找到17个数据集

标签: GFF格式

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  • Drosophila_Based_果蝇生殖器官快速分化基因研究数据

    2026年1月27日 30 56 49

    数据集概述 本数据集围绕果蝇 simulans 与 mauritiana 雄性外生殖器快速分化的遗传基础展开,包含通过QTL定位、基因渗入映射及RNAi筛选获得的基因数据,涉及染色体3L/3R上的关键区域及Wnt信号通路组分、msl3等候选基因,为研究雄性生殖性状进化的遗传机制提供支撑。 文件详解 文件名称:gff.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • Mvit_genome_Based_无脊椎动物基因组序列与注释数据集

    2026年1月25日 30 58 36

    数据集概述 本数据集包含Mvit物种(推测为某种无脊椎动物)的基因组相关数据,共7个文件,涵盖基因组序列、注释信息、比较分析结果等内容,支持基因组结构分析、功能基因挖掘及进化研究。 文件详解 基因组序列文件...
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  • Asian_arowana_Based_三种变种染色体水平基因组组装与基因注释数据

    2026年1月18日 30 164 131

    数据集概述 本数据集包含亚洲龙鱼(Scleropages formosus)三种常见变种(金色、红色、绿色)的基因组序列与注释数据。其中金色龙鱼为染色体水平组装,红、绿龙鱼为草图组装,分别注释了22016、21256、21524个蛋白编码基因,旨在解决其生物学研究与育种种质缺乏参考基因组的问题。 文件详解...
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  • Brassica_napus_Based_甘蓝型油菜两个近缘品种基因组组装与比较数据

    2026年1月18日 30 189 186

    数据集概述 本数据集包含甘蓝型油菜品种Tapidor的从头基因组组装,以及与改良组装的Darmor-bzh品种的比较数据。两者采用相同注释方法以实现基因内容对比,识别了各品种特有基因并区分组装注释差异导致的伪影,共含17个归档文件。 文件详解 基因组组装与注释文件...
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  • Camptotheca_De_novo_喜树基因组组装与抗癌化合物生物合成研究数据

    2026年1月15日 30 170 62

    数据集概述 本数据集包含喜树(Camptotheca acuminata)的高质量从头基因组组装及相关注释数据,喜树是抗癌化合物喜树碱的天然来源。数据涵盖基因组序列、基因模型、功能注释、BUSCO评估结果、基因表达矩阵及系统发育树等,共15个文件,为喜树碱生物合成途径研究及药物开发提供基础。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023

    2026年1月13日 30 111 46

    数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy(碳水化合物活性酶)预测结果,涉及相关菌株(如Pcopri、Btheta、Buniformis)的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码,共47个文件,用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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  • 破伤风梭菌_Clostridium_perfringens_1_2_丙二醇细胞壁研究数据

    2026年1月13日 30 54 9

    数据集概述 本数据集围绕产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)对1,2-丙二醇的利用及其与细胞包膜的相互作用展开,包含微阵列杂交后的荧光强度数据,以及实验所用的组装注释基因组文件,为研究该菌的代谢机制与细胞包膜相互作用提供基础数据支持。 文件详解 Clostridium_MM2023_5.gff 文件格式:GFF...
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  • Epigenetic_modifications_Based_病原真菌自发突变率影响研究数据

    2026年1月12日 30 202 131

    数据集概述 本数据集围绕病原真菌表观遗传修饰对自发突变率的影响展开,包含实验数据、统计结果、基因组注释等11个文件。数据支撑研究中关于组蛋白修饰(H3K27me3、H3K9me3)、转座子胞嘧啶甲基化及温度胁迫对突变率作用的结论,为解析真菌基因组变异机制提供结构化数据。 文件详解 实验与统计数据文件(.xlsx格式,共6个)...
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  • Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据

    2025年12月30日 30 71 66

    数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件(TE)注释及质量控制数据,用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件,共27个文件,是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Tuber_melanosporum_Genome_Resequencing_SNP_Survey_Data

    2025年12月29日 30 118 57

    数据集概述 本数据集为佩里戈尔黑松露(Tuber melanosporum Vittad.)的全基因组单核苷酸多态性(SNP)调查数据,通过Illumina高通量重测序技术对6个地理来源的菌株基因组进行测序分析,识别出442326个核心基因组SNP,包含重复序列及编码区的SNP分布,为该真菌的群体遗传学和基因组学研究提供资源。 文件详解...
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  • 烟草天蛾基因组从头组装数据集

    2025年12月24日 30 9 5

    数据集概述 本数据集提供烟草天蛾(Manduca sexta)的新参考基因组JHU_Msex_v1.0,通过现代技术从头组装,提升连续性、准确性和完整性。基因组大小470 Mb,连续性为原版本的约25倍,scaffold N50超14 Mb,注释含25,256个基因,可供公开使用。 文件详解...
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  • 五桠果属五桠果高质量基因组组装数据集

    2025年12月23日 0 64 41

    数据集概述 本数据集提供五桠果(Dillenia turbinata)的染色体级高质量基因组组装及注释结果。五桠果属于五桠果目,是理解被子植物演化的关键类群。基因组组装长度约7.24亿碱基对,BUSCO完整性达97%,包含36,967个蛋白编码基因模型,为比较与演化基因组学研究提供核心资源。 文件详解 文件名称: README.md,格式:...
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  • 江户明樱蛤染色体水平基因组组装数据集

    2025年12月18日 30 181 119

    数据集概述 本数据集为江户明樱蛤的染色体水平基因组组装数据,包含基因组序列、基因家族注释、系统发育树等信息,旨在揭示其血红素生物合成的分子基础,为贝类遗传育种与群体遗传学研究提供基因组资源。 文件详解 该数据集包含多个文件,具体说明如下: - 文档与说明文件: - readme.txt:文本格式,提供数据集标题、作者信息等基础说明 -...
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  • 黄病毒科系统发育研究补充材料数据集

    2025年12月12日 30 36 13

    数据集概述 本数据集为黄病毒科系统发育研究的补充材料,包含基因组数据、基因注释、系统发育树分析结果及相关配置文件等,支持对黄病毒科进化关系的深入研究,提供标准化的实验参数与可视化结果。 文件详解 表格文件(CSV格式): tableS1.csv:基因组数据,含ID、终端名称、属分类及注释信息...
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  • 中国春小麦端粒到端粒全基因组数据集CS_IAAS_v1_1

    2025年12月9日 30 88 19

    数据集概述 本数据集提供了六倍体小麦品种中国春的端粒到端粒(T2T)无间隙参考基因组CS-IAAS_v1.1,包含145.1亿碱基对,覆盖21个着丝粒和42个端粒,为研究小麦基因组演化、转录组及蛋白质组提供基础数据。 文件详解 基因组序列文件: CS-IAAS_v1.1.zip:压缩格式,包含中国春小麦全基因组序列数据 基因注释文件: CS-...
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  • 曼氏血吸虫组装染色体与ZW性别决定系统进化数据集

    2025年12月9日 30 27 25

    数据集概述 该数据集提供曼氏血吸虫组装染色体数据,其基因组约380MB,含7对常染色体和2条性染色体。数据基于Wellcome Sanger研究所等机构的测序项目,经多轮组装优化,助力研究其ZW性别决定系统的进化机制。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 基因组序列与注释文件: -...
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  • Earl_Grey转座元件注释分析管道补充文件数据集

    2025年12月6日 30 193 180

    数据集概述 本数据集是Earl Grey转座元件注释分析管道的配套补充文件,包含参数选择说明、模拟基因组配置、参考注释、补充表格及结果图表等7个文件,为该自动化分析工具的使用与验证提供支持。 文件详解 文件名称: additionalFile1_BEATparameterSelection.docx 文件格式: DOCX (.docx) 内容说明:...
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