系统发育模式中的微进化过程特征数据集

数据集概述

该数据集围绕系统发育树中的微进化过程特征展开,通过空间显式模型模拟同域与邻域物种形成,分析系统发育树的结构属性(如树平衡度、多样化速度)与物种形成过程的关联,验证模型预测与实证数据的一致性,为理解进化辐射的多样化模式提供数据支持。

文件详解

  • README_for_ibm.txt:文本格式,提供模拟模型的运行说明,包括编译、文件放置及执行步骤。
  • SM_Costa-SysBio_2018_SysBio.pdf:PDF格式,可能包含研究的补充材料或详细方法说明。
  • input.in:输入文件格式,包含模拟初始化参数,如世代数(T)、初始种群大小(M)、晶格大小(L1、L2)、突变率(mut)、扩散概率(diff)等。
  • ibm.f90:Fortran源代码文件,为空间显式个体模型(IBM)的实现代码。

适用场景

  • 进化生物学研究:分析系统发育树结构与物种形成过程(同域/邻域)的关联机制。
  • 计算生物学建模:验证空间显式模型在模拟微进化过程中的有效性。
  • 生物信息学分析:探究基因组大小、基因流限制对系统发育树多样化模式的影响。
  • 实证数据对比:将模型预测结果与真实进化辐射案例进行一致性验证。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.17 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。