找到469个数据集

标签: FASTA

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  • Host_Parasite_Genetics_宿主行为驱动寄生虫种群遗传学研究数据

    2026年1月15日 30 35 18

    数据集概述 本数据集围绕宿主行为对寄生虫遗传学的影响展开,包含共生啮齿动物(囊地鼠)及其寄生咀嚼虱(Thomomydoecus minor)的种群遗传学研究数据,涉及微卫星和线粒体DNA序列分析,用于探究宿主-寄生虫协同进化机制。 文件详解 基因组数据文件 文件名称:Gopher Bfib multiple...
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  • Leptodactylus_Na_K_ATPase_蛙类基因进化与毒素抗性研究数据

    2026年1月15日 30 146 111

    数据集概述 本数据集聚焦Leptodactylus属蛙类的Na+K+ ATP酶α1亚基(ATP1A1)基因进化研究,包含基因序列比对、酶活性实验原始数据及说明文档,用于分析食毒蟾蜍蛙类通过基因重复获得毒素抗性的分子机制,揭示12个氨基酸替换在抗毒素功能与酶活性平衡中的作用。 文件详解...
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  • OGRDB_Based_小鼠PWD_PhJ品系IGKV基因种系参考数据集_开放获取

    2026年1月15日 30 8 6

    数据集概述 本数据集为小鼠PWD/PhJ品系的IGKV基因种系参考集,发布于开放种系受体数据库(OGRDB)。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,用于提供该品系免疫球蛋白κ轻链可变区基因的标准化种系参考序列。 文件详解 许可证文件 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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  • OGRDB_Based_小鼠C57BL_6J品系IGKV基因种系参考数据集_发布版

    2026年1月14日 30 58 9

    数据集概述 本数据集为小鼠C57BL/6J品系的IGKV基因种系参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含间隙型、无间隙型FASTA序列文件、JSON元数据文件及许可证文件,共计4个文件,覆盖基因序列和参考信息,用于生物医学领域的基因序列研究。 文件详解 licence.txt 文件格式:TXT...
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  • Passer_domesticus_Based_肯尼亚麻雀范围扩张表观遗传研究数据

    2026年1月14日 30 9 3

    数据集概述 本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究,包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异,分析其是否受选择驱动,以及DNA甲基化在扩张中的变化规律,为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。 文件详解...
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  • 真核生物元转录组_基于高山土壤样本的真核生物转录组数据及其与生态系统功能的关联分析

    2026年1月14日 30 207 191

    数据集概述 本数据集通过宏转录组学方法研究两种积雪持续时间不同的高山土壤(晚融雪点LSM和早融雪点ESM)中真核微生物的基因表达,探索植物与土壤真核微生物的功能关联。数据集包含12个文件,涵盖转录组序列数据、注释说明及上下文数据,可用于分析土壤微生物代谢通路差异及生态系统功能关联。 文件详解...
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  • Ofu_Island_Reef_Lagoon_珊瑚热胁迫转录组弹性与白化抗性研究数据

    2026年1月14日 30 102 86

    数据集概述 本数据集为Ofu岛(美属萨摩亚)礁湖珊瑚热胁迫实验的转录组研究数据,包含20个Acropora hyacinthus珊瑚群体在29℃(对照)和35℃(加热)条件下暴露5小时、20小时后的白化情况与转录组响应数据,涉及基因表达调控、转录组弹性与白化抗性的关联分析,共8个文件。 文件详解 设计与原始数据文件...
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  • Eriophyoidea_Based_植食性瘿螨类高级系统发育与线粒体基因组研究数据

    2026年1月14日 30 177 93

    数据集概述 本数据集围绕植食性瘿螨类(Eriophyoidea)的高级系统发育研究展开,包含153种瘿螨的完整线粒体基因组测序结果,涉及54种线粒体基因重排模式。数据支持瘿螨类整体及内部6个分支的单系性,结合分子定年揭示其起源于三叠纪、白垩纪多样化的特征,与被子植物演化相关。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Salmon_Hybridization_奇努克与银大麻哈鱼杂交繁殖与转录组研究数据

    2026年1月14日 0 179 28

    数据集概述 本数据集围绕奇努克与银大麻哈鱼的杂交潜力及后果展开,包含行为繁殖实验、体外受精实验结果及全转录组基因表达数据,用于分析两者间不完全的繁殖隔离机制及杂交后代的转录组响应,涉及18个相关文件。 文件详解 代码文件...
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  • Phasmid_Wings_Evolution_竹节虫翅膀进化可逆性宏进化分析数据集

    2026年1月14日 30 137 53

    数据集概述 本数据集为竹节虫翅膀进化可逆性的宏进化分析研究提供支持,包含超300种竹节虫的基因序列、系统发育树、性状数据及分析文件。数据用于探究复杂性状(翅膀)在进化中丢失后重新获得的可能性,揭示翅膀进化的动态可逆过程,支持物种分化速率与性状进化关系的研究。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式,共8个) 12s.fasta:12S基因序列比对文件...
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  • Didimosphenia_geminata_Based_全球种群遗传多样性研究数据

    2026年1月14日 30 23 12

    数据集概述 本数据集包含硅藻Didimosphenia geminata的序列与形态数据,涉及全球多个地区种群。数据用于研究该物种的全球遗传多样性、地理分布格局及入侵机制,支持 phylogeographic 分析,探究其跨半球扩散与全球环境变化的关联。 文件详解 图像文件(.tif格式,12个文件)...
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  • OGRDB开放的种系受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGKV基因胚系参考数据集

    2026年1月14日 30 73 37

    数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠BALB/c/ByJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区(IGKV)基因胚系参考集,包含基因序列及相关元数据,为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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  • OGRDB_Based_小鼠LEWES_EiJ品系IGKV免疫球蛋白受体种系参考数据集

    2026年1月14日 30 106 54

    数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠LEWES/EiJ品系免疫球蛋白κ链可变区(IGKV)受体种系参考集,包含4个文件,涵盖序列数据、元信息及许可文件,为免疫遗传学研究提供标准化的种系受体序列资源。 文件详解 EiJ IGKV_rev_1.json 文件格式:JSON...
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  • Pythium_Comparative_Genomics_植物病原卵菌毒力策略研究数据

    2026年1月14日 30 56 2

    数据集概述 本数据集包含十三种不等鞭毛类物种(含十一种植物病原卵菌)的比较基因组学分析数据,重点研究卵菌致病相关的基因组特征,如分泌效应子、细胞壁降解酶等毒力相关基因家族的扩张与差异,揭示不同卵菌(如疫霉属、腐霉属)的毒力策略演化机制,共含十二份文件。 文件详解 文档文件(.txt格式,共6个)...
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  • Genomic_basis_coral_climate_resilience_研究数据

    2026年1月14日 30 207 53

    数据集概述 本数据集聚焦珊瑚对气候变化的基因组适应性机制,通过RNA-Seq技术比较热敏和耐热珊瑚的转录组基因表达差异,识别与珊瑚抗逆性相关的分子通路,包括热休克蛋白、抗氧化酶等关键基因的表达特征,为理解珊瑚应对环境胁迫的生理机制提供基础数据。 文件详解 文件名称:33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta.zip...
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  • North_Pacific_Based_港湾鼠海豚SNP微单倍型线粒体控制区单倍型数据

    2026年1月14日 30 9 6

    数据集概述 本数据集包含北太平洋港湾鼠海豚的SNP、微单倍型基因型及线粒体控制区单倍型序列数据,覆盖加州至不列颠哥伦比亚南部沿岸及内陆水域样本。通过292个位点的多重扩增子测序(271个样本)和mtDNA序列(413个样本),揭示种群遗传结构、隔离距离模式及潜在适应性,为该近岸物种保护管理提供依据。 文件详解...
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  • CPR_Genome_Subset_Jaffe_et_al_2020_微生物基因组数据

    2026年1月14日 30 210 142

    数据集概述 本数据集为Jaffe et al. 2020论文相关的候选门辐射(CPR)基因组子集,内容为CPR微生物的基因组序列数据,以压缩包形式存储,可用于微生物基因组学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称:jaffe_et_al_cpr_genomes.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含与Jaffe et al....
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  • Triturus_Based_平衡致死系统比较基因组学研究数据_Version_1_0

    2026年1月14日 30 130 79

    数据集概述 本数据集记录了用于研究Triturus蝾螈平衡致死系统比较基因组学的生物信息学流程,包含连锁图谱、目标捕获序列、原始数据关联信息及分模块研究内容压缩包,支持对该特殊遗传系统的进化机制分析,共含4个核心文件。 文件详解 文件名称:Triturus and Lissotriton Linkage Maps.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Amplicon_sorter_Based_无参考扩增子排序与共识序列构建工具配套数据

    2026年1月14日 30 110 42

    数据集概述 本数据集为Amplicon_sorter工具的配套数据,该工具用于基于序列相似性和长度对Oxford Nanopore Technologies(ONT)测序的扩增子进行无参考排序,并构建高质量共识序列。数据集包含6个文件,支持工具的使用与验证,适用于生态学研究中扩增子测序数据的分析。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Tympanuchus_cupido_Based_草原松鸡免疫基因选择漂变对比研究数据

    2026年1月14日 30 109 103

    数据集概述 本数据集为草原松鸡免疫基因研究数据,包含主要组织相容性复合体(MHC)等免疫受体基因与免疫介导基因的序列、基因型及种群比较数据,用于验证不同功能免疫基因在选择与遗传漂变上的差异假设,涉及9个相关文件。 文件详解 序列与基因型文件 文件名称:T. cupido MHC class II sequences alignment.fasta、T....
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