数据集概述
该数据集包含巴拉圭冬青（Ilex paraguariensis）YMM1核基因组注释的关联数据，涵盖基因预测、基因注释及组装转录本列表三类文件，为基因组功能解析提供基础数据支持。
文件详解
- 基因预测文件（共16个）：
- 文件示例：BRAKER3 37732 gene models.gff.gz、Augustus (1) 33227 gene models.gff.gz等
- 文件格式：GFF.gz（压缩的通用特征格式）
- 内容：不同工具预测的基因模型数据，含基因位置、结构等注释信息，每个文件标注对应基因模型数量
- 基因注释文件（共2个）：
- 文件示例：未明确列出具体名称
- 文件格式：GFF.gz（压缩的通用特征格式）
- 内容：基因功能注释数据
- 组装转录本列表文件（共3个）：
- 文件示例：StringTie_merge 76749 transcripts.fasta.gz、Trinity_PASA 160045 transcripts.fasta.gz等
- 文件格式：FASTA.gz（压缩的序列格式）
- 内容：转录本序列数据，每个文件标注对应转录本数量
适用场景
- 植物基因组学研究：解析巴拉圭冬青基因结构与功能
- 分子生物学分析：研究基因表达调控机制
- 比较基因组学：与其他冬青属植物基因组特征对比
- 功能基因组学：挖掘关键性状相关基因
- 转录组学分析：分析转录本多样性与表达模式
