数据集概述
本数据集为OAS-RNase L先天免疫通路古老起源研究的补充信息,包含系统发育关系数据与序列比对数据。核心围绕不同类群生物(如食肉目、偶蹄目等)的OAS相关蛋白、RNase L相关蛋白的系统发育分析展开,支撑该通路进化机制的研究。
文件详解
该数据集包含两个核心目录及相关TXT文件,具体说明如下:
- 系统发育数据目录(Data for Phylogeny/):
- 包含多个TXT格式文件,命名示例:Phylogeny 6. Figure S6A. Phylogenetic relationship of OAS_Carnivora_clade14_OASL2.txt
- 内容:记录不同类群生物(食肉目、偶蹄目、翼手目等)的OAS相关蛋白、RNase L相关蛋白的系统发育关系数据,对应研究中的图表(如Figure 1B、Figure 2A/B、Figure S6A/B)
- 序列比对数据目录(Date for Alignment/):
- 包含多个TXT格式文件,命名示例:Alignment 9. Figure S6A. Alignments of OAS_Carnivora_clade3+clade2+clade1.txt
- 内容:提供对应系统发育分析的序列比对数据,支撑系统发育树构建的原始序列信息
适用场景
- 分子进化研究:分析OAS-RNase L先天免疫通路关键蛋白的系统发育关系与进化历程
- 免疫生物学研究:探究先天免疫通路的古老起源及分子修补机制
- 比较基因组学分析:跨类群(如哺乳类、鸟类、爬行类等)研究OAS家族蛋白的进化分化
- 生物信息学方法验证:用于系统发育树构建与序列比对分析方法的验证或复现