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查万等人_基于Dryad平台的遗传学研究_大肠杆菌种群规模与适应性权衡及生态特化研究数据
数据集概述 本数据集为大肠杆菌种群大小与适应性权衡关系的实验进化研究数据,探讨不同种群大小对适应性权衡和生态特化的影响。通过在两种营养限制环境中培养不同大小的大肠杆菌种群,从三个视角分析适应性权衡,并扩展至六种环境对验证结果普适性,揭示种群大小与适应性代价、生态特化的关联。 文件详解...
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Model_CLO_etal_2020_JEB_自交种群隐遗传变异与短期适应潜力研究数据
数据集概述 本数据集围绕自交种群的隐遗传变异展开研究,通过模拟环境变化下的种群稳定选择,验证自交种群在高突变率下可通过遗传关联储存更多遗传变异,环境变化后释放变异提升适应性,而低突变率下适应性低于异交种群,为自交物种适应潜力研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Model_CLO_etal_2020_JEB.zip 文件格式:ZIP...
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Jofre_Rosenthal_Based_基因组数据地理渐变分析误差率研究数据_原始数据
数据集概述 本数据集为基因组数据地理渐变分析误差率研究的原始数据,包含基于正向时间个体模拟的不同进化场景(年龄、漂变、迁移、选择类型)下的误差率结果,涉及假阳性比例、模拟参数及实验数据等内容,可用于验证地理渐变分析的稳健性,共含五十份文件。 文件详解 Excel文件(.xlsx,48个)...
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蓝花丹_Lobelia_siphilitica_基因漂移与基因流及雌性植物地理分布研究数据
数据集概述 本数据集记录了雌雄异株植物Lobelia siphilitica的种群性别比例、种群大小及遗传标记数据,旨在评估遗传漂变和基因流对雌性植物地理分布的影响。数据集包含92个种群的调查数据及质体、核基因标记的基因型信息,支持分析性别比例空间结构与遗传多样性的关联。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX...
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Dryad_Ecography_ECOG_02995_驯鹿遗传生态分化关联研究数据2017
数据集概述 本数据集来自驯鹿(Rangifer tarandus)遗传与生态分化关联研究,旨在分析环极地分布有蹄类种群遗传分化的驱动机制,包括环境适应、地理隔离、遗传漂变及更新世冰期历史隔离的相对作用。数据覆盖全分布范围及区域尺度分析,整合多种隔离机制检验结果,为理解大型哺乳动物基因流与景观互作提供支持,包含一个文件。 文件详解...
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Dryad_InfrapopulationExperiment_寄生植物繁殖影响因素实验数据
数据集概述 本数据集为寄生植物(沙漠槲寄生)繁殖实验数据,基于“种群大小与配偶可获得性影响寄生植物繁殖成功率”研究,记录实验中寄生植物种群特征(如种群大小、配偶可获得性)与繁殖指标(花粉接收、果实产量等)的关联数据,支持寄生植物繁殖影响机制的分析。 文件详解 文件名称:InfrapopulationExperiment_DryadData.xlsx...
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Hale_et_al_PLOS_One_Based_紫瓶子草节肢动物共生体对生长繁殖影响研究数据
数据集概述 本数据集来自PLOS One论文研究,聚焦西卡罗来纳州山区紫瓶子草(Sarracenia purpurea var. montana)的共生体群落与植物生长繁殖的关系。数据记录了节肢动物共生体群落多样性对宿主植物营养生长、次年开花量的影响,以及不同地理种群中植物种群大小与共生体多样性的关联,为理解植物-共生体互作提供实证支持。 文件详解...
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Evolution_Reassessment_Based线粒体与核基因组渐渗不一致性解释重评估数据
数据集概述 本数据集为论文“A reassessment of explanations for discordant introgressions of mitochondrial and nuclear...
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Dryad_Based_陆地兰花Gymnadenia_conopsea近交衰退与杂种优势预测数据_2020
数据集概述 本数据集记录了陆地兰花Gymnadenia conopsea的杂交实验数据,通过对20个不同大小和密度种群的自交、种群内异交及种群间异交实验,分析种群大小和密度对近交衰退、杂种优势及种子阶段种群平均适合度的影响,为物种保护管理提供依据。 文件详解 文件名称:Dryad_crossing_data.xlsx 文件格式:XLSX...
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Zhoushan_Archipelago_Based_舟山群岛黑斑侧褶蛙种群遗传多样性与隔离时间关系研究数据
数据集概述 本数据集为舟山群岛及邻近大陆黑斑侧褶蛙种群遗传多样性研究数据,通过9个微卫星标记分析24个岛屿和3个大陆位点共810只蛙的遗传多样性及分化,探究岛屿面积、种群大小、隔离时间等因素对遗传多样性损失的影响,为破碎化种群保护提供依据。 文件详解 文件名称:Microsatellite data.xls 文件格式:XLS...
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ABC_Based_野生动物病原体Tracheliastes_polycolpus时空动态与进化参数研究数据
数据集概述 本数据集为研究新兴野生动物病原体Tracheliastes polycolpus的时空动态提供支持,通过近似贝叶斯计算(ABC)方法追溯其在西欧的传播历史与进化参数,包含样本详情与基因型数据,助力理解该病原体的引入时间、扩散路径及种群动态特征。 文件详解 文件名称:SampleDetails_Genotypes_MEC15-500.xlsx...
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Pygospio_Seasonal_Genetic_Based丹麦峡湾多毛类蠕虫种群动态数据2014_2015
数据集概述 本数据集记录丹麦Isefjord-Roskilde-Fjord河口4个站点、2014年3月至2015年2月6个时间点的多毛类蠕虫Pygospio elegans季节性遗传变异数据,包含遗传分化、种群动态及繁殖成功差异等核心内容,用于研究发育多态性对种群遗传结构的影响。 文件详解...
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Epipterygium属生物地理学与整合分类学附录3数据集
数据集概述 本数据集为《Epipterygium属生物地理学与整合分类学》的附录3,包含基于路径抽样和阶梯式分析方法,对严格时钟与不相关对数正态松弛时钟下的Yule模型、Birth-Death模型及恒定种群大小的Coalescent模型进行的模型比较数据。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML (.html)...
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网状系统发育与基因树联合估计数据集
数据集概述 本数据集围绕多物种网络溯祖模型(MSNC)展开,包含联合估计网状系统发育、基因树、分化时间及种群大小的贝叶斯方法研究内容,通过模拟数据与实证数据验证方法有效性,强调同时考虑网状进化与不完全谱系分选的重要性。 文件详解 文件名称: WenNakhleh-SI.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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日本群岛红狐种群线粒体DNA序列人口动态分析表4
数据集概述 该数据集为学术论文《日本群岛高度扩散的广食性赤狐(Vulpes vulpes)的复杂地质历史促进异域进化:多个系统发育群》中的表4,记录日本本州和北狐两个亚种基于线粒体DNA cytb基因和D-loop区域联合序列计算的人口动态参数。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 核心内容:...
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基因流动下的物种定义研究数据集
数据集概述 本数据集围绕“基因流动存在时如何定义物种”这一核心问题展开研究,通过多物种溯祖模型分析基因流动对种内与种间遗传差异的影响,揭示了特定条件下种内遗传相似性低于种间的现象,强调少量基因流动对物种遗传历史的显著作用。 文件详解 文件名称: 2020JiaoDefineSpeciesGeneFlow-SI.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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系统发育模式中的微进化过程特征数据集
数据集概述 该数据集围绕系统发育树中的微进化过程特征展开,通过空间显式模型模拟同域与邻域物种形成,分析系统发育树的结构属性(如树平衡度、多样化速度)与物种形成过程的关联,验证模型预测与实证数据的一致性,为理解进化辐射的多样化模式提供数据支持。 文件详解...
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基因流对物种树估计影响的模拟研究数据集
数据集概述 该数据集基于模拟研究,探究基因流与不完全谱系分选对物种树估计的影响。通过模拟不同模型、规模、时间尺度和迁移率下的多基因座序列数据,分析贝叶斯方法及汇总统计方法对物种树拓扑结构、种群大小和分化时间的估计误差,为系统发育研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplemental Materials.pdf 文件格式: PDF...
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宿主_寄生虫协同进化速度与基因组足迹数据集
数据集概述 本数据集围绕宿主与寄生虫协同进化动力学展开研究,对比“堑壕战”与“军备竞赛”两种极端场景下的进化特征,通过有限种群模型和溯祖模拟分析基因组足迹差异,为理解协同进化的分子机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: stochastic-cstPopSize-GFG-Tellier.r 文件格式: R语言脚本文件(.r) 内容说明:...
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重组对物种树分析影响研究数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育学中重组对物种树分析的影响展开,探讨种内重组作为基因树与物种树不一致的潜在来源,分析其对不同物种树方法(如合并法)的干扰及与物种形成历史要素的相互作用。 文件详解 文件名称: species_trees.nex:NEX格式文件,可能包含用于物种树分析的系统发育数据,如基因序列或树结构信息。 文件名称:...



