数据集概述
本数据集围绕被子植物重组率、基因组结构与分子进化的关系展开，包含3个文件，用于研究植物重组率对基因组大小、基因家族演化及分子选择压力的影响。数据支持系统发育比较分析，可揭示重组率在植物基因组宏观进化中的作用。
文件详解
- matK_opt.mf.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含matK基因的优化多序列比对数据，用于分子进化分析中的基因序列比对基础
- RRsTree.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：被子植物重组率相关的系统发育树文件，记录物种间的进化关系，支持系统发育比较分析
- CodonAlignments.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：包含密码子水平的基因序列比对数据压缩文件，为分析非同义/同义替换率（dN/dS）提供基础数据
数据来源
论文“The relationship of recombination rate, genome structure, and patterns of molecular evolution across angiosperms”
适用场景
- 植物基因组进化研究：分析重组率与基因组大小、LTR反转录转座子含量的相关性
- 分子选择压力分析：利用dN/dS数据研究重组率对净化选择效率的影响
- 基因家族演化研究：探讨重组率在基因重复保留或家族扩张中的作用
- 系统发育比较分析：结合系统发育树与重组率数据，揭示植物物种间重组率的进化模式
- 重组相关蛋白进化研究：分析重组蛋白dN/dS变化与重组率变化的关联
