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SqCL_保守位点_鳞目爬行动物_系统发生学_群体遗传学
数据集概述 本数据集为爬行动物保守基因座（SqCL）相关数据，整合UCE、AHE及传统系统发育基因座生成统一探针集，包含44种爬行动物的测序数据，覆盖约33%陆生脊椎动物多样性，可用于系统发育组学和群体遗传学研究，验证基因座效用并比较不同基因座集的实用性。 文件详解 PRG.zip 文件格式：ZIP 内容说明：可能包含探针集相关的程序或参考基因组文件...
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詹妮弗_E_格利森博士论文的补充材料_生物信息学相关数据
数据集概述 本数据集为Jennifer E. Gleason博士论文的补充材料，包含生物信息学数据处理相关的方法文档、代码及原始数据，共6个文件，涉及数据清洗协议、R代码及JAMP处理后的原始CSV数据，支持论文研究内容的可重复性验证与扩展分析。 文件详解 文档类文件 文件名称：Appendix1_DataCleaningMethods.docx...
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miRNA_NEN_神经内分泌肿瘤分子特征与分类研究数据
数据集概述 本数据集基于378个miRNA表达谱，经预处理后包含221例神经内分泌肿瘤（NEN）样本和114例非NEN样本，覆盖15种NEN病理类型及5组部位匹配的非NEN对照组。通过miRNA表达谱分析，明确NEN与非NEN的分子差异，识别关键miRNA标志物，并构建机器学习分类器，为NEN的分子分类提供数据支持。 文件详解...
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Dr_Disco_Based_RNA测序融合转录本检测数据
数据集概述 本数据集是Dr. Disco研究中，基于RNA测序数据检测融合转录本及其基因组断点的大型合并结果表格，包含该研究所有样本的检测数据。数据以单一表格文件呈现，用于记录所有检测到的结构变异（SVs）信息，为基因融合相关的医学研究提供结构化参考。 文件详解 文件名称：Table S03 - All detected SVs.xlsx...
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NGS_Based_奥胡斯大学暑期学校生物信息学教学数据集
数据集概述 本数据集为奥胡斯大学NGS暑期学校的教学用数据集，包含3个压缩文件，涉及生物信息学领域的细胞相关数据，主要用于支持下一代测序（NGS）相关的教学实践与数据分析学习。 文件详解 压缩文件1： 文件名称：alignedData.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包，推测包含已比对的NGS数据相关文件，具体内容未提供预览 压缩文件2：...
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基于超分辨率核糖体谱分析的拟南芥核糖体翻译事件测序数据档案
数据集概述 本数据集通过超分辨率核糖体图谱技术，对拟南芥mRNA翻译事件进行测序分析，实现单转录本层面的3碱基周期性解析，覆盖超90%主阅读框足迹，可精准识别注释及未注释的翻译开放阅读框（ORF），包括非编码RNA、假基因中的小ORF，为植物基因组学研究提供资源。 文件详解 文件名称：for_dryad.zip 文件格式：ZIP...
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Sorghum_Based_高粱B染色体有无植株比较分析数据
数据集概述 本数据集为高粱（Sorghum purpureosericeum）B染色体有无植株的比较分析数据，包含B阳性与B阴性植株的测序数据、重复序列组装簇及比较分析结果，用于识别B染色体特异性重复序列簇及开发相关分子标记。 文件详解 文件名称：Spu_reads_B_positive.fasta 文件格式：FASTA...
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NGS_Based_犬发情期阴道微生物组与繁殖力关联研究数据
数据集概述 本数据集为犬发情期阴道微生物组与繁殖力关联研究的支撑数据，包含80只健康繁殖母犬发情早期的阴道微生物组NGS测序数据及繁殖力评估结果，通过非培养法分析微生物组整体特征，并关联受孕与否的差异，是该领域首个结合NGS数据与繁殖力的研究数据。 文件详解 项目说明文档 文件名称：readme data of project the canine...
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Data_Based_奶牛瘤胃微生物群落非侵入性样本评估数据
数据集概述 本数据集围绕奶牛瘤胃微生物群落非侵入性样本替代评估展开，包含瘤胃瘘管直接获取的瘤胃食糜、口腔液、反刍食糜（食团）及粪便样本的微生物群落分析数据。通过5×5拉丁方设计，对五头奶牛在不同脂质补充剂处理下的样本进行qPCR及16S、18S rRNA基因和真菌ITS1扩增子测序，比较不同样本类型与瘤胃食糜的微生物群落差异。 文件详解 序列元数据文件...
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Argonne_Based水貂粪便微生物组影响因素研究数据集
数据集概述 本数据集包含水貂粪便微生物组研究相关的元数据、测序序列、分析代码及流程文件，涉及性别、温度和排便后时间对水貂粪便微生物组的影响分析，支持复现Lafferty et al. 2021研究结果，共5个文件。 文件详解 SD1 Mink metadata.tsv（TSV格式）...
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eDNA_Based干燥植物材料节肢动物_植物关联监测研究数据
数据集概述 本数据集围绕干燥植物材料中的环境DNA展开，通过 metabarcoding 技术分析节肢动物-植物关联。研究验证了干燥植物材料作为节肢动物群落eDNA来源的可行性，涵盖两种实验的测序数据、序列比对文件及补充表格，共包含五个文件，可用于生物多样性监测、物种地理溯源等研究。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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芦笋转座子元件分析_河南师范大学植物基因组学数据库_2014年
数据集概述 本数据集为芦笋（Asparagus officinalis）基因组中转座子（TEs）的分析数据，基于男女芦笋基因组的Illumina HiSeq2000测序及生物信息学分析生成。数据包含17 Gb序列（12×覆盖度），组装为163,406个 scaffolds（总长400...
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NETTAG_葡萄牙莱肖埃斯港_塑料渔网微生物群落原位实验数据
数据集概述 本数据集来自NETTAG+项目在葡萄牙莱肖埃斯港休闲码头开展的为期一年的原位实验，包含三种塑料渔网（编织聚乙烯、编织尼龙、薄尼龙）表面附着的微生物群落及分离菌株数据，支持相关科学论文研究，共56个文件。 文件详解 原始16S扩增子测序数据...
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eDNA_River_Based河流生物多样性信息整合评估数据
数据集概述 本数据集为河流环境DNA（eDNA）生物多样性研究相关数据，通过eDNA metabarcode方法检测河流流域内真核生物多样性，覆盖19个门、296个科，验证了河流eDNA作为跨陆地-水界面、大空间尺度生物多样性整合评估工具的可行性，包含1个文件。 文件详解 文件名称：reads per site_dryad.xlsx 文件格式：XLSX...
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叶蛛科系统发育研究补充材料_北美蜘蛛分类与基因组数据_2025年
数据集概述 本数据集为北美Cybaeid蜘蛛系统基因组学研究的补充材料，包含所有纳入类群的详细凭证信息，涉及凭证代码、数据来源、分类学信息、地理位置、GenBank和SRA编号等内容，为蜘蛛分类学与基因组学研究提供标准化样本支撑。 文件详解 文件名称：oo_1243100.xlsx 文件格式：XLSX...
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Japan_Metagenome_Based日本宏基因组原始数据
数据集概述 本数据集为日本宏基因组原始数据，包含一份压缩文件，无额外目录结构或数据拆分，文件类型单一为压缩包，未提供自述文件或内容预览。 文件详解 文件名称：Japan_RawData.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：未提供文件内容预览，无法获取具体字段信息。 适用场景 宏基因组测序数据预处理:...
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AMF_Based_生态系统退化过程中丛枝菌根真菌多样性变化数据
数据集概述 本数据集记录了全球生物多样性热点地区一个超过200万年沙丘时间序列中，生态系统退化过程中丛枝菌根真菌（AMF）多样性的变化。通过对根和土壤样本的核糖体RNA基因测序，分析不同磷含量土壤中AMF群落组成与多样性，揭示土壤磷有效性对AMF多样性的阈值效应，包含13个相关文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：Table...
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PREFFECT_Based_FFPE转录组学生成式建模合成数据集
数据集概述 本数据集包含论文“Generative and integrative modeling for transcriptomics with formalin fixed paraffin embedded...
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数据16SMaRT_Based_肉类微生物组样本SRA编号与元数据
数据集概述 本数据集为16SMaRT Dataset，包含肉类微生物组样本的SRA编号及元数据信息，用于记录肉类相关微生物样本的基础标识与描述性数据。数据集仅含1个文件，无目录结构，未划分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据，便于快速获取肉类微生物样本的核心元数据信息。 文件详解 文件名称：16SMaRTDatasetxlsx.xlsx...
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Arctic_fungal_北极植被与根际真菌群落环境响应研究数据
数据集概述 本数据集围绕北极地区Bistorta vivipara植物根际真菌群落（RAF）与地上植被对微尺度环境梯度的响应差异展开，包含采样数据、测序结果、分析脚本等9个文件，用于探究两者空间结构及驱动因素的关联性。 文件详解 压缩文件（Archive files） 文件名称：sm3.744.zip、sm1.742.zip、sm2.743.zip...
