DNMT_TET_profile隐马尔可夫模型数据集

数据集概述

该数据集包含四个文件,均为用于识别昆虫转录组和基因组中DNA甲基转移酶(DNMT)及TET双加氧酶的Profile隐马尔可夫模型(pHMMs),支持昆虫DNA甲基化相关研究。

文件详解

  • 文件名称:DNMT-TET_phmms/1.DNMT1.hmm
  • 文件格式:.hmm
  • 描述:用于识别DNMT1酶的Profile隐马尔可夫模型文件
  • 文件名称:DNMT-TET_phmms/2.TRDMT1.hmm
  • 文件格式:.hmm
  • 描述:用于识别TRDMT1酶的Profile隐马尔可夫模型文件
  • 文件名称:DNMT-TET_phmms/3.DNMT3.hmm
  • 文件格式:.hmm
  • 描述:用于识别DNMT3酶的Profile隐马尔可夫模型文件
  • 文件名称:DNMT-TET_phmms/4.TET.phmm
  • 文件格式:.phmm
  • 描述:用于识别TET双加氧酶的Profile隐马尔可夫模型文件

适用场景

  • 昆虫基因组学研究:识别昆虫基因组中的DNA甲基转移酶和TET双加氧酶序列
  • 昆虫转录组分析:从昆虫转录组数据中筛选DNA甲基化相关酶的编码序列
  • 表观遗传学研究:支持昆虫DNA甲基化水平及特征的分析
  • 进化生物学研究:辅助探究昆虫DNA甲基化机制的进化规律
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.41 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。