离子组学中心数据集

数据集概述

本数据集是离子组学研究相关的综合性数据集合,包含拟南芥、酵母、玉米等物种的离子组学数据文件、分析脚本及补充文档,支持离子组学实验数据的分析与复现。

文件详解

  • 数据文件(CSV格式,共18个):
  • Arabidopsis_SampleZscore_07222010.csv:拟南芥样本Z值数据,包含TRAY、DATE PLANTED、TEMPERATURE等实验条件与处理字段
  • Arabidopsis_MedianNormalized_07222010.csv:拟南芥中位数归一化数据
  • Arabidopsis_MedianZscore_07222010.csv:拟南芥中位数Z值数据
  • Weight_corrected_seed_GAM_NO_CHECKUP_NO_MAGIC.csv:种子重量校正数据,包含Tray、Accession_ID、Ecotype_ID等样本标识与校正后重量字段
  • Weight_corrected_leaf_GAM_NO_CHECKUP_NO_MAGIC.csv:叶片重量校正数据
  • 压缩文件(ZIP格式,共13个):
  • Shakooretal2016.Scripts.zip:Shakoor等人2016年研究的分析脚本
  • Ziegler_etal_PlantGenome2012_ScriptsAndData.zip:Ziegler等人2012年发表于Plant Genome的脚本与数据
  • Arabidopsis_Files.zip:拟南芥相关文件压缩包
  • Asaroetal2016.MaizeIBMionomicsandQTLdata.zip:Asaro等人2016年玉米IBM群体离子组学与QTL数据
  • Yeast_Files.zip:酵母相关文件压缩包
  • MaizeNAMionomicsandGWASdata.zip:玉米NAM群体离子组学与GWAS数据
  • 文档文件:
  • README.txt:说明文档,格式为TXT

适用场景

  • 离子组学数据分析:拟南芥、玉米、酵母等物种离子组学实验数据的统计分析与可视化
  • 植物遗传学研究:结合QTL、GWAS数据探究离子含量相关遗传机制
  • 实验方法复现:利用配套脚本复现已发表研究中的数据处理流程
  • 多组学整合分析:与其他组学数据联合分析,揭示离子代谢调控网络
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 632.99 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。