数据集概述
本数据集来自NETTAG+项目在葡萄牙莱肖埃斯港休闲码头开展的为期一年的原位实验,包含三种塑料渔网(编织聚乙烯、编织尼龙、薄尼龙)表面附着的微生物群落及分离菌株数据,支持相关科学论文研究,共56个文件。
文件详解
- 原始16S扩增子测序数据
- 文件名称:遵循NetTag_XXX_R1/R2_001.fastq.gz模式(如NetTag_NLCR1020_R1_001.fastq.gz)
- 文件格式:fastq.gz
- 字段映射介绍:包含27个样本的微生物群落原始测序数据,已上传至欧洲核苷酸档案库(ENA登录号PRJEB62111)
- 细菌菌株16S rRNA共识序列
- 文件名称:16S_isolates_in situ.fasta
- 文件格式:fasta
- 字段映射介绍:记录分离得到的细菌菌株的16S rRNA共识序列
- Excel补充数据文件
- 文件名称:Dataset_Zenodo.xlsx
- 文件格式:xlsx
- 字段映射介绍:包含ASV丰度表、分类表、菌株系统发育鉴定表、环境参数、无机营养盐水平等补充数据
数据来源
Scientific Reports论文"Microbial communities associated with plastic fishing nets: Diversity, potentially pathogenic and hydrocarbon degrading bacteria"
适用场景
- 海洋塑料垃圾微生物组研究:分析不同材质塑料渔网表面微生物群落的多样性及组成特征
- 潜在致病菌与烃降解菌研究:识别渔网附着微生物中的潜在致病菌及烃类降解功能菌
- 海洋环境微生物生态学分析:探究海洋休闲码头环境中塑料基质对微生物定殖的影响
- 微生物测序数据挖掘:基于16S扩增子测序数据开展微生物多样性及群落结构分析
- 环境参数关联研究:结合环境因子数据解析微生物群落与环境变量的相关性