数据集概述
本数据集包含CartoCell深度学习管道相关的3D图像数据,用于上皮囊肿细胞形态模式分析。数据以TIFF格式存储,涵盖高分辨率、低分辨率下不同样本类型的原始及标记图像,支持细胞分割与单细胞图谱研究。
文件详解
数据集包含1994个TIFF格式文件,按分辨率和样本类型分类存储,具体如下:
- 高分辨率MDCK常氧图像目录(high-resolution_MDCK-Normoxia_label_images/、high-resolution_MDCK-Normoxia_raw_images/):存储4d、7d等时间点的标记图像(如4d.HR.1.tif)和原始图像,用于高分辨率细胞形态分析
- 低分辨率图像目录(含MDCK低氧/常氧、卵室、胚胎样体等子目录):包含不同实验条件下的原始图像、标记图像,以及胚胎样体的训练/测试图像(如EMB.273.tif),覆盖多类样本的3D图像数据
数据来源
ComplexOrganizationOfLivingMatter仓库(GitHub)
适用场景
- 细胞生物学研究:分析上皮囊肿细胞形态模式及3D结构特征
- 深度学习模型训练:用于3D图像分割、细胞检测等计算机视觉模型的训练与验证
- 生物医学图像分析:探索低分辨率图像下细胞形态自动化分析方法
- 单细胞图谱研究:支持上皮细胞群体的空间分布与形态多样性分析