数据集概述
本数据集包含2003-2016年从5个国家慢性呼吸道感染患者（含囊性纤维化）样本中分离的111株嗜麦芽窄食单胞菌相关菌株的基因组、耐药性及毒力基因数据。通过ANIb、16S rDNA等分析，明确菌株分类（含65株嗜麦芽窄食单胞菌、6株帕瓦尼窄食单胞菌及40株潜在新种），并记录耐药基因、毒力基因分布及表型耐药水平，总计62个文件。
文件详解
- 基因组序列文件
- 文件名称：遵循
STE-BAB-IMI-xxxxxx.fna模式（如STE-BAB-IMI-103266.fna）
- 文件格式：FNA
- 字段映射介绍：共55个，存储菌株的基因组核苷酸序列
- 文本说明文件
- 文件名称：accession_nrs-V2.txt、blaL1-AA.txt、blaL2-AA.txt等
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：共5个，包含菌株登录号映射、L1/L2 β-内酰胺酶氨基酸序列等信息
- 数据汇总文件
- 文件名称：Data_file_Stenotrophomonas.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含菌株的毒力基因（如碱性血清蛋白酶stmPr1-3、DNase、磷脂酶等）检测结果字段
- 说明文档
- 文件名称：README.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集整体说明文档
适用场景
- 细菌分类学研究：用于嗜麦芽窄食单胞菌属的分类修订，明确潜在新种的分类地位
- 耐药机制分析：研究菌株的耐药基因分布与表型耐药水平的关联
- 毒力因子研究：分析毒力基因（如Xps II分泌系统、RPF群体感应系统）的分布特征及其与致病性的关系
- 临床微生物诊断优化：为临床准确鉴定嗜麦芽窄食单胞菌属菌株提供数据支持
- 致病性差异研究：对比潜在新种与已知种在耐药、毒力基因上的差异，探讨其致病性差异
