合蛋白质-配体相互作用数据库（IPLID），整合了BindingDB、ChEMBL等多源数据，包含蛋白质-配体相互作用数据（数值或二进制标签）、配体结构相似性（Tanimoto系数）、蛋白质序列相似性等信息，支持机器学习项目检索与基准测试开发。 文件详解 数据压缩包文件：...
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心脏离子通道小分子活性综合数据集
2025年12月12日 30 107 1
数据集概述 该数据集是一个面向药物发现领域的综合数据库，涵盖hERG、Nav1.5和Cav1.2三种心脏离子通道的小分子活性数据。数据以压缩文件形式组织，每个离子通道目标包含开发集（含训练/验证子集）及两个不同结构相似度阈值的外部测试集，为离子通道毒性预测模型的构建与评估提供标准化数据支持。 文件详解 压缩文件: dataset.rar:...
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Molecular_Docking_Based_COVID_19药物分子对接完整数据
2025年12月8日 30 200 169
数据集概述 该数据集围绕2019冠状病毒病（COVID-19）的药物发现展开，核心内容为分子对接相关数据。数据集以压缩包形式存储，未提供文件内容预览，整体结构简洁，未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理等数据拆分。 文件详解 文件名称: Molecular docking.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明:...
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ePharmaLib结构基药效团库数据集
2025年12月8日 30 147 134
数据集概述 该数据集是ePharmaLib库，包含一万五千一百四十八个能量优化的结构基药效团（e-pharmacophores），每个药效团含3至8个特征，用于反向药效团筛选研究药物多药理学特性，支持药物发现研究。 文件详解 ePharmaLib_PHASE.zip：ZIP格式压缩文件，为Schrödinger’s PHASE程序设计的药效团库...
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相对自由能计算基准数据集2018
2025年12月6日 30 78 71
数据集概述 本数据集为相对自由能计算提供基准，包含CDK8、c-Met、Eg5、Hif2a、PFKFB3、SHP2、SYK、TNKS2等靶点相关的基准数据，由Merck KGaA研究人员创建，用于相关计算方法的验证与评估。 文件详解 文件名称：fep-benchmark-v3.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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BAZ2B与Zenobia片段库筛选的PanDDA分析交互式摘要数据集
2025年12月6日 30 77 62
数据集概述 本数据集为BAZ2B蛋白与Zenobia片段库筛选的PanDDA分析结果，提供交互式摘要页面。包含结构数据文件、图像文件、网页文件及相关脚本，支持对分子筛选结果的可视化与交互分析。 文件详解 交互式网页文件： 0_index.html：HTML格式，为数据集的交互式摘要入口页面，可点击访问完整分析内容...
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药物发现中激酶组选择性自由能计算Wee1案例研究数据集
2025年12月5日 30 12 8
数据集概述 该数据集包含论文《Harnessing free energy calculations for kinome-wide selectivity in drug discovery campaigns with a Wee1 case...
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DrugProt语料库_BioCreative_VII_Track1_药物化学物质_蛋白质相互作用文本挖掘数据集
2025年12月4日 30 187 17
数据集概述 该数据集是BioCreative VII Track 1任务的金标准标注语料库，包含训练集、开发集、测试集及背景集，涵盖PubMed摘要、人工标注的化学物质/基因实体及化学-蛋白质关系，用于推动药物发现、精准医疗相关的文本挖掘系统开发。 文件详解 训练集文件夹...
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人类Sigma_2受体分子动力学模拟输入文件与代表性结构数据集
2025年12月4日 30 89 30
数据集概述 本数据集包含人类Sigma-2受体（σ₂R）同源二聚体的分子动力学模拟输入文件，以及从卷积变分自动编码器（CVAE）潜在空间中提取的代表性构象，为研究该受体的结构特性提供数据支持。 文件详解 文件名称: S2R_CPX.tar.bz2 文件格式: bz2压缩包 内容说明: 人类Sigma-2受体复合物相关的分子动力学模拟输入文件压缩包...
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纳米圆盘脂质对膜蛋白片段筛选结果影响数据集
2025年12月4日 30 103 25
数据集概述 本数据集围绕纳米圆盘（ND）脂质类型对膜蛋白片段筛选结果的影响展开，包含不同磷脂酰胆碱脂质构成的ND中CYP3A4蛋白的筛选数据、图表及分析文件，为研究膜环境对药物发现实验结果的作用提供数据支持。 文件详解 数据文件（.xlsx格式，共8个）： Figure S4 Fluconazole...
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低成本抗分枝杆菌药物发现支持数据集
2025年12月4日 30 117 32
数据集概述 本数据集为低成本抗分枝杆菌药物发现研究提供支持，包含通过基因工程大肠杆菌（表达结核分枝杆菌ALR酶）进行高通量药物筛选、贝那普利活性表征及多靶点菌株构建与筛选的相关数据，涵盖生长测量、生化实验等生物学数据及分析脚本。 文件详解 数据文件： Source data.zip：压缩文件，包含原始数据（CSV格式），可导入为Pandas...
