数据集概述
本数据集围绕新几内亚西部发现的黑鹟科（Melanocharitidae）新种Satin Berrypecker（Melanocharis citreola）展开，包含该新种的形态特征记录及基于线粒体基因组和核基因数据的系统发育分析结果，同时揭示了黑鹟科的演化历史、起源时间及属级分类调整依据，共含5个相关文件。
文件详解
- ReadMe.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，可能包含数据背景、文件清单及使用说明
- Melano_mitochondrial_BEAST2_BD.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：线粒体数据集的BEAST2分析文件，用于贝叶斯分歧时间估算（BD模型相关参数配置）
- Melano_mitochondrial_BEAST2_Y.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：线粒体数据集的BEAST2分析文件，包含系统发育分析相关参数配置
- Melano_nuclear_alignment_reduced.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：简化后的核基因序列比对文件，已移除仅含N的位点，用于系统发育分析
- Melano_nuclear_reference.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：核基因参考序列文件，基于McCormack et al. (2013)和Prum et al. (2015)的UCE数据构建，序列间以2000个N分隔，用于系统发育分析前的reads mapping
数据来源
论文“A new, undescribed species of Melanocharis berrypecker from western New Guinea and the evolutionary history of the family Melanocharitidae”
适用场景
- 鸟类新种分类学研究：基于新种形态特征及分子数据，验证黑鹟科新种的分类地位
- 鸟类系统演化分析：利用线粒体和核基因数据，重建黑鹟科的系统发育关系
- 生物地理演化研究：分析黑鹟科的起源时间、分化节点与新几内亚地质抬升的关联
- 分子分类学应用：依据种间遗传距离（COI基因8.8%、ND2基因12.4%），探讨鸟类物种界定标准
- 分类系统修订：支持Rhamphocharis属并入Melanocharis属的分类调整论证
