-
Stenotrophomonas_Based_囊性纤维化及慢性呼吸道感染患者分离株分类耐药性毒力基因研究数据
数据集概述 本数据集包含2003-2016年从5个国家慢性呼吸道感染患者(含囊性纤维化)样本中分离的111株嗜麦芽窄食单胞菌相关菌株的基因组、耐药性及毒力基因数据。通过ANIb、16S rDNA等分析,明确菌株分类(含65株嗜麦芽窄食单胞菌、6株帕瓦尼窄食单胞菌及40株潜在新种),并记录耐药基因、毒力基因分布及表型耐药水平,总计62个文件。 文件详解...
-
E_coli_Isolates_Genetic_and_Phenotypic_Features_Dataset
数据集概述 本数据集包含大肠杆菌(E. coli)分离株的全部遗传决定因素与表型特征信息,通过结构化表格形式呈现,为微生物遗传学与表型关联研究提供基础数据支撑,总计包含一个文件。 文件详解 文件名称:Table S1.xlsx 文件格式:XLSX...
-
BeONE项目病原菌基因组多样性数据集1_2
数据集概述 本数据集是BeOne项目WP1-T2编译的匿名数据集,包含李斯特菌、沙门氏菌、大肠杆菌(STEC)和空肠弯曲菌的测序读数及元数据,旨在捕捉这些病原菌种群的基因组多样性,共涵盖三千八百八十四株分离株的相关数据。 文件详解 文件名称: D-BeONE.1.2_v2.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
-
菠菜霜霉病抗性突破进化的泛基因组图谱分析数据集
数据集概述 本数据集围绕19株菠菜霜霉病菌(Peronospora effusa)分离株展开比较研究,包含各分离株的基因组组装、基因注释、重复序列注释及分相变异数据,用于构建泛基因组图谱及9号染色体分相图谱,支持抗性突破进化机制分析。 文件详解 基因组组装文件: genome_assembly.zip(ZIP格式):包含19株分离株的基因组组装数据...
-
北京东灵山树木溃疡与枯梢相关间座壳目真菌分离株及GenBank登录号表
数据集概述 本数据集为北京东灵山地区树木溃疡与枯梢相关间座壳目真菌的分离株信息表,包含不同真菌物种、菌株编号、宿主植物及对应的多基因片段GenBank登录号,为该区域树木病害相关真菌研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Species: 真菌物种名称 Strain:...
-
挪威牛呼吸道疾病暴发中牛呼吸道合胞体病毒的发生与系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集围绕挪威牛呼吸道疾病(BRD)暴发中牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)的发生情况与系统发育分析展开,包含BRSV感染检测结果、G基因序列分析及遗传进化关系研究相关资料,为探究BRSV在挪威BRD流行中的病原学作用提供数据支持。 文件详解 文件名称:Amino acid sequences 60 to 215 of the G...
-
东南亚人工林土壤新种柱枝顶孢属系统发育树补充材料4
数据集概述 该数据集为2018年发表的东南亚人工林土壤柱枝顶孢属新种研究的补充材料4,包含基于ITS序列比对的最大似然法系统发育树及节点注释说明,用于展示物种间的亲缘关系。 文件详解 文件名称: oo_191540.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 包含系统发育树(Figure S4)及解释说明,节点标注≥60%的MP/ML分析...
-
东南亚人工林土壤新物种Cylindrocladiella补充材料3
数据集概述 该数据集为东南亚人工林土壤新物种Cylindrocladiella研究的补充材料3,包含基于tub2序列比对构建的系统发育树PDF文件,记录了最大似然法分析结果及相关标注信息。 文件详解 数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: oo_191539.pdf - 文件格式: PDF (.pdf) - 文件内容:...
-
hysterocinetids物种基因序列特征与来源数据表
数据集概述 该数据集为学术论文中的表格数据,记录了hysterocinetids物种的核基因与线粒体基因序列特征及来源信息,包括18S rRNA、ITS1-5.8S-ITS2-28S rRNA、16S rRNA和细胞色素c氧化酶亚基I的序列长度、GC含量及GenBank登录号等核心数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML...
-
地衣类真菌凭证标本与基因库登录号数据集
数据集概述 本数据集为地衣类真菌研究的凭证标本与基因库登录号数据表,包含多个属种的分类单元信息、采集地、采集者、标本编号、标本馆、分离株及mtSSU、nuLSU基因的GenBank登录号,新生成序列以粗体标注,为相关分类学与系统发育研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
-
匈牙利牛支原体分离株系统发育数据集
数据集概述 本数据集围绕匈牙利牛支原体分离株的系统发育研究,通过多位点序列分型(MLST)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)两种方法,对三十一株匈牙利牛支原体分离株的基因型特征、分型结果及系统发育关系进行记录,为牛支原体的分型方法应用提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
-
STEC感染临床结局预测补充数据集
数据集概述 本数据集为STEC感染临床结局预测相关研究的补充数据,包含测试集分离株结局预测、特征注释、SHAP值、模型超参数调优等多类文件,为分析STEC感染临床结局预测模型提供支持。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件,内部包含多个补充数据集,具体说明如下: - 文件名称: STEC_ML_Supplementary_dataset.zip -...
-
海鳃属分子形态学研究物种样本数据表
数据集概述 该数据集为一篇关于海鳃属(Gyrophyllum)分类研究论文中的补充表格数据,包含多个海鳃物种样本的分类学、地理分布及分子序列信息,为海鳃属的系统分类提供数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段说明: species name: 物种名称 catalog nos / isolate /...
-
东南亚人工林土壤新种柱枝顶孢属系统发育树补充材料2
数据集概述 本数据集为东南亚人工林土壤新种柱枝顶孢属研究的补充材料,包含基于tef1序列比对的最大似然法系统发育树,标注了支持值、模式菌株及本研究分离株信息,用于辅助物种分类鉴定。 文件详解 文件名称:oo_191538.pdf 文件格式:PDF...
-
拟南芥_灰霉病菌互作系统中茉莉酸与水杨酸网络数据集
数据集概述 本数据集围绕拟南芥与灰霉病菌互作系统展开,测试宿主防御系统对病原菌遗传变异的响应。包含拟南芥野生型及茉莉酸、水杨酸信号突变体受96种灰霉病菌分离株侵染后的防御表型与转录组数据,揭示病原菌遗传变异对植物防御系统转录水平的影响。 文件详解...
-
印度西高止山脉新物种Pterobryopsis_siheiana标本与基因序列数据表格
数据集概述 该数据集为表格形式,记录了印度西高止山脉地区Pterobryopsis属(包括新物种Pterobryopsis siheiana)的标本信息及核ITS序列的GenBank登录号,支持苔藓植物分类学研究。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML (.html)...
-
转座子群体水平入侵引发真菌病原体基因组扩张数据集
数据集概述 本数据集为博士论文第一章的补充文件,围绕转座子(TE)群体水平入侵引发真菌病原体基因组扩张的研究主题,包含实验验证相关的图表源数据和补充说明文件,支持对该生物学机制的深入分析。 文件详解 该数据集包含19个文件,具体说明如下: - TXT格式源数据文件(共8个): -...
-
巴基斯坦假精子属新种系统发育分析分离株数据集
数据集概述 本数据集为Table 1的内容,记录了用于巴基斯坦假精子属(Pseudosperma)新种系统发育分析的分离株信息,包括物种、分离株编号、地理起源、GenBank登录号及参考资料,标注了不同数据集的使用情况,为该属物种的分类学研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: 巴基斯坦假精子属新种系统发育分析分离株数据表 文件格式: 表格数据...
-
核盘菌异交推断数据集
数据集概述 该数据集围绕同宗配合真菌核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)的异交现象展开,通过连锁不平衡衰减分析探究其异交频率。包含12个微卫星标记的基因型数据及连锁不平衡分析结果,为研究该真菌的交配系统提供实证支持。 文件详解 文件名称: List of Microsatellite Alleles.pdf 文件格式: PDF...
-
巴西米纳斯吉拉斯州小麦瘟病菌基因分型多重扩增子测序数据集
数据集概述 本数据集包含巴西米纳斯吉拉斯州2019年小麦瘟疫情期间采集的81株小麦瘟病菌(MoT)分离株的基因分型数据,通过84个SNP标记区分2016年南亚出现的克隆谱系与其他基因型,为小麦瘟病菌研究提供开放科学资源。 文件详解 文件名称:02-SupplementalDataset_1_Information of 81 isolates.xlsx...



