数据集概述
本数据集为牛蜱Rhipicephalus microplus基因组研究的在线补充表集合,包含基因位点功能注释、BUSCO缺失基因映射、gag-pol融合蛋白比对、GO注释比较、microRNA预测及物种间蛋白家族分析等内容,支持对该蜱虫基因组的深入解析。
文件详解
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S5.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:牛蜱Rmi v2.0基因组基因位点代表性序列的功能注释,含核苷酸/蛋白序列、AutoFACT描述、BUSCO评估、KEGG/COG/GO注释等字段
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S7.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:BUSCO缺失祖先节肢动物基因的转录本映射与推定基因位点预测,含部分缺失蛋白的推定基因位点及无匹配的BUSCO蛋白信息
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S8.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:牛蜱gag-pol融合蛋白与 closest reference hit 的BLASTP序列比对结果
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S9.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:Rmi_v1.0、Rmi_v2.0与Ixodes scapularis IscaW1蛋白的GO注释比较,含Rmi_v2.0相对于IscaW1注释量四倍及以上增加的GO类别标注
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S10.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:牛蜱与Ixodes scapularis间GO注释差异显著的基因/蛋白具体信息
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S11.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:牛蜱Rmi v2.0基因组中预测的microRNA(miRNAs)信息
- 文件名称:IJPara16_231_R2_SuppTable_S12.xlsx
- 文件格式:Excel (.xlsx)
- 内容:OrthoMCL分析结果,含牛蜱与Ixodes scapularis的特有及共有蛋白家族信息
数据来源
International Journal of Parasitology(相关手稿在线补充材料)
适用场景
- 蜱虫基因组功能注释研究:解析牛蜱Rhipicephalus microplus基因功能及代谢通路
- 节肢动物基因组比较分析:探究牛蜱与Ixodes scapularis的基因家族差异与进化关系
- 寄生虫分子生物学研究:支持蜱虫关键基因(如gag-pol融合蛋白、microRNA)的功能解析
- 基因组组装质量评估:基于BUSCO数据评估牛蜱Rmi v2.0基因组的完整性
- 基因注释方法验证:对比不同版本牛蜱基因组及参考物种的GO注释结果