数据集概述
该数据集记录了采用无标记数据独立采集（DIA）方法，对PRRS病毒感染墨西哥株MARC-145细胞过程中蛋白质水平变化的定量分析结果，包含质谱仪测量的所有原始数据及处理后的蛋白质丰度信息。
文件详解
该数据集包含1个目录和7个文件，具体说明如下：
- 目录：Peptide identifications/
- 包含6个CSV格式的肽段鉴定文件，其中3个为感染组样本（如20170831_UDMSE_INFECTED_R001_IA_final_peptide.csv），3个为对照组样本（如20170831_UDMSE_CONTROL_R001_IA_final_peptide.csv）
- 字段示例：protein.key、protein.Entry、protein.Accession、protein.Description、protein.score等
- 根目录文件：
- measurements by mass spectrometry.xlsx：Excel格式文件，包含7个工作表
- TOTAL PROTEINS：原始质谱强度、ANOVA、q值、肽段数量等
- ONLY ID BUT NOT QUANT：未定量蛋白质（含无独特肽段的蛋白）
- EXCLUSIVE PROTEINS：仅在单一条件下存在的蛋白质（对照组2个）
- QUANTIFIED PROTEINS：Hi3法定量蛋白质，含Log10(Anova)、平均强度、CV、比率等
- UNCHANGED：丰度无变化的699个蛋白质
- UP：感染后上调的17个蛋白质
- DOWN：感染后下调的19个蛋白质
适用场景
- 病毒学研究：分析PRRSV感染对宿主细胞蛋白质组的影响
- 蛋白质组学分析：验证无标记DIA方法在定量蛋白质组学中的应用
- 生物标志物筛选：识别PRRSV感染相关的差异表达蛋白质
- 质谱数据分析：探索蛋白质定量数据的处理与质量控制方法
