数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)DG1856品系goa-1(sa734)I基因突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为特征,包含实验参数、视频追踪数据及行为特征提取结果,可用于研究该基因突变对神经行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:goa-1 (sa734)I on food R_2009_07_08__12_09__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等量化指标
- 实验原始数据文件:
- 文件名称:goa-1 (sa734)I on food R_2009_07_08__12_09__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基本参数(帧率25.9067fps、像素分辨率4.95268微米/像素、总时长299.536秒)及6648个分割骨架数据
- 压缩数据文件:
- 文件名称:goa-1 (sa734)I on food R_2009_07_08__12_09__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,可能包含标准化的行为数据格式(wcon)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为研究:分析goa-1基因突变体的运动模式、身体姿态等行为特征,探究基因功能与神经行为的关联
- 基因功能验证:通过对比野生型与突变体的行为差异,验证goa-1基因在调控线虫行为中的作用
- 行为实验方法学参考:参考实验所用的tierpsy软件追踪方法、培养条件及实验流程,优化线虫行为实验设计
- 生物大数据分析:结合线虫行为数据库的其他实验数据,开展多维度的线虫行为特征比较研究