数据集概述
本数据集包含面包酵母在冷冻胁迫前后的转录组学分析数据,涉及普通酵母(ABY3、FABY3)及过表达SNF1基因酵母(ABY+S、FABY+S)在30℃发酵半小时或-20℃冷冻7天后发酵半小时的基因表达差异数据,为研究冷冻胁迫对酵母基因表达的影响提供支持。
文件详解
- 文件名称: Differential gene after freezing.csv
- 文件格式: CSV(.csv)
- 字段映射: 包含id(基因编号)、FABY3_count(冷冻后普通酵母基因计数)、FABY+S_count(冷冻后过表达SNF1基因酵母基因计数)、FABY3_fpkm(冷冻后普通酵母基因表达量)、FABY+S_fpkm(冷冻后过表达SNF1基因酵母基因表达量)、log2(FC)(表达量倍数变化对数)、Pvalue(P值)、FDR(校正后P值)、significant(差异显著性)、Symbol(基因符号)、Description(基因描述)、KEGG_A_class(KEGG一级分类)、KEGG_B_class(KEGG二级分类)、Pathway(通路名称)、K_ID(KEGG通路ID)、GO Component(GO细胞组分)、GO Function(GO分子功能)、GO Process(GO生物过程)等字段
- 文件名称: Differential gene before freezing.csv
- 文件格式: CSV(.csv)
- 字段映射: 包含id(基因编号)、ABY3_count(冷冻前普通酵母基因计数)、ABY+S_count(冷冻前过表达SNF1基因酵母基因计数)、ABY3_fpkm(冷冻前普通酵母基因表达量)、ABY+S_fpkm(冷冻前过表达SNF1基因酵母基因表达量)、log2(FC)(表达量倍数变化对数)、Pvalue(P值)、FDR(校正后P值)、significant(差异显著性)、Symbol(基因符号)、Description(基因描述)、KEGG_A_class(KEGG一级分类)、KEGG_B_class(KEGG二级分类)、Pathway(通路名称)、K_ID(KEGG通路ID)、GO Component(GO细胞组分)、GO Function(GO分子功能)、GO Process(GO生物过程)等字段
适用场景
- 酵母抗冻机制研究: 分析冷冻胁迫前后酵母差异表达基因,探究抗冻相关基因功能
- 基因功能分析: 结合KEGG通路、GO注释研究SNF1基因过表达对酵母冷冻耐受性的调控机制
- 转录组学数据分析: 用于验证冷冻胁迫下酵母基因表达差异的生物信息学方法
- 食品微生物应用研究: 为面包酵母冷冻保存技术优化提供基因层面的理论支持