CHO_K1整合基因组组装数据集

数据集概述

该数据集为CHO-K1细胞系的整合基因组组装结果，通过Illumina HiSeq平台生成测序数据，结合SOAPdenovo和OPERA-LG工具进行从头组装，并与已发表序列合并，提升了基因组连续性，填补了原组装中的大量缺口。

文件详解

• 文件名称：CHO_bgi_opera-RecalcLen.length_sorted.Minlength.Ambig500.Pure500.fasta.gz
• 文件格式：FASTA压缩文件（.fasta.gz）
• 内容说明：包含CHO-K1细胞系的整合基因组组装序列，序列经过长度排序、最小长度过滤等处理，为基因组研究提供基础序列数据

适用场景

• 细胞生物学研究：分析CHO-K1细胞系的基因组结构特征
• 抗体生产机制研究：探究基因组变化与抗体生产能力的关联
• 基因组组装方法验证：评估整合组装策略对基因组连续性的提升效果
• 生物制药应用基础研究：为CHO细胞系的基因工程改造提供参考