数据集概述
本数据集为墨西哥湾沙栖端足类（Haustoriidae科）系统地理学研究的基因数据，包含93个个体的线粒体（COI、16S）和核基因（18S、28S）序列，以及贝叶斯分析用XML配置文件。研究通过系统发育和种群遗传分析，验证墨西哥湾古缝合带对端足类分布及分子多样性的影响，揭示物种分化与地理屏障的关系。
文件详解
- 基因序列文件（无扩展名）
- 文件名称：16Sfile、CO1file、28Sfile、18Sfile
- 文件格式：无扩展名（推测为FASTA或类似序列格式）
- 字段映射介绍：包含沙栖端足类（Haustorius属、Lepidactylus属）的基因序列数据，分别对应16S rRNA、COI、28S rRNA、18S rRNA基因片段
- 分析配置文件
- 文件名称：StarBeast_LogNormClock.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：StarBeast软件的分子钟分析配置文件，用于构建贝叶斯系统发育树及估算分歧时间
数据来源
论文“Phylogeography of sand-burrowing amphipods (Haustoriidae) supports an ancient suture zone in the Gulf of Mexico”
适用场景
- 海洋生物系统地理学研究：分析墨西哥湾沙栖端足类的种群遗传结构与地理分布格局
- 分子进化分析：利用基因序列数据构建系统发育树，估算物种分歧时间
- 地理屏障效应验证：评估密西西比河沉积作用对端足类基因流的阻隔影响
- 隐存种鉴定：通过物种界定方法识别沙栖端足类中的隐存分类单元
- 种群动态历史重建：分析种群扩张、瓶颈等历史动态事件的遗传信号
