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基因流动下的物种定义研究数据集
2025年12月20日 30 192 18
数据集概述 本数据集围绕“基因流动存在时如何定义物种”这一核心问题展开研究，通过多物种溯祖模型分析基因流动对种内与种间遗传差异的影响，揭示了特定条件下种内遗传相似性低于种间的现象，强调少量基因流动对物种遗传历史的显著作用。 文件详解 文件名称: 2020JiaoDefineSpeciesGeneFlow-SI.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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系统发育模式中的微进化过程特征数据集
2025年12月12日 30 88 15
数据集概述 该数据集围绕系统发育树中的微进化过程特征展开，通过空间显式模型模拟同域与邻域物种形成，分析系统发育树的结构属性（如树平衡度、多样化速度）与物种形成过程的关联，验证模型预测与实证数据的一致性，为理解进化辐射的多样化模式提供数据支持。 文件详解...
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基因流对物种树估计影响的模拟研究数据集
2025年12月11日 30 3 0
数据集概述 该数据集基于模拟研究，探究基因流与不完全谱系分选对物种树估计的影响。通过模拟不同模型、规模、时间尺度和迁移率下的多基因座序列数据，分析贝叶斯方法及汇总统计方法对物种树拓扑结构、种群大小和分化时间的估计误差，为系统发育研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: Supplemental Materials.pdf 文件格式: PDF...
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宿主_寄生虫协同进化速度与基因组足迹数据集
2025年12月10日 30 194 76
数据集概述 本数据集围绕宿主与寄生虫协同进化动力学展开研究，对比“堑壕战”与“军备竞赛”两种极端场景下的进化特征，通过有限种群模型和溯祖模拟分析基因组足迹差异，为理解协同进化的分子机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: stochastic-cstPopSize-GFG-Tellier.r 文件格式: R语言脚本文件（.r） 内容说明:...
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重组对物种树分析影响研究数据集
2025年12月8日 30 40 0
数据集概述 本数据集围绕系统发育学中重组对物种树分析的影响展开，探讨种内重组作为基因树与物种树不一致的潜在来源，分析其对不同物种树方法（如合并法）的干扰及与物种形成历史要素的相互作用。 文件详解 文件名称: species_trees.nex：NEX格式文件，可能包含用于物种树分析的系统发育数据，如基因序列或树结构信息。 文件名称:...
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分子物种界定方法比较数据集
2025年12月7日 30 140 30
数据集概述 本数据集围绕不同物种形成场景下分子物种界定方法的性能比较展开，通过模拟生成的合成数据及实际案例（熊和蜜蜂），分析GMYC、PTP、BPP三种方法的表现差异，探讨影响方法性能的关键因素。 文件详解 数据文件（.xlsx格式，共7个）： supplementary appendix 11.xlsx、supplementary appendix...
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PHRAPL系统地理学推断方法数据集
2025年12月7日 30 81 35
数据集概述 该数据集围绕PHRAPL方法展开，PHRAPL是一种基于近似似然法的系统地理学推断工具，可分析复杂种群历史，识别基因树对应的潜在模型并估算参数。数据集包含方法实现的代码、补充文档、说明网页和图表等资源。 文件详解 Jackson.etal_Data&Scripts.zip：压缩文件，可能包含方法运行所需的原始数据和脚本代码...
