数据集概述
本数据集为AutoSpectral Aurora光谱流式细胞术数据分析工具的基本工作流程示例数据,包含12个文件。数据主要由FCS格式的流式细胞仪数据文件和CSV格式的控制文件组成,展示了PBMC(外周血单个核细胞)样本的光谱流式细胞分析实验,涵盖控制样本和完全染色样本两类数据。
文件详解
- FCS流式细胞数据文件(11个文件)
- 文件格式: FCS
- 字段映射介绍: 包含流式细胞仪检测到的细胞光散射和荧光信号数据。文件命名通常包含样本标识(如D3, E1)、标记物名称(如CD3, CD56)、荧光染料(如Pacific Blue, Spark NIR 685)及实验条件(如PBMC 1hr RT)。
- CSV控制文件(1个文件)
- 文件名称:
aurora_fcs_control_file.csv
- 文件格式: CSV
- 字段映射介绍: 包含用于数据分析的元数据,主要字段包括:
filename: FCS文件名
fluorophore: 荧光染料名称
marker: 细胞标记物(如CD8)
channel: 检测通道
control.type: 控制类型(如cells)
universal.negative: 通用阴性对照标识
large.gate: 大的设门标识
is.viability: 是否为活性染料标识
适用场景
- 光谱流式细胞术数据分析流程学习: 作为AutoSpectral工具的学习示例,用于理解和实践光谱流式数据的标准化分析流程。
- 免疫细胞表型分析: 利用标记物信息(如CD3, CD56, CD8)对PBMC中的免疫细胞亚群进行识别和分析。
- 流式细胞术质量控制: 通过对照样本数据,评估实验的稳定性和数据的可靠性。
- 生物信息学工具开发与测试: 为开发或测试新的流式细胞数据分析算法或软件提供标准化的测试数据集。