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Calibration_Uncertainty_Based_分子定年校准先验评估研究数据
数据集概述 本数据集围绕分子定年分析中的校准不确定性展开，对比先验评估与后验评估方法的差异，探讨化石证据解释对贝叶斯分歧时间估计的影响。包含8个文件，涉及序列数据、树文件、控制文件及XML配置文件，用于支持分子钟校准质量评估研究。 文件详解 序列数据文件 文件名称：CytB+RAG1+R35-inc-...
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Crassiclitellata_Phylogenomic_Based蚯蚓系统发育与起源研究数据
数据集概述 本数据集是Anderson团队关于Crassiclitellata蚯蚓系统基因组分析的研究数据，包含转录组数据分析结果、分歧时间估算文件、分析脚本、系统发育树文件及详细方法文档，支持蚯蚓南北半球主要分支及 Pangaea 起源的研究结论，共9个文件。 文件详解 文档类文件...
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Figitidae_Divergence_Estimates_Based_膜翅目昆虫进化历史研究数据
数据集概述 本数据集包含膜翅目锤角细蜂总科Figitidae科的分歧时间估算与早期进化历史研究相关文件，涉及系统发育分析所需的校准参数与序列数据，为昆虫分类学及进化生物学研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：cynipoid_dating_all_calibrations.xml 文件格式：XML...
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Phylogeography_Sand_burrowing_amphipods_墨西哥湾古缝合带研究数据
数据集概述 本数据集为墨西哥湾沙栖端足类（Haustoriidae科）系统地理学研究的基因数据，包含93个个体的线粒体（COI、16S）和核基因（18S、28S）序列，以及贝叶斯分析用XML配置文件。研究通过系统发育和种群遗传分析，验证墨西哥湾古缝合带对端足类分布及分子多样性的影响，揭示物种分化与地理屏障的关系。 文件详解 基因序列文件（无扩展名）...
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系统发育基因组学测序方案计算机模拟比较数据集
数据集概述 本数据集基于23种灵长类动物基因组，对四种常用系统发育基因组学测序方案（UCE捕获、外显子捕获、RADseq、ddRADseq）进行计算机模拟比较，涵盖系统发育分辨率与分歧时间估算结果，为方案选择提供参考。 文件详解 文件名称: README_for_beast.tar.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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哺乳动物多形态钟与全证据端点定年数据集
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物多形态钟与全证据端点定年研究，包含形态特征演化时钟分析、系统发育拓扑推断及分歧时间估计相关数据，涉及单时钟与多时钟模型对比及参数收敛、树结构等结果文件。 文件详解 该数据集包含26个文件，具体说明如下： - 文档类文件: - Description.docx: Word文档，可能为研究项目的详细描述 -...
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化石出生_死亡过程下全证据定年数据集
数据集概述 本数据集围绕贝叶斯全证据定年方法展开，扩展化石出生-死亡（FBD）过程模型以纳入多样化抽样假设，通过模拟验证和膜翅目早期辐射案例应用，对比不同模型对分歧时间估算的影响，为解决“岩石与时钟”差距提供数据支持。 文件详解 文件名称: FBD_Suppl.pdf 文件格式: PDF（.pdf） 内容说明:...
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线粒体DNA揭示更新世冰川作用对广布古北界蝙蝠物种影响的表2数据集
数据集概述 本数据集为学术论文中的表2数据，通过贝叶斯分析（BI）呈现不同标记数据集（ND1、CytB、COI、16S、Conc.）下线粒体谱系间的分歧时间（单位：百万年），含节点高度均值及95%最高后验密度区间，用于研究古北界蝙蝠物种的演化历史。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML（.html） 字段映射：...
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旧世界与新世界竹节虫系统发育基因组学研究数据集
数据集概述 本数据集围绕竹节虫目（Phasmatodea）的系统发育基因组学研究展开，通过分析61个物种（含38个竹节虫主要类群及23个外群类群）的转录组数据，识别出平均2274个直系同源基因，旨在解决竹节虫目高级别系统发育关系的核心问题，为理解其进化历史、生物地理分布提供数据支持。 文件详解 说明文档:...
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系统发育分歧时间估计解释研究数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育分歧时间估计问题展开，聚焦化石记录与分子钟方法推断的分歧时间不一致现象，以被子植物冠群为例，探讨统计推断配置（参数、先验等）对结果的影响，提供相关分析文件支持研究。 文件详解 数据文件（XML格式，共6个）： 先验设置文件：Prior-...
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金鼹与马岛猬系统发育历史的中位数与95_置信区间数据集
数据集概述 本数据集为金鼹与马岛猬（哺乳纲：非洲兽总目）系统发育历史的分析结果，包含非洲兽总目、马岛猬科及金鼹科各节点的分歧时间中位数与95%置信区间（单位：百万年），基于宽先验分析生成的一致时间树数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Crown node: 冠群节点名称 Plus...
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北美鳉形目鱼类历史生物地理学分歧估计数据集
数据集概述 本数据集为北美鳉形目鱼类历史生物地理学研究中的分歧估计表格，包含17个系统发育节点的分歧时间（百万年前）及95%置信区间，并关联可能影响分歧的环境事件，为理解墨西哥湾流域鱼类演化与地理历史的关系提供基础数据。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML（.html） 字段映射： Node：系统发育节点编号...
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东南亚Crematogaster_inflata_group_膜翅目_蚁科_多位点系统发育与历史生物地理学研究表1
数据集概述 本数据集为研究东南亚Crematogaster inflata-group蚁类的多位点系统发育与历史生物地理学的表1数据，包含BEAST分歧时间分析中三个化石校准节点的先验年龄分布信息，为蚁类演化时间估算提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML 字段映射：包含Taxon (stem-...
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非洲_阿拉伯刺尾蜥蜴线粒体DNA序列分析分歧时间估计表
数据集概述 本数据集为关于非洲-阿拉伯刺尾蜥蜴（Uromastyx属）线粒体DNA序列分析的分歧时间估计表，包含不同分类单元间基于ND2氨基酸序列、核苷酸序列等方法计算的分歧时间及节点分歧值，支持系统发育与基因排列演化研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 数据内容:...
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基于全基因组SNP数据的海鲶贝叶斯分歧时间估计数据集
数据集概述 本数据集包含基于全基因组SNP数据的海鲶（Ariidae）贝叶斯分歧时间估计相关文件，用于验证巴拿马地峡闭合时间的生物地理学证据，涉及多物种溯祖模型的开发与应用，包含模拟验证、军蚁与海鲶基因组数据分析结果及相关文档。 文件详解 补充材料文档：...
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Anthidium_dalmaticum三个分支间进化分歧估计数据表
数据集概述 该数据集为Anthidium dalmaticum三个分支（欧亚、黎凡特、伊朗）间的进化分歧估计表，包含分支间碱基替换距离及标准误差，基于MEGA11的Tamura 3-参数模型分析，涉及14条核苷酸序列。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容: 展示Anthidium...
