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标签: MDP参数

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  • 蛋白质空腔与水动力学识别表征工具教程文件_CICLOPv2

    2025年12月19日 30 56 28

    数据集概述 本数据集是CICLOP v2.0工具的教程文件，该工具用于识别和表征蛋白质空腔及其中的水。数据集包含工具代码、示例文件、环境配置文件和教程文档，为使用该Python工具分析分子动力学轨迹或PDB文件提供支持。 文件详解 工具代码文件: CICLOPv2.0_waterdynamics.py: Python格式，CICLOP...
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  • ECC_CHARMM36_POPC双层膜模拟数据集_100脂质_940mM_NaCl_310K_GROMACS5_1_4

    2025年12月6日 30 19 10

    数据集概述 本数据集为ECC-CHARMM36力场下POPC双层膜的分子动力学模拟数据，包含100脂质/叶、940mM NaCl溶液、310K温度条件，由GROMACS 5.1.4生成，是6组模拟中的第6组，用于研究CHARMM力场缩放对离子结合的影响。 文件详解 该数据集包含12个GROMACS格式文件，具体说明如下： - 结构与拓扑文件： -...
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