数据集概述
本数据集包含在σ=1.0条件下对VEGAS采样参数点(σ=10)运行Paramotopy获得的解决方案认证文件。作为Nam等人关于翻译后修饰系统鲁棒性和参数地理学研究的组成部分,数据集包含72个无扩展名文件,涵盖多项式、解决方案和摘要等不同类型的认证输出文件,用于分析参数空间的稳定性和系统行为特征。
文件详解
- 认证输出文件(Certification output files)
- 文件格式:无扩展名文件
- 字段映射介绍:文件命名遵循特定模式,包含以下关键信息:
- sigma1_threshold_vegas10:表示σ=1.0阈值和VEGAS采样参数点σ=10
- part[编号]:数据分区编号(如part1-part4)
- [类型]:文件内容类型(solutions-解决方案、polynomials-多项式、summary-摘要)
- run[编号]:运行次数编号(如run0-run5)
- 文件示例:sigma1_threshold_vegas10_part4_summary_run2、sigma1_threshold_vegas10_part2_solutions_run0等
数据来源
论文"Robustness and parameter geography in post-translational modification systems"(Nam等人)
适用场景
- 系统生物学参数空间分析: 研究翻译后修饰系统在不同参数条件下的稳定性和鲁棒性特征
- 计算生物学方法验证: 验证Paramotopy方法在复杂生物系统参数认证中的适用性
- 参数地理学研究: 分析生物系统参数空间的分布特征和地理学模式
- 多参数系统建模: 为复杂生物系统的多参数建模和仿真提供认证数据支持