多州蝙蝠蜱虫病原体调查数据集

数据集概述

本数据集围绕蝙蝠蜱虫(Alectorobius kelleyi)携带的斑点热立克次体和回归热疏螺旋体展开多州调查,包含组装的宏基因组 scaffolds、立克次体氨基酸序列比对及系统发育树数据,为蜱传病原体研究提供支撑。

文件详解

数据集包含一个目录及三个文件,具体说明如下: - 目录: Data for Multistate survey of spotted fever Rickettsia and relapsing fever Borrelia in the bat tick, Alectorobius kelleyi (Ixodida Argasidae)/ - 文件列表: - Rickettsia_AK.aln: ALN格式文件,为82种立克次体的氨基酸序列比对数据 - Rickettsia_AK.tre: TRE格式文件,由IQTREE生成的最大似然法系统发育树数据 - A_kelleyi_metagenome_scaffolds.fasta.zip: ZIP压缩文件,包含蝙蝠蜱虫的组装宏基因组scaffolds(FASTA格式)

适用场景

  • 蜱传病原体研究: 分析蝙蝠蜱虫中立克次体与疏螺旋体的遗传特征及进化关系
  • 分子系统学分析: 基于系统发育树探究立克次体物种间的亲缘关系
  • 宏基因组学研究: 解析蝙蝠蜱虫携带的微生物群落结构及病原体组成
  • 流行病学调查: 支撑多州范围内蝙蝠蜱虫相关传染病的风险评估与防控策略制定
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 222.33 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。