数据21种代谢酵母转录因子在四种恒化器条件下的结合数据集

数据集概述

本数据集包含21种代谢相关酵母转录因子(TF)在四种恒化器培养条件下的结合数据,以Wig格式存储全基因组每个核苷酸位置的测序读段计数(仅保留信号大于0的位置),数据为ChIP-exo实验生物学重复的平均值,读长为10。

文件详解

该数据集包含一个目录下的84个Wig格式文件,具体说明如下: - 目录名称:Transcription factor (TF) binding data for 21 metabolic yeast TFs in four chemostat conditions/ - 文件格式:Wig(.wig) - 文件命名规则:由转录因子名称、读长、培养条件(如Eth、Glu、Oxy)及日期等信息组成,示例文件包括Cat8_10_Eth_170108_pm.wig、Gcr1_10_Eth_170108_pm.wig等 - 文件内容:记录全基因组范围内每个核苷酸位置的测序读段计数(仅信号>0的位置),为生物学重复的平均值

适用场景

  • 酵母转录调控研究:分析不同代谢条件下转录因子的基因组结合位点分布
  • 代谢通路调控机制研究:探究特定转录因子在不同恒化器条件下对代谢通路的调控作用
  • 生物信息学方法验证:使用随附的R脚本复现相关研究结果
  • 基因组学数据分析:结合其他组学数据解析酵母代谢网络的转录调控逻辑
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 527.48 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
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