数据集概述
本数据集是离子组学研究相关的综合性数据集合,包含拟南芥、酵母、玉米等物种的离子组学数据文件、分析脚本及补充文档,支持离子组学实验数据的分析与复现。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共18个):
- Arabidopsis_SampleZscore_07222010.csv:拟南芥样本Z值数据,包含TRAY、DATE PLANTED、TEMPERATURE等实验条件与处理字段
- Arabidopsis_MedianNormalized_07222010.csv:拟南芥中位数归一化数据
- Arabidopsis_MedianZscore_07222010.csv:拟南芥中位数Z值数据
- Weight_corrected_seed_GAM_NO_CHECKUP_NO_MAGIC.csv:种子重量校正数据,包含Tray、Accession_ID、Ecotype_ID等样本标识与校正后重量字段
- Weight_corrected_leaf_GAM_NO_CHECKUP_NO_MAGIC.csv:叶片重量校正数据
- 压缩文件(ZIP格式,共13个):
- Shakooretal2016.Scripts.zip:Shakoor等人2016年研究的分析脚本
- Ziegler_etal_PlantGenome2012_ScriptsAndData.zip:Ziegler等人2012年发表于Plant Genome的脚本与数据
- Arabidopsis_Files.zip:拟南芥相关文件压缩包
- Asaroetal2016.MaizeIBMionomicsandQTLdata.zip:Asaro等人2016年玉米IBM群体离子组学与QTL数据
- Yeast_Files.zip:酵母相关文件压缩包
- MaizeNAMionomicsandGWASdata.zip:玉米NAM群体离子组学与GWAS数据
- 文档文件:
- README.txt:说明文档,格式为TXT
适用场景
- 离子组学数据分析:拟南芥、玉米、酵母等物种离子组学实验数据的统计分析与可视化
- 植物遗传学研究:结合QTL、GWAS数据探究离子含量相关遗传机制
- 实验方法复现:利用配套脚本复现已发表研究中的数据处理流程
- 多组学整合分析:与其他组学数据联合分析,揭示离子代谢调控网络