数据集概述
本数据集为研究去泛素化酶OTUD1负向调控炎症及脓毒症肺损伤免疫调节作用的原始材料,包含脓毒症患者临床指标、转录组学数据、OTUD1敲除小鼠蛋白组与转录组分析、肺损伤检测指标、炎症因子水平及信号通路激活情况等多维度实验数据,支持相关机制研究的验证与分析。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下:
- 数据清单文件:
- Document Checklist for the Raw Data.docx: 原始数据清单文档,记录数据集整体结构与文件目录
- Raw Data 1(患者临床数据):
- Raw Data of Demographics and Clinical Characterization of Patients..xlsx: Excel格式,患者人口学特征与临床表征数据
- Raw Data of Main Clinical Indexes and Inflammatory Biomarkers in Patients..xlsx: Excel格式,脓毒症患者主要临床指标及炎症生物标志物数据
- Raw Data 2(临床转录组数据):
- Raw Data 2.zip: 压缩文件,包含脓毒症患者详细转录组谱及NCBI GEO数据库公开芯片数据(GSE57065、GSE28750、GSE76293)
- Raw Data 3(OTUD1敲除小鼠蛋白组数据):
- Raw Data 3.zip: 压缩文件,OTUD1敲除小鼠详细蛋白组谱及初步生物信息学分析数据
- Raw Data 4(CLP诱导脓毒症小鼠转录组数据):
- Raw Data 4.zip: 压缩文件,OTUD1敲除小鼠CLP诱导实验性脓毒症的详细转录组谱及初步生物信息学分析数据
- Raw Data 5(肺损伤检测数据与图像):
- Lung injury score.xlsx: Excel格式,肺损伤评分数据
- Assessment of lung injury.xlsx: Excel格式,肺损伤评估数据(含肺W/D比值、MPO/SOD/LDH活性等)
- Blood gas analysis.xlsx: Excel格式,血气分析数据(含PaO2、PaO2/FiO2比值)
- Survive rates.xlsx: Excel格式,小鼠存活率数据
- HE images/目录: 含KO CLP6h.tif、WT Sham.tif等HE染色图像文件
- TEM images/目录: 含KO_12h.tif、WT_CLP6h.tif等透射电镜图像文件
- Raw Data 6(小鼠血清炎症因子数据):
- ELISA.xlsx: Excel格式,小鼠血清炎症细胞因子水平(TNF-α、IL-6、IL-1β、HMGB1)
- Raw Data 7(BMDMs炎症因子表达数据):
- qRT-PCR-1_the levels of inflammatory cytokines of LPS-stimulated BMDMs.xlsx: Excel格式,LPS刺激BMDMs的炎症因子mRNA表达水平(TNF-α、IL-6、IL-1β、HMGB1)
- qRT-PCR-2_the levels of inflammatory cytokines of LPS-stimulated BMDMs by pretreatment with 5Z-7-ox.xlsx: Excel格式,5Z-7-ox预处理后LPS刺激BMDMs的炎症因子mRNA表达水平
- Raw Data 8(信号通路激活数据):
- Western Blot-1/目录: 含ACTB.JPG、p-p38;p-p65.JPG等Western Blot图像文件,记录LPS刺激BMDMs中TAK1-MAPK/NF-κB通路蛋白表达
- Western Blot-2/目录: 含ACTB.JPG、TAK1.JPG等Western Blot图像文件,记录5Z-7-ox预处理后LPS刺激BMDMs的通路蛋白表达
- Western Blot-3/目录: 含mice-JNK.tif、mice-p-p65.tif等Western Blot图像文件,记录小鼠肺组织中TAK1-MAPK/NF-κB通路蛋白表达
适用场景
- 炎症调控机制研究: 分析OTUD1对炎症信号通路的负向调控作用
- 脓毒症病理机制研究: 探究脓毒症肺损伤的免疫调节机制
- 临床转化研究: 脓毒症患者炎症生物标志物与临床指标的关联分析
- 信号通路研究: TAK1-MAPK/NF-κB通路在脓毒症炎症反应中的激活机制分析
- 动物模型验证: OTUD1敲除对脓毒症小鼠肺损伤及存活率的影响评估