数据集概述
该数据集通过流式细胞术纯化外侧与内侧皮质的皮质脊髓神经元(CSN),分析其在出生后第一天(P1)、第四天(P4)、第七天(P7)三个发育时间点的差异表达基因。包含P1三个生物学重复、P4和P7各两个重复数据,为研究皮质脊髓神经元节段靶标特异性的分子调控提供支持。
文件详解
- 完整数据集文件:
- Sahni et al., Macklis Microarray data all time points - ROSETTA INTENSITIES.xlsx:Excel格式,含所有探针的标准化基因强度、各生物学重复的归一化强度、各亚群各时间点的平均强度、外侧与内侧CSN的折叠变化及p值
- 差异表达基因文件(按时间点和亚群分类):
- Sahni et al., Macklis Lateral P1 top genes ranked by SAM RMA.xlsx:Excel格式,P1外侧CSN差异表达Top基因,按SAM-RMA排序,含归一化强度
- Sahni et al., Macklis Medial P1 top genes ranked by SAM RMA.xlsx:Excel格式,P1内侧CSN差异表达Top基因,按SAM-RMA排序,含归一化强度
- Sahni et al., Macklis Lateral P4 top genes ranked by SAM RMA.xlsx:Excel格式,P4外侧CSN差异表达Top基因,按SAM-RMA排序,含归一化强度
- Sahni et al., Macklis Medial P4 top genes ranked by SAM RMA.xlsx:Excel格式,P4内侧CSN差异表达Top基因,按SAM-RMA排序,含归一化强度
数据来源
美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合数据库(GEO),登录号GSE77311
适用场景
- 神经发育生物学研究:分析皮质脊髓神经元亚群在不同发育阶段的基因表达特征
- 分子神经科学研究:探究调控皮质脊髓神经元节段靶标特异性的关键基因
- 基因表达数据分析:验证差异表达基因分析方法在神经发育研究中的应用
- 神经科学转化研究:为脊髓损伤修复相关的靶点筛选提供分子基础数据