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分类: 公开数据 标签: scaffolds

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  • 芦笋转座子元件分析_河南师范大学植物基因组学数据库_2014年

    2026年1月29日 30 105 10

    数据集概述 本数据集为芦笋(Asparagus officinalis)基因组中转座子(TEs)的分析数据,基于男女芦笋基因组的Illumina HiSeq2000测序及生物信息学分析生成。数据包含17 Gb序列(12×覆盖度),组装为163,406个 scaffolds(总长400...
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  • Symphonia_Based热带树种基因组工具开发及遗传标记数据

    2026年1月27日 30 187 11

    数据集概述 本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果,包括首个低覆盖度(11X)基因组草图、单核苷酸多态性(SNP)及简单序列重复(SSR)标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小,含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息,可支持种群遗传学及比较基因组学研究。 文件详解...
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  • Chinook_Salmon_Based适应性变异候选基因连锁图谱数据

    2026年1月26日 30 11 9

    数据集概述 本数据集包含奇努克鲑鱼(Oncorhynchus tshawytscha)的整合连锁图谱及候选基因相关数据,基于不同来源的家系数据构建,涵盖14,620个SNP位点(含2,336个亚端粒区旁系同源基因),用于锚定大西洋鲑鱼基因组 scaffolds 及注释ESTs,支持适应性变异相关基因的识别与分析。 文件详解 文档类文件...
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  • Colletotrichum_Comparative_Genomic_半活体营养阶段转变研究数据

    2026年1月8日 30 9 1

    数据集概述 本数据集围绕Colletotrichum属真菌的半活体营养阶段转变展开,包含C. orbiculare和C. gloeosporioides两种病原菌的基因组测序与分析结果。通过比较基因组学和转录组学方法,识别与病原菌侵染阶段相关的基因扩张类群,揭示其致病机制。数据集含4个文件,涵盖基因组组装说明文档与压缩包。 文件详解...
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  • Metagenomics_Based_Elkhorn_Slough微生物垫宏基因组分箱与注释数据集

    2026年1月6日 30 43 41

    数据集概述 本数据集为Elkhorn Slough微生物垫宏基因组分箱与注释的补充测序及注释数据,包含3个共组装数据集的MG-RAST注释、不同k-mer值(k29、k45、k63)共组装的 scaffolds 及Prodigal预测ORFs,以及用于分箱的scaffold覆盖度和注释信息,共5个压缩文件。 文件详解...
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  • Olfactory_receptors_Supplementary_Data_喙头蜥嗅觉受体基因组项目补充数据

    2025年12月28日 30 185 45

    数据集概述 本数据集是喙头蜥(Sphenodon punctatus)基因组项目的补充数据,包含从其基因组组装中识别出的嗅觉受体基因相关信息,涵盖完整嗅觉受体基因列表、系统发育关系推断所用的比对文件,以及从 scaffolds 中识别出的嗅觉受体基因(含假基因和部分基因)的Excel表格,共三个文件。 文件详解 完整嗅觉受体基因列表...
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  • InstaNexus通用直接蛋白质测序补充数据集

    2025年12月18日 30 54 28

    数据集概述 本数据集是论文《Generalizable direct protein sequencing with InstaNexus》的补充数据,包含InstaNexus软件在不同测试样本类型上的输出结果,以及复现论文图表所需的必要数据,按样本类型组织并标注了运行参数。 文件详解 文件名称:supplementary_data.zip...
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  • 海洋海链藻CCMP1005基因组版本2_0数据集

    2025年12月4日 30 120 49

    数据集概述 该数据集包含海洋海链藻CCMP1005基因组版本2.0(Thaoce2)的相关数据,涵盖组装 scaffolds、基因模型、蛋白质及编码序列,同时包含版本1中移除的组装 scaffolds 和基因模型。 文件详解 Thaoce2.zip:压缩文件格式,可能包含基因组组装、基因模型等核心数据文件...
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