功能古菌鞭毛机制的水平基因转移数据集

数据集概述

本数据集围绕古菌鞭毛机制向细菌的水平基因转移展开,包含相关基因序列、系统发育树及补充信息,支持研究古菌鞭毛基因在绿弯菌门细菌中的分布、结构及进化来源,为跨原核生物域的基因转移研究提供数据基础。

文件详解

  • 说明文档:
  • ReadMe.txt: 文本格式说明文档,概述数据内容,包括通用标记基因串联序列、绿弯菌门参考系统发育树文件等信息。
  • 系统发育树文件:
  • 包含10个.treefile格式文件(如arCOG01809_IM_Chloroflexi_Archaea_Seq_Final.treefile)和10个对应PDF格式可视化文件(如arCOG01809_IM_Chloroflexi_Archaea_Seq_Final.treefile.pdf),记录不同古菌鞭毛相关基因的最大似然系统发育树。
  • 基因序列文件:
  • 10个.faa格式文件(如arCOG04148_FlaH_Chloroflexi_Archaea_Seq_Final.faa),包含绿弯菌门和古菌中保守核心古菌鞭毛机制同源蛋白的序列数据。
  • 补充数据文件:
  • SupplementaryTable.xlsx: Excel格式补充表格,可能包含实验或分析相关的补充数据。

适用场景

  • 微生物遗传学研究: 分析古菌鞭毛基因向细菌水平转移的事件及机制。
  • 系统发育分析: 基于基因序列和系统发育树探究绿弯菌门与古菌的进化关系。
  • 分子生物学研究: 研究古菌鞭毛同源蛋白在细菌中的结构与功能特征。
  • 原核生物进化研究: 探索跨原核生物域基因转移对生物适应性的影响。
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.24 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。