数据集概述
本数据集专为本科生物化学实验课程设计,聚焦串联质谱技术及在Google Colab平台运行X!Tandem分析工具的教学应用。包含样本MS/MS数据及运行X!Tandem所需的配置文件,为学生实践提供完整数据支持。
文件详解
- 文件目录: Dataset for an undergraduate biochemistry laboratory course (X!Tandem search on Google Colab)/
- 配置文件 (.xml格式,共3个):
- input.xml: X!Tandem分析输入配置文件
- default_input.xml: 默认输入配置文件
- taxonomy.xml: 分类学信息配置文件
- 数据文件:
- data.mgf: 样本MS/MS数据文件,包含单个MS/MS谱图
- ecoli-sfGFP.fasta: 大肠杆菌-sfGFP蛋白序列数据库文件
适用场景
- 生物化学实验教学: 用于本科课程中串联质谱数据分析及X!Tandem工具操作实践
- 蛋白质组学入门: 帮助学生理解质谱数据解析流程及蛋白质鉴定原理
- 生物信息学工具应用: 学习在Google Colab环境下运行生物信息学分析工具
- 实验课程设计: 为相关实验课程提供标准化数据集及分析流程参考