数据集概述
本数据集包含支持“豌豆蚜虫宿主植物适应性遗传学”研究的原始数据、处理文件及分析代码，涵盖表型数据、基因型数据、连锁图谱文件和R语言分析脚本，为豌豆蚜虫宿主植物接受性的遗传学机制研究提供数据支持。
文件详解
- 表型数据文件
- pea_phenotypes.csv：CSV格式，包含Clone（克隆编号）、pea_count_alive（存活数量）、pea_survival（存活率）、pea_probing_alive（探测存活比例）字段
- alfalfa_phenotypes.csv：CSV格式，包含Clone（克隆编号）、alf_count_alive（存活数量）、alf_survival（存活率）、alf_probing_alive（探测存活比例）字段
- raw_phenotypes.xlsx：XLSX格式，原始表型数据文件
- rqtl_geno_pheno.csv：CSV格式，用于R/qtl分析的基因型-表型关联数据
- 基因型与连锁图谱文件
- pea_aphid.ped：PED格式，豌豆蚜虫基因型数据文件
- 6443markers.post：无扩展名，标记数据文件
- A1_linkage_map_and_genome_pos：无扩展名，A1连锁图谱与基因组位置文件
- A2_linkage_map_and_genome_pos：无扩展名，A2连锁图谱与基因组位置文件
- A3_linkage_map_and_genome_pos：无扩展名，A3连锁图谱与基因组位置文件
- X_linkage_map_and_genome_pos：无扩展名，X连锁图谱与基因组位置文件
- 分析代码文件
- select_aabb_variants.r：R脚本，筛选AABB变异的代码
- lepmap3.r：R脚本，LepMap3分析相关代码
- RegHer_bin_20240516.R：R脚本，遗传率分析相关代码
- 其他文件
- READ ME：无扩展名，数据集说明文档
- post.1691336.zip：ZIP格式，压缩文件包
适用场景
- 昆虫遗传学研究：分析豌豆蚜虫宿主植物接受性的遗传基础
- 表型-基因型关联分析：探究蚜虫表型性状与基因型标记的关联模式
- 连锁图谱构建：基于标记数据构建豌豆蚜虫染色体连锁图谱
- 适应性进化研究：研究蚜虫对不同宿主植物的适应性进化机制
